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牛肉质性状候选基因标记效应及其表达特征研究

摘要第1-8页
ABSTRACT第8-15页
第一章 文献综述第15-29页
   ·引言第15页
   ·中国部份肉牛品种的经济特性与分布第15-17页
   ·钙蛋白酶家族第17-22页
     ·钙激活酶基因(CAPN1)研究进展第17-20页
     ·钙蛋白酶3 基因(CAPN3)研究进展第20-21页
     ·钙激活蛋白酶抑制蛋白(CAST)基因研究进展第21-22页
   ·钙激活酶激活因子(HRSP12)基因研究进展第22-23页
   ·小窝蛋白(CAVEOLIN)系统第23-26页
     ·小窝蛋白 1(CAV1)的研究进展第24-25页
     ·小窝蛋白 3(CAV3)的研究进展第25-26页
   ·CACNA2D1 基因研究进展第26-27页
     ·CACNA2D1 基因结构与生理功能第26-27页
     ·CACNA2D1 基因多态性与肉质性状的相关性研究第27页
   ·本研究的目的与意义第27-29页
第二章 材料与方法第29-45页
   ·材料第29页
     ·血样第29页
     ·组织样品第29页
     ·试验牛数据第29页
   ·主要仪器设备、试剂及配制方法第29-32页
     ·主要仪器设备第29-30页
     ·试剂盒、酶等主要试剂第30-31页
     ·试剂配制第31-32页
   ·试验方法与步骤第32-45页
     ·RNA 的提取和检测第32-33页
     ·血液DNA 的提取和检测第33-34页
     ·引物设计第34-39页
     ·PCR 体系、条件及其多态性检测方法第39-42页
     ·扩增片断的回收、克隆、测序第42-43页
     ·cDNA 克隆序列的鉴定及生物信息学分析第43页
     ·数据统计分析第43-45页
第三章 CDNA 克隆及生物信息学分析第45-53页
   ·总RNA 提取结果第45页
   ·CAV1 基因 cDNA 克隆及生 物信息学分析第45-49页
     ·CAV1 基因cDNA 的克隆第45页
     ·CAV1 基因cDNA 序列分析第45-46页
     ·CAV1 基因cDNA 所推导的蛋白质特性第46-49页
   ·CAV3 基因 cDNA 克隆及生物信息学分析第49-53页
     ·CAV3 基因cDNA 的克隆第49页
     ·CAV3 基因cDNA 序列分析第49-50页
     ·CAV3 基因cDNA 所推导的蛋白质特性第50-53页
第四章 基因多态性检测及遗传效应分析第53-93页
   ·DNA 提取结果第53页
   ·牛CAPN1 基因的遗传变异与肉质和胴体组成性状的关联分析第53-64页
     ·CAPN1 基因StuⅠ、AgeⅠ、MaeⅡ位点多态性与肉质性状关联分析第53-59页
     ·牛CAPN1 基因SSCP 多态性与肉质性状的关联分析第59-64页
   ·牛CAPN3 基因的遗传变异与肉质和胴体组成性状的关联分析第64-68页
     ·PCR 扩增产物及酶切结果第65页
     ·CAPN3 基因TaqⅠ位点的基因型频率、基因频率第65-66页
     ·CAPN3 基因 TaqⅠ位点在群体中的遗传特性第66页
     ·CAPN3 基因TaqⅠ位点的多态性与肉质和胴体组成性状的关联分析第66-68页
   ·牛HRSP12 基因遗传变异与肉质和胴体组成性状的关联分析第68-71页
     ·PCR 扩增产物及酶切结果第68页
     ·HRSP12 基因BsrⅠ位点的基因型频率、基因频率第68-69页
     ·HRSP12 基因 BsrⅠ位点在群体中的遗传特性第69-70页
     ·HRSP12 基因BsrⅠ位点的多态性与肉质和胴体组成性状的关联分析第70-71页
   ·牛CAST 基因的遗传变异与肉质和胴体组成性状的关联分析第71-73页
     ·PCR 扩增产物及酶切结果第71页
     ·CASTα基因座的基因型频率、基因频率第71-72页
     ·CASTα基因座在群体中的遗传特性第72页
     ·CAST 基因座多态性与肉质和胴体组成性状的关联分析第72-73页
   ·牛CAV1 基因遗传变异与肉质和胴体组成性状的关联分析第73-86页
     ·CAV1 基因PCR 扩增产物及酶切结果第74-75页
     ·CAV1 基因 5 个酶切位点的基因型频率、基因频率第75-79页
     ·基因座位在群体中的遗传特性第79-82页
     ·CAV1 基因多态性与肉质和胴体组成性状的关联分析第82-86页
   ·牛CAV3 基因的遗传变异与肉质和胴体组成性状的关联分析第86-89页
     ·CAV3 基因PCR 扩增产物及酶切结果第87页
     ·CAV3α基因座的基因型频率、基因频率第87-88页
     ·CAV3α基因座位在群体中的遗传特性第88页
     ·CAV3α基因座多态性与肉质和胴体组成性状的关联分析第88-89页
   ·牛 CACNA2D1 基因的遗传变异与肉质和胴体组成性状的关联分析第89-93页
     ·CACNA2D1 基因PCR 扩增产物及酶切结果第90页
     ·CACNA2D1 基因HaeIII 位点的基因型频率、基因频率第90页
     ·CACNA2D1 基因HaeIII 位点在群体中的遗传特性第90-91页
     ·CACNA2D1 基因HaeIII 位点多态性与肉质和胴体组成性状的关联分析第91-93页
第五章 实时荧光定量PCR 检测第93-97页
   ·管家基因、目的基因的标准曲线和溶解曲线第93-94页
   ·牛 4 个基因在不同时期各组织中的表达第94-97页
     ·牛CAPN1 基因在不同时期各组织中的表达第94-95页
     ·牛CAPN3 基因在不同时期各组织中的表达第95页
     ·牛CAV1 基因在不同时期各组织中的表达第95-96页
     ·牛CAV3 基因在不同时期各组织中的表达第96-97页
第六章 讨论与结论第97-107页
   ·关于总RNA 的提取第97页
   ·生物信息学在核酸序列分析中的应用第97-99页
     ·关于牛CAV1 基因功能的预测第98页
     ·关于牛CAV3 基因功能的预测第98-99页
   ·关于SNPs 的筛查第99页
   ·关于基因型与性状的关联分析第99-103页
     ·CAPN1 基因多态性与肉质性状的关联分析第100页
     ·CAPN3 基因多态性与肉质性状的关联分析第100-101页
     ·CAST 基因多态性与肉质性状的关联分析第101页
     ·HRSP12 基因多态性与肉质性状的关联分析第101-102页
     ·CAV1 基因多态性与肉质性状的关联分析第102页
     ·CAV3 基因多态性与肉质性状的关联分析第102-103页
     ·CACNA2D1 基因多态性与肉质性状的关联分析第103页
   ·关于实时荧光定量PCR 检测结果第103-104页
     ·CAPN1 和CAPN3 基因在不同时期9 种组织中的表达量第103-104页
     ·CAV1 和CAV3 基因在不同时期9 种组织中的表达量第104页
   ·结论第104-107页
     ·主要研究结果第104-106页
     ·创新点第106-107页
参考文献第107-116页
缩略语表第116-117页
致谢第117-118页
作者简介第118页

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