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基于叶绿体基因组序列的小麦族系统发育分析

符号说明第4-7页
中文摘要第7-9页
ABSTRACT第9-10页
1 引言第11-27页
    1.1 小麦族概述第11-16页
        1.1.1 小麦族的分类第11-14页
        1.1.2 小麦族物种的起源与进化第14-16页
    1.2 叶绿体基因组学研究第16-23页
        1.2.1 叶绿体基因组研究现状第16-18页
        1.2.2 叶绿体基因组结构及特点第18-22页
        1.2.3 叶绿体基因组测序第22-23页
    1.3 系统发育分析第23-27页
        1.3.1 系统发育分析的推断方法第24-25页
        1.3.2 系统发育分析常用软件第25-26页
        1.3.3 叶绿体基因组的系统发育分析第26-27页
    1.4 研究的目的和意义第27页
2 材料与方法第27-35页
    2.1 试验材料第27-29页
    2.2 试验方法第29-35页
        2.2.1 叶绿体DNA的提取第29-31页
        2.2.2 叶绿体DNA的检测第31-32页
        2.2.3 叶绿体DNA的测序、拼接和组装第32-34页
        2.2.4 SSR标记和串联重复序列的检测第34页
        2.2.5 叶绿体基因组差异热点区检测第34页
        2.2.6 小麦族叶绿体基因组结构分析第34页
        2.2.7 进化树构建和分化时间第34-35页
3 结果与分析第35-56页
    3.1 叶绿体DNA提取、含量测定、PCR检测结果第35-37页
        3.1.1 叶绿体DNA提取和含量测定第35-36页
        3.1.2 叶绿体DNA的PCR检测第36-37页
    3.2 叶绿体基因组的测序、拼接组装和注释作图第37-43页
        3.2.1 叶绿体基因组的测序第37页
        3.2.2 叶绿体基因组的拼接组装和注释作图第37-43页
    3.3 SSR标记开发和重复序列检测第43-46页
    3.4 叶绿体基因组差异热点区检测第46-48页
    3.5 叶绿体基因组结构分析第48-52页
    3.6 系统发育分析第52-54页
    3.7 分化时间分析第54-56页
4 讨论第56-58页
    4.1 叶绿体基因组的拼接组装第56页
    4.2 小麦族系统发育分析分析第56-57页
    4.3 小麦族分化时间分析第57-58页
5 结论第58-60页
参考文献第60-67页
致谢第67-68页
攻读学位期间发表论文情况第68页

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