| 摘要 | 第3-6页 |
| ABSTRACT | 第6-9页 |
| 第一章 绪论 | 第13-24页 |
| 1.1 抗生素类药物的分类 | 第13-15页 |
| 1.2 抗生素的使用状况 | 第15-16页 |
| 1.3 水环境中抗生素耐药基因污染 | 第16-24页 |
| 1.3.1 抗生素耐药基因的种类 | 第16-18页 |
| 1.3.2 细菌对抗生素的耐药机制 | 第18-19页 |
| 1.3.3 水环境中抗生素耐药基因主要来源及其污染现状 | 第19-21页 |
| 1.3.4 抗生素耐药基因的研究方法 | 第21-22页 |
| 1.3.5 环境中ARGs的传播及其公共健康风险 | 第22-24页 |
| 第二章 长江口及近海区域四环素类和磺胺类耐药基因的水平与分布特征 | 第24-40页 |
| 前言 | 第24-25页 |
| 2.1 材料与方法 | 第25-32页 |
| 2.1.1 仪器与试剂 | 第25-26页 |
| 2.1.2 样品的采集 | 第26页 |
| 2.1.3 沉积物中抗生素的萃取 | 第26-27页 |
| 2.1.4 抗生素的分析方法 | 第27-29页 |
| 2.1.5 沉积物样品中DNA的提取 | 第29页 |
| 2.1.6 普通PCR分析检测抗生素耐药基因 | 第29-30页 |
| 2.1.7 重组T质粒的构建 | 第30页 |
| 2.1.8 重组质粒的转化 | 第30页 |
| 2.1.9 阳性克隆的筛选与鉴定 | 第30页 |
| 2.1.10 重组质粒的提取与序列的测定 | 第30-31页 |
| 2.1.11 抗生素耐药基因的qPCR定量分析 | 第31-32页 |
| 2.2 结果与讨论 | 第32-38页 |
| 2.2.1 长江口及近海区域沉积物中抗生素耐药基因和int1基因的水平 | 第32-33页 |
| 2.2.2 长江口及近海区域沉积物中抗生素耐药基因和int1基因的空间分布 | 第33-35页 |
| 2.2.3 长江口及近海区域沉积物中抗生素耐药基因与int1基因的关系 | 第35-38页 |
| 2.2.4 临床致病菌与环境中四环素和磺胺类抗生素耐药比较分析 | 第38页 |
| 2.3 小结 | 第38-40页 |
| 第三章 宏基因组方法比较分析深海和珠江口沉积物中抗生素耐药基因的特征 | 第40-49页 |
| 3.1 材料与方法 | 第40-42页 |
| 3.1.1 样品采集 | 第40-41页 |
| 3.1.2 沉积物中基因组提取和高通量测序 | 第41页 |
| 3.1.3 生物信息学分析 | 第41-42页 |
| 3.2 结果与讨论 | 第42-47页 |
| 3.2.1 西太平洋和珠江口沉积物中细菌群落结构 | 第42页 |
| 3.2.2 西太平洋和珠江口沉积物中抗生素耐药基因的丰度和耐药性特征 | 第42-45页 |
| 3.2.3 西太平洋和珠江口沉积物中质粒基因丰度和抗生素耐药基因的水平传播 | 第45-46页 |
| 3.2.4 河口环境中抗生素耐药基因组与临床病原菌耐药特征的关系 | 第46-47页 |
| 3.3 小结 | 第47-49页 |
| 第四章 结论 | 第49页 |
| 本人在论文中的贡献 | 第49-50页 |
| 创新性、不足与展望 | 第50-51页 |
| 参考文献 | 第51-70页 |
| 与本课题相关已发表的论文 | 第70-71页 |
| 致谢 | 第71-72页 |
