| 摘要 | 第10-12页 |
| Abstract | 第12-14页 |
| 第一章 绪论 | 第15-27页 |
| 1.1 冰川前缘概述 | 第15-17页 |
| 1.1.1 冰川前缘区域研究现状 | 第15-16页 |
| 1.1.2 Midtre Lovenbreen冰川及其冰川前缘概述 | 第16-17页 |
| 1.2 冰川前缘微生物群落结构研究现状 | 第17-21页 |
| 1.2.1 冰川前缘微生物研究意义 | 第17页 |
| 1.2.2 冰川前缘微生物群落结构研究现状 | 第17-21页 |
| 1.2.3 冰川前缘微生物研究存在的问题 | 第21页 |
| 1.3 极地微生物生态功能概述 | 第21-26页 |
| 1.3.1 极地冰川微生物生态功能 | 第22-23页 |
| 1.3.2 极地冻土微生物生态功能 | 第23-24页 |
| 1.3.3 极地水环境微生物生态功能 | 第24-25页 |
| 1.3.4 极地微生物生态功能研究存在的问题 | 第25-26页 |
| 1.4 本研究的目的及意义 | 第26-27页 |
| 第二章 材料与方法 | 第27-48页 |
| 2.1 实验材料 | 第27-31页 |
| 2.1.1 土壤样品采集 | 第27页 |
| 2.1.2 实验菌株 | 第27-28页 |
| 2.1.3 主要培养基 | 第28页 |
| 2.1.4 主要试剂 | 第28-30页 |
| 2.1.5 主要仪器 | 第30-31页 |
| 2.2 实验方法 | 第31-48页 |
| 2.2.1 土壤元素及pH分析 | 第31页 |
| 2.2.2 冰川前缘样品中磷脂脂肪酸的提取、测定和分析 | 第31-33页 |
| 2.2.3 土壤微生物总DNA提取及宏基因组测序 | 第33-34页 |
| 2.2.4 细菌16S rRNA基因V6片段扩增与测序 | 第34-35页 |
| 2.2.4.1 细菌16S rRNA基因V6片段扩增 | 第34页 |
| 2.2.4.2 PCR产物测序及生物信息分析 | 第34-35页 |
| 2.2.5 古菌16S rRNA基因片段扩增与测序 | 第35页 |
| 2.2.5.1 古菌16S rRNA基因片段扩增 | 第35页 |
| 2.2.5.2 PCR产物测序及生物信息分析 | 第35页 |
| 2.2.6 真菌ITS序列扩增与测序 | 第35-36页 |
| 2.2.6.1 真菌ITS序列扩增 | 第35-36页 |
| 2.2.6.2 PCR产物测序及生物信息分析 | 第36页 |
| 2.2.7 病毒宏基因组测序及生物信息分析 | 第36-38页 |
| 2.2.7.1 冰川前缘样品病毒核酸提取及PCR | 第36-37页 |
| 2.2.7.2 PCR产物测序及生物信息分析 | 第37-38页 |
| 2.2.8 冰川前缘样品细菌分离与多相分类学研究 | 第38-44页 |
| 2.2.8.1 冰川前缘样品细菌的分离纯化 | 第38页 |
| 2.2.8.2 分离菌株的形态观察及保藏 | 第38-39页 |
| 2.2.8.3 生长条件检测 | 第39页 |
| 2.2.8.4 生理生化特性检测 | 第39-41页 |
| 2.2.8.5 化学分类特征检测 | 第41-43页 |
| 2.2.8.6 遗传特性分析 | 第43-44页 |
| 2.2.9 菌株内含物特性研究 | 第44-48页 |
| 2.2.9.1 菌株PHB检测 | 第44页 |
| 2.2.9.2 菌株PHB含量测定 | 第44-45页 |
| 2.2.9.3 菌株多磷酸颗粒鉴定 | 第45页 |
| 2.2.9.4 菌株吸收与释放磷元素量检测 | 第45页 |
| 2.2.9.5 细菌全基因组测序及分析 | 第45-46页 |
| 2.2.9.6 相关基因定量PCR检测 | 第46-48页 |
| 第三章 MLB冰川前缘微生物群落结构演替研究 | 第48-78页 |
| 3.1 引言 | 第48-53页 |
| 3.1.1 采样点介绍 | 第48-52页 |
| 3.1.2 研究方法简介 | 第52-53页 |
| 3.2 MLB冰川前缘可培养细菌多样性研究 | 第53-59页 |
| 3.2.1 可培养细菌数量统计 | 第53-55页 |
| 3.2.2 可培养细菌多样性研究 | 第55-59页 |
| 3.3 MLB冰川前缘磷脂脂肪酸(PLFA)研究 | 第59-61页 |
| 3.3.1 MLB冰川前缘微生物生物量的研究 | 第59页 |
| 3.3.2 MLB冰川前缘微生物群落结构研究 | 第59-61页 |
| 3.4 基于高通量测序的MLB冰川前缘微生物群落演替研究 | 第61-77页 |
| 3.4.1 MLB冰川前缘细菌群落演替研究 | 第61-66页 |
| 3.4.2 MLB冰川前缘病毒群落演替研究 | 第66-69页 |
| 3.4.3 MLB冰川前缘古菌群落演替研究 | 第69-71页 |
| 3.4.4 MLB冰川前缘真菌群落演替研究 | 第71-74页 |
| 3.4.5 MLB冰川前缘微生物多样性分析 | 第74-77页 |
| 3.5 本章小结 | 第77-78页 |
| 第四章 MLB冰川前缘微生物功能研究 | 第78-100页 |
| 4.1 基于宏基因组的高通量测序及生物信息分析 | 第78-83页 |
| 4.2 MLB冰川前缘微生物与元素生物地球化学循环的关系 | 第83-96页 |
| 4.2.1 MLB冰川前缘元素信息 | 第83-84页 |
| 4.2.2 MLB冰川前缘微生物与碳元素循环的关系 | 第84-90页 |
| 4.2.3 MLB冰川前缘微生物与氮元素循环的关系 | 第90-95页 |
| 4.2.4 MLB冰川前缘微生物与其它元素循环的关系 | 第95-96页 |
| 4.3 MLB冰川前缘水平基因转移研究 | 第96-99页 |
| 4.3.1 接合作用介导的水平基因转移 | 第96-97页 |
| 4.3.2 转座介导的水平基因转移 | 第97-98页 |
| 4.3.3 GTA介导的水平基因转移 | 第98-99页 |
| 4.4 本章小结 | 第99-100页 |
| 第五章 三株潜在新分类单元的多相分类学研究 | 第100-141页 |
| 5.1 菌株R3-20~T多相分类学及其聚磷特性研究 | 第100-120页 |
| 5.1.1 基因型特性 | 第100-103页 |
| 5.1.1.1 16S rRNA基因序列分析及构建进化树 | 第100-102页 |
| 5.1.1.2 DNA G+C mol%含量测定 | 第102-103页 |
| 5.1.2 表型特征 | 第103-106页 |
| 5.1.3 化学分类特性 | 第106-109页 |
| 5.1.4 菌株R3-20~T多相分类结果讨论 | 第109-110页 |
| 5.1.5 菌株R3-20~T内含物特性研究 | 第110-115页 |
| 5.1.5.1 菌株R3-20~T胞内PHB的检测 | 第111-112页 |
| 5.1.5.2 菌株R3-20~T胞内多磷酸颗粒(poly P)的检测 | 第112-113页 |
| 5.1.5.3 菌株R3-20~T多磷酸颗粒含量检测 | 第113-114页 |
| 5.1.5.4 菌株R3-20~TPHB含量检测 | 第114-115页 |
| 5.1.6 全基因组测序数据分析及相关基因定量PCR | 第115-119页 |
| 5.1.6.1 全基因组测序数据分析 | 第115-118页 |
| 5.1.6.2 相关基因定量PCR | 第118-119页 |
| 5.1.7 小结 | 第119-120页 |
| 5.2 菌株R2-4~T多相分类学研究 | 第120-131页 |
| 5.2.1 遗传特征 | 第120-123页 |
| 5.2.1.1 菌株R2-4~T的16S rRNA基因扩增与进化树构建 | 第120-123页 |
| 5.2.1.2 基因组DNA G+C mol%含量测定 | 第123页 |
| 5.2.2 表型特征 | 第123-126页 |
| 5.2.3 化学分类特性 | 第126-129页 |
| 5.2.4 讨论 | 第129-131页 |
| 5.3 菌株R2-35~T多相分类学研究 | 第131-140页 |
| 5.3.1 遗传特征 | 第131-133页 |
| 5.3.1.1 菌株R2-35~T的16S rRNA基因扩增与进化树构建 | 第131-133页 |
| 5.3.1.2 基因组DNA G+C mol%含量测定 | 第133页 |
| 5.3.2 表型特征 | 第133-135页 |
| 5.3.3 化学特征 | 第135-138页 |
| 5.3.4 讨论 | 第138-140页 |
| 5.4 本章小结 | 第140-141页 |
| 第六章 总结 | 第141-143页 |
| 参考文献 | 第143-157页 |
| 攻读博士学位期间发表论文情况 | 第157-160页 |
| 附录 | 第160-180页 |
| 致谢 | 第180页 |
