| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-11页 |
| 缩略词表 | 第12-13页 |
| 1 文献综述 | 第13-29页 |
| 1.1 棉花色素腺体和棉酚 | 第13-15页 |
| 1.1.1 棉花色素腺体性状 | 第13页 |
| 1.1.2 棉酚的特性 | 第13-14页 |
| 1.1.3 色素腺体与棉酚的关系 | 第14页 |
| 1.1.4 色素腺体研究的重要性 | 第14-15页 |
| 1.2 色素腺体性状的遗传研究 | 第15-17页 |
| 1.2.1 色素腺体相关的控制基因 | 第15-16页 |
| 1.2.2 色素腺体相关的复等位基因 | 第16-17页 |
| 1.3 显性无腺体基因Gl_2~e的研究 | 第17-18页 |
| 1.3.1 Gl_2~e基因的发现与遗传分析 | 第17-18页 |
| 1.3.2 Gl_2~e基因的研究进展 | 第18页 |
| 1.4 棉酚生物合成途径及相关基因的研究 | 第18-21页 |
| 1.4.1 棉酚的生物合成途径 | 第18-19页 |
| 1.4.2 棉酚生物合成途径中主要基因的研究 | 第19-21页 |
| 1.5 色素腺体相关材料的组学研究 | 第21-22页 |
| 1.6 低酚棉育种进展 | 第22-24页 |
| 1.7 植物MYC转录因子研究进展 | 第24-27页 |
| 1.7.1 MYC1的研究 | 第25页 |
| 1.7.2 MYC2的研究 | 第25-27页 |
| 1.7.3 MYC3和MYC4的研究 | 第27页 |
| 1.8 研究目的与意义 | 第27-29页 |
| 2 材料与方法 | 第29-47页 |
| 2.1 实验仪器 | 第29页 |
| 2.2 实验材料 | 第29页 |
| 2.3 候选基因的确定 | 第29-30页 |
| 2.4 候选基因序列分析 | 第30-36页 |
| 2.4.1 RNA的提取 | 第30-31页 |
| 2.4.2 反转录cDNA | 第31页 |
| 2.4.3 候选基因的扩增 | 第31-32页 |
| 2.4.4 扩增产物的纯化 | 第32页 |
| 2.4.5 TA克隆 | 第32-33页 |
| 2.4.6 转化 | 第33-34页 |
| 2.4.7 重组子检测与测序分析 | 第34-36页 |
| 2.5 基因表达量分析 | 第36-37页 |
| 2.5.1 RNA提取与反转录 | 第36页 |
| 2.5.2 荧光定量PCR（qRT-PCR） | 第36-37页 |
| 2.6 启动子分析 | 第37-39页 |
| 2.6.1 棉花DNA提取 | 第37-38页 |
| 2.6.2 启动子序列和顺式作用元件分析 | 第38页 |
| 2.6.3 启动子甲基化分析 | 第38-39页 |
| 2.7 亚细胞定位 | 第39-40页 |
| 2.7.1 Gl_2~e基因融合表达载体构建 | 第39-40页 |
| 2.7.2 冻融法转化农杆菌LBA4404 | 第40页 |
| 2.7.3 洋葱表皮细胞瞬时表达 | 第40页 |
| 2.8 酵母中转录激活活性分析 | 第40-42页 |
| 2.8.1 酵母表达载体构建 | 第40-41页 |
| 2.8.2 酵母感受态的制备 | 第41页 |
| 2.8.3 PEG/LiAc法转化酵母 | 第41-42页 |
| 2.9 病毒诱导的基因沉默（VIGS） | 第42-43页 |
| 2.9.1 病毒表达载体构建 | 第42页 |
| 2.9.2 VIGS实验 | 第42-43页 |
| 2.10 棉花的遗传转化 | 第43页 |
| 2.11 小RNA测序与数据分析 | 第43-46页 |
| 2.11.1 RNA样品制备 | 第43-44页 |
| 2.11.2 Total RNA质量检测与文库构建 | 第44页 |
| 2.11.3 测序数据预处理 | 第44页 |
| 2.11.4 已知miRNA分析 | 第44-45页 |
| 2.11.5 新miRNA预测 | 第45页 |
| 2.11.6 miRNA差异表达分析 | 第45页 |
| 2.11.7 miRNA靶基因预测与功能富集分析 | 第45-46页 |
| 2.11.8 miRNA及靶基因的qRT-PCR验证 | 第46页 |
| 2.12 亚洲棉、雷蒙德氏棉和陆地棉中MYC蛋白的鉴定与分析 | 第46-47页 |
| 3 结果与分析 | 第47-68页 |
| 3.1 Gl_2~e基因的图位克隆与候选基因分析 | 第47-49页 |
| 3.1.1 Gl_2~e基因的精细定位与候选基因确认 | 第47-48页 |
| 3.1.2 GhMYC2基因序列分析 | 第48-49页 |
| 3.1.3 GhMYC2基因表达分析 | 第49页 |
| 3.2 GhMYC2基因启动子分析 | 第49-50页 |
| 3.2.1 启动子序列分析 | 第49-50页 |
| 3.2.2 启动子顺式作用元件分析 | 第50页 |
| 3.2.3 启动子甲基化分析 | 第50页 |
| 3.3 GhMYC2转录因子亚细胞定位 | 第50-51页 |
| 3.4 GhMYC2转录因子激活活性分析 | 第51-53页 |
| 3.4.1 转录激活活性验证 | 第51-52页 |
| 3.4.2 转录激活活性区分析 | 第52-53页 |
| 3.5 GhMYC2转录因子功能验证 | 第53-56页 |
| 3.5.1 病毒诱导的基因沉默 | 第53-54页 |
| 3.5.2 棉花的遗传转化 | 第54-56页 |
| 3.6 腺体相关材料miRNA分析 | 第56-66页 |
| 3.6.1 小RNA测序数据统计 | 第56-57页 |
| 3.6.2 已知miRNA和新的miRNA分析 | 第57-58页 |
| 3.6.3 差异表达miRNA分析 | 第58-59页 |
| 3.6.4 差异表达miRNA靶基因预测 | 第59-60页 |
| 3.6.5 差异表达miRNA的靶基因GO和KEGG分析 | 第60-64页 |
| 3.6.6 miRNA和靶基因的表达量验证 | 第64-66页 |
| 3.7 棉花MYC蛋白的鉴定与进化分析 | 第66-68页 |
| 4 结论与讨论 | 第68-74页 |
| 4.1 Gl_2~e候选基因的确定 | 第68页 |
| 4.2 GhMYC2基因的表达 | 第68-69页 |
| 4.3 GhMYC2基因的功能验证 | 第69页 |
| 4.4 GhMYC2作用机制推测 | 第69-70页 |
| 4.5 GhMYC2基因在低酚棉育种中的应用 | 第70-71页 |
| 4.6 腺体相关材料小RNA分析 | 第71-72页 |
| 4.7 小RNA靶基因分析 | 第72页 |
| 4.8 研究展望 | 第72-73页 |
| 4.9 全文结论 | 第73-74页 |
| 参考文献 | 第74-87页 |
| 致谢 | 第87-88页 |
| 附录 | 第88-102页 |
