| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 缩略词 | 第7-11页 |
| 第一章 前言 | 第11-22页 |
| 1.0 引言 | 第11-12页 |
| 1.1 马铃薯病毒的概况 | 第12页 |
| 1.2 马铃薯Y病毒简介 | 第12-13页 |
| 1.3 PTNRD的研究进展 | 第13-16页 |
| 1.3.1 马铃薯坏死环斑病的简介 | 第13-14页 |
| 1.3.2 引致PTNRD的PVY株系及其分子特征 | 第14-15页 |
| 1.3.3 PTNRD的鉴定方法及其防治 | 第15-16页 |
| 1.4 基因筛选 | 第16-18页 |
| 1.4.1 高通量测序技术的简介 | 第16-17页 |
| 1.4.2 测序数据分析 | 第17-18页 |
| 1.5 细胞坏死生物学过程 | 第18-20页 |
| 1.5.1 细胞自噬生物学过程 | 第18-19页 |
| 1.5.2 细胞程序性死亡的生物学过程 | 第19-20页 |
| 1.5.3 细胞超敏反应的生物学过程 | 第20页 |
| 1.5.4 细胞抗病毒反应的生物学过程 | 第20页 |
| 1.6 本课题研究目的及意义 | 第20-22页 |
| 第二章 实验材料与方法 | 第22-39页 |
| 2.1 实验材料、仪器与试剂 | 第22-24页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第22页 |
| 2.1.2 主要实验仪器 | 第22-23页 |
| 2.1.3 主要试剂 | 第23页 |
| 2.1.4 常用溶液和抽提溶液的配置 | 第23-24页 |
| 2.2 马铃薯常见病毒的特异性引物 | 第24-25页 |
| 2.3 马铃薯病毒的初步鉴定 | 第25-28页 |
| 2.3.1 症状观察 | 第25页 |
| 2.3.2 样本PVY、PVS等病毒的常规RT-PCR鉴定 | 第25-28页 |
| 2.4 第二代转录组高通量测序差异基因 | 第28-30页 |
| 2.4.1 植物材料 | 第28页 |
| 2.4.2 测序的实验流程 | 第28页 |
| 2.4.3 差异表达基因筛选 | 第28-30页 |
| 2.5 目标基因在马铃薯感染PVY后的差异表达情况研究 | 第30-39页 |
| 2.5.1 马铃薯总RNA的提取 | 第30-31页 |
| 2.5.2 总RNA完整性的检测 | 第31页 |
| 2.5.3 总RNA浓度及纯度的检测 | 第31页 |
| 2.5.4 cDNA反转录反应 | 第31-32页 |
| 2.5.5 引物设计 | 第32-33页 |
| 2.5.6 目的DNA片段的胶回收 | 第33-34页 |
| 2.5.7 连接及转化 | 第34页 |
| 2.5.8 菌落PCR | 第34-36页 |
| 2.5.9 重组质粒提取 | 第36-37页 |
| 2.5.10重组质粒PCR鉴定 | 第37页 |
| 2.5.11序列测定与分析 | 第37页 |
| 2.5.12 RT-qPCR检测检测目标基因的差异表达情况 | 第37-39页 |
| 第三章 结果与分析 | 第39-64页 |
| 3.1 马铃薯样本的采集及带毒情况监测 | 第39-43页 |
| 3.1.1 马铃薯样本的采集及症状观察 | 第39页 |
| 3.1.2 各马铃薯样本携带病毒情况调查 | 第39-43页 |
| 3.2 目标基因的筛选 | 第43-44页 |
| 3.3 目标基因mRNA片段的克隆与序列测定 | 第44-49页 |
| 3.3.1 目标基因mRNA片段的RT-PCR扩增 | 第44页 |
| 3.3.2 序列测定与分析 | 第44-49页 |
| 3.4 RT-qPCR的检测各目标基因的差异表达情况—相对定量法 | 第49-58页 |
| 3.4.1 luminal-binding protein 5-like的相对定量结果 | 第49-50页 |
| 3.4.2 pathogenesis-related protein P2的相对定量结果 | 第50-52页 |
| 3.4.3 MLP-like protein 34-like的相对定量结果 | 第52-53页 |
| 3.4.4 ehylene-responsive transcription factor RAP23like的相对定量结果 | 第53-54页 |
| 3.4.5 cytochrome P45071A1-like的相对定量结果 | 第54-55页 |
| 3.4.6 probable WRKY transcription factor 40-like的相对定量结果 | 第55-57页 |
| 3.4.7 马铃薯自噬相关基因Atg8的相对定量结果 | 第57-58页 |
| 3.5 相关基因编码蛋白的结构分析 | 第58-64页 |
| 3.5.1 RAP2-3 基因编码蛋白的物理性质 | 第58-61页 |
| 3.5.2 PR-P2的物理性质 | 第61-64页 |
| 第四章 讨论 | 第64-68页 |
| 4.1 马铃薯样本的鉴定 | 第64页 |
| 4.2 坏死相关基因RT-qPCR检测的分析 | 第64-66页 |
| 4.3 相关性高的基因编码蛋白的结构分析 | 第66-68页 |
| 第五章 结论 | 第68-69页 |
| 参考文献 | 第69-77页 |
| 致谢 | 第77-78页 |
| 个人简历 | 第78页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第78页 |
