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高产油微藻基于基因组的初级代谢网络重构和代谢流分析

摘要第3-4页
Abstract第4-5页
主要符号对照表第9-11页
第1章 引言第11-30页
    1.1 微藻生物柴油概述第11-18页
        1.1.1 生物柴油第11-12页
        1.1.2 微藻生物产油的优势第12-13页
        1.1.3 微藻生物柴油的生产流程第13-17页
        1.1.4 原始小球藻生产生物柴油研究进展第17-18页
    1.2 微藻代谢组学研究进展第18-21页
        1.2.1 代谢组学简介第18-20页
        1.2.2 代谢组学在微藻研究中的应用第20-21页
    1.3 微藻代谢网络重构研究进展第21-24页
        1.3.1 代谢网络重构简介第21-23页
        1.3.2 已完成代谢网络重构的藻类第23-24页
    1.4 微藻基于~(13)C标记的代谢流分析研究进展第24-28页
        1.4.1 同位体稳态标记第25-26页
        1.4.2 同位体非稳态标记第26-28页
    1.5 论文研究思路第28-30页
        1.5.1 立题依据和意义第28页
        1.5.2 研究内容第28-29页
        1.5.3 研究路线第29-30页
第2章 自养和异养原始小球藻的代谢组分析第30-50页
    2.1 本章引言第30页
    2.2 材料与方法第30-37页
        2.2.1 化学试剂第30页
        2.2.2 藻种与培养第30-32页
        2.2.3 生长监测第32页
        2.2.4 代谢物提取第32页
        2.2.5 LC-MS测定第32-34页
        2.2.6 胞内代谢物浓度的绝对定量第34-37页
        2.2.7 自养转异养的代谢轮廓分析第37页
    2.3 结果第37-49页
        2.3.1 基于LC-MS的原始小球藻代谢物测定方法的建立第37-40页
        2.3.2 自养和异养原始小球藻的代谢组第40-46页
        2.3.3 原始小球藻自养转异养过程的代谢轮廓分析第46-49页
    2.4 讨论第49页
    2.5 本章小结第49-50页
第3章 原始小球藻中心碳代谢网络重构第50-70页
    3.1 本章引言第50页
    3.2 材料与方法第50-57页
        3.2.1 藻种与培养第50页
        3.2.3 生长监测第50-51页
        3.2.4 生物质组成测定第51-54页
        3.2.5 原始小球藻初级代谢网络重构第54-56页
        3.2.6 原始小球藻的生长模拟第56-57页
    3.3 结果第57-67页
        3.3.1 原始小球藻的初级代谢网络第57-59页
        3.3.2 自养和异养原始小球藻的生物质组成第59-64页
        3.3.3 自养和异养条件下原始小球藻的生长模拟第64-65页
        3.3.4 自养和异养条件下原始小球藻的PhPP分析第65-67页
    3.4 讨论第67-68页
        3.4.1 基于基因组的原始小球藻代谢网络建模第67-68页
        3.4.2 FBA目标函数的选择第68页
    3.5 本章小结第68-70页
第4章 原始小球藻的同位体非稳态代谢流分析第70-84页
    4.1 本章引言第70页
    4.2 材料与方法第70-72页
        4.2.1 藻种与培养第70页
        4.2.2 ~(13)C标记实验第70-71页
        4.2.3 代谢物提取第71页
        4.2.4 LC-MS测定第71页
        4.2.5 基于动态同位体分布的代谢流分析第71-72页
        4.2.6 辅因子平衡分析第72页
    4.3 结果第72-81页
        4.3.1 自养原始小球藻标记系统的建立第72-74页
        4.3.2 自养和异养原始小球藻的动态标记第74-77页
        4.3.3 自养和异养原始小球藻的非稳态代谢流分析第77-80页
        4.3.4 辅因子平衡分析第80-81页
    4.4 讨论第81-83页
        4.4.1 同位体非稳态动态流分析结果与FBA结果比较第81-83页
        4.4.2 INST-MFA与稳态代谢流分析的比较第83页
    4.5 本章小结第83-84页
第5章 原始小球藻氮代谢的动态流分析第84-95页
    5.1 本章引言第84-85页
    5.2 材料与方法第85-88页
        5.2.1 藻种与培养第85页
        5.2.2 培养基中氮含量测定第85页
        5.2.3 ~(15N)标记实验第85页
        5.2.4 代谢物提取第85页
        5.2.5 LC-MS测定第85页
        5.2.6 原始小球藻的动态流分析第85-88页
    5.3 结果第88-93页
        5.3.1 原始小球藻氮同化途径中间代谢物的动态标记第88-89页
        5.3.2 自养与异养原始小球藻不同的氮同化途径第89-92页
        5.3.3 由转氨反应直接生成的其他氨基酸的代谢通量第92-93页
    5.4 讨论第93-94页
        5.4.1 原始小球藻不同营养条件下氮同化途径的选择第93-94页
        5.4.2 KFP测定结果与FBA模拟值的比较第94页
    5.5 本章小结第94-95页
第6章 讨论与展望第95-100页
    6.1 讨论第95-96页
    6.2 结论第96-97页
    6.3 本研究创新点第97页
    6.4 展望第97-100页
参考文献第100-113页
附录第113-173页
致谢第173-175页
个人简历、在学期间发表的学术论文与研究成果第175页

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