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禾谷镰刀菌中retromer复合体的功能初探

摘要第1-9页
Abstract第9-10页
第一章 前言第10-18页
 1 禾谷镰刀菌的研究概况第10-13页
   ·禾谷镰刀菌的基本特征第10-11页
   ·禾谷镰刀菌产生的毒素第11-12页
   ·禾谷镰刀菌基因组学的研究第12-13页
 2 Retromer 复合体第13-17页
   ·Retromer 复合体在不同物种中的组成与结构特征第13-15页
     ·酿酒酵母中的retromer 复合体第13-14页
     ·模式植物拟南芥中的retromer 复合体第14页
     ·哺乳动物中的retromer 复合体第14-15页
   ·Retromer 复合体在不同物种中的功能研究第15-17页
     ·酵母中retromer 复合体的功能第15-16页
     ·模式植物拟南芥中retromer 复合体的功能第16页
     ·哺乳动物中retromer 复合体的功能第16-17页
 3 本研究的目的和意义第17-18页
第二章 材料与方法第18-34页
 1 实验材料第18-19页
   ·供试菌株第18页
   ·致病性鉴定材料第18页
   ·常用培养基第18页
   ·抗生素第18-19页
   ·常用生化试剂第19页
 2 实验方法第19-34页
   ·禾谷镰刀菌retromer 复合体的生物信息学分析第19-20页
     ·禾谷镰刀菌retromer 复合体各亚基及其结合受体蛋白的获得第19页
     ·禾谷镰刀菌retromer 复合体各亚基的结构域预测第19页
     ·禾谷镰刀菌retromer 复合体各亚基氨基酸序列的同源性比较第19页
     ·七种真菌中retromer 复合体各亚基同源蛋白的系统进化关系分析第19-20页
   ·基因敲除策略第20页
   ·引物设计与PCR 扩增反应第20-21页
   ·PCR 产物的纯化第21页
   ·TA 克隆第21页
   ·Escherichia coli DH5α 感受态细胞的制备及转化第21-22页
   ·质粒DNA 的提取第22-23页
   ·质粒的酶切与连接第23页
   ·禾谷镰刀菌目的基因敲除载体的构建第23-24页
   ·禾谷镰刀菌Vps35-GFP 绿色荧光融合互补载体的构建第24-26页
   ·禾谷镰刀菌Vps26-RFP 红色荧光融合互补载体的构建第26-27页
   ·禾谷镰刀菌原生质体的制备第27页
   ·禾谷镰刀菌原生质体转化第27页
   ·禾谷镰刀菌基因组DNA 的快速提取第27-28页
   ·禾谷镰刀菌KO 突变体的初步筛选与鉴定第28页
   ·CTAB 法提取禾谷镰刀菌基因组DNA第28-29页
   ·Southern Blot第29-31页
     ·探针标记与效价第29-30页
     ·DNA 转印第30页
     ·杂交过程第30页
     ·显色过程第30-31页
     ·DNA 的二次杂交第31页
   ·禾谷镰刀菌菌丝体total RNA 的提取及检测第31页
   ·反转录PCR(RT-PCR)第31-32页
   ·禾谷镰刀菌菌落生长速度测定第32页
   ·禾谷镰刀菌产孢量测定第32页
   ·禾谷镰刀菌孢子萌发率测定第32页
   ·禾谷镰刀菌有性交配鉴定第32-33页
   ·小麦麦穗室内离体单花注射接种鉴定致病性第33页
   ·小麦胚芽鞘接种鉴定致病性第33-34页
第三章 结果与分析第34-50页
 1 生物信息学结果及分析第34-37页
   ·禾谷镰刀菌retromer 复合体各亚基及其结合受体蛋白的获得第34页
   ·禾谷镰刀菌retromer 复合体各亚基的结构域分析第34-35页
   ·禾谷镰刀菌retromer 复合体各亚基氨基酸序列的同源性比较第35-36页
   ·七种真菌中retromer 复合体各亚基同源蛋白的系统进化关系第36-37页
 2 禾谷镰刀菌retromer 复合体各亚基及其受体蛋白的功能分析第37-50页
   ·禾谷镰刀菌retromer 复合体各亚基KO 突变体的筛选与鉴定第37-39页
     ·禾谷镰刀菌VPS35 基因KO 突变体的筛选与鉴定第37-38页
       ·PCR 扩增初筛第37页
       ·Southern blot 验证第37页
       ·RT-PCR(反转录PCR)验证第37-38页
     ·禾谷镰刀菌retromer 复合体其它4 个亚基KO 突变体的筛选第38-39页
   ·禾谷镰刀菌retromer 复合体各亚基KO 突变体的表型分析第39-45页
     ·Retromer 复合体各亚基的KO 突变体对菌丝营养生长的影响第39-40页
     ·Retromer 复合体各亚基的KO 突变体对分生孢子的影响第40-42页
     ·Retromer 复合体各亚基的KO 突变体对有性生殖的影响第42-44页
     ·Retromer 复合体各亚基的KO 突变体对致病性的影响第44-45页
   ·禾谷镰刀菌Vps10 受体蛋白KO 突变体的筛选与表型分析第45-46页
   ·禾谷镰刀菌VPS35 和VPS26 荧光融合互补菌株的筛选及表型分析第46-48页
     ·VPS35 KO 突变体GFP-融合互补菌株的筛选及表型分析第47-48页
     ·VPS26 KO 突变体RFP-融合互补菌株的筛选及表型分析第48页
   ·禾谷镰刀菌Vps35 蛋白在不同时间段的细胞定位观察第48-50页
第四章 结论与讨论第50-53页
 1 结论与讨论第50-52页
 2 后续研究第52-53页
参考文献第53-61页
附录第61-63页
致谢第63页

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