摘要 | 第4-6页 |
Abstract | 第6-7页 |
1、文献综述 | 第10-17页 |
1.1 转座子 | 第10-11页 |
1.2 转座子分类 | 第11-13页 |
1.2.1 DNA类转座子的转座事件 | 第11-12页 |
1.2.2 RNA类转座子的转座事件 | 第12-13页 |
1.3 转座子的作用与功能 | 第13-14页 |
1.3.1 转座子影响基因组大小 | 第13页 |
1.3.2 转座子影响染色体结构和功能 | 第13-14页 |
1.3.3 转座子影响基因结构和功能 | 第14页 |
1.4 转座子促使植物适应环境和表型变异 | 第14-15页 |
1.5 关联分析 | 第15-17页 |
1.5.1 关联分析原理及其优势 | 第15页 |
1.5.2 关联分析在植物中的应用 | 第15-17页 |
2、研究目的与意义 | 第17-18页 |
3、材料与方法 | 第18-23页 |
3.1 材料 | 第18页 |
3.2 试验方法 | 第18-23页 |
3.2.1 玉米农艺性状的测定与统计分析 | 第18-19页 |
3.2.2 基因型数据来源 | 第19页 |
3.2.3 转座子插入位点的筛选 | 第19页 |
3.2.4 基因组DNA的提取 | 第19-20页 |
3.2.5 引物设计及转座子扩增 | 第20-21页 |
3.2.6 转座子插入情况的统计分析 | 第21页 |
3.2.7 转座子及邻近SNP与农艺性状的关联分析 | 第21-22页 |
3.2.8 转座子与基因表达量的关联分析 | 第22页 |
3.2.9 邻近基因的功能初探 | 第22-23页 |
4、结果 | 第23-47页 |
4.1 农艺性状的一般性统计分析 | 第23-24页 |
4.2 转座子插入位点的筛选与特征分析 | 第24-26页 |
4.3 转座子在不同类型玉米中的插入验证 | 第26-32页 |
4.3.1 转座子在预测玉米自交系中的PCR验证 | 第26-27页 |
4.3.2 DMT-4-225713639转座子在不同类型玉米中插入情况 | 第27-30页 |
4.3.3 DTM-2-4101264转座子在不同类型玉米中插入情况 | 第30-32页 |
4.4 DTM-4-225713639转座子插入与玉米农艺性状关联分析 | 第32-35页 |
4.5 DTM-4-225713639转座子邻近SNP关联分析 | 第35-38页 |
4.6 DTM-4-225713639转座子插入与基因表达量的关联分析 | 第38页 |
4.7 DTM-4-225713639转座子影响邻近基因的表达 | 第38-41页 |
4.8 邻近基因功能分析 | 第41-47页 |
4.8.1 蛋白质结构域分析 | 第41-42页 |
4.8.2 启动子上转录因子结合元件分析 | 第42-47页 |
5、讨论 | 第47-52页 |
5.1 转座子在温、热带玉米中的插入偏好性 | 第47-48页 |
5.2 转座子插入影响邻近基因的表达 | 第48页 |
5.3 转座子插入与玉米环境适应性紧密相关 | 第48-50页 |
5.4 转座子插入响应环境胁迫 | 第50-52页 |
参考文献 | 第52-57页 |
致谢 | 第57-58页 |
附表 | 第58-72页 |
学术论文 | 第72页 |