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鸭肠炎病毒UL13蛋白激酶活性与核定位特性研究

本论文的创新性工作第3-4页
摘要第4-7页
ABSTRACT第7-10页
英文缩写词汇第11-19页
第一部分 引言第19-27页
    1 疱疹病毒简介第19页
    2 鸭肠炎病毒研究概况第19-21页
        2.1 鸭肠炎病毒分类第19-20页
        2.2 鸭肠炎病毒毒粒结构第20页
        2.3 鸭肠炎病毒基因组结构第20页
        2.4 鸭肠炎病毒编码蛋白第20-21页
        2.5 鸭肠炎病毒的复制第21页
    3 疱疹病毒保守性蛋白激酶研究进展第21-26页
        3.1 疱疹病毒保守性蛋白激酶简介第21-22页
        3.2 疱疹病毒保守性蛋白激酶功能第22-26页
            3.2.1 自磷酸化及皮层装配第22页
            3.2.2 磷酸化EF-1δ第22-23页
            3.2.3 核衣壳出核第23页
            3.2.4 病毒复制第23-24页
            3.2.5 逃避干扰素反应第24-25页
            3.2.6 磷酸化病毒皮层及囊膜蛋白第25-26页
            3.2.7 磷酸化GCV第26页
    4 选题目的及意义第26-27页
第二部分 试验研究第27-171页
    第一章 鸭肠炎病毒CHV株UL13基因生物信息学分析第27-46页
        1 试验材料第27-29页
            1.1 毒株、菌株及载体第27页
            1.2 材料与试剂第27-28页
                1.2.1 试验材料第27页
                1.2.2 试验试剂第27-28页
            1.3 主要试剂的配制第28页
                1.3.1 制备鸭胚成纤维细胞相关溶液第28页
                1.3.2 DNA提取、细菌培养、琼脂糖电泳相关试剂第28页
            1.4 仪器设备第28-29页
        2 试验方法第29-32页
            2.1 鸭肠炎病毒UL13基因克隆第29-31页
                2.1.1 DEV基因组DNA的提取第29页
                2.1.2 PCR扩增鸭肠炎病毒UL13基因第29-30页
                2.1.3 UL13基因的克隆第30-31页
                2.1.4 pET32c-UL13重组质粒鉴定第31页
            2.2 DEV UL13基因核苷酸序列分子特性分析第31-32页
                2.2.1 开放性阅读框搜索及分子特性分析第31页
                2.2.2 DEVUL13基因密码子偏嗜性分析第31-32页
            2.3 DEVUL13基因编码蛋白的分子特性分析第32页
                2.3.1 DEVUL13基因ORF翻译及肽链基本特性分析第32页
                2.3.2 DEVUL13蛋白理化性质分析第32页
                2.3.3 DEVUL13编码蛋白的二级结构预测第32页
                2.3.4 DEVUL13编码蛋白的三级结构预测第32页
                2.3.5 DEVUL13编码蛋白酶活性中心分析第32页
        3 试验结果第32-43页
            3.1 DEVUL13基因分子克隆第33页
            3.2 DEVUL13基因核苷酸序列分子特性分析第33-36页
                3.2.1 开放性阅读框搜索及分子特性分析第33-34页
                3.2.2 DEVUL13基因密码子偏嗜性分析第34-36页
            3.3 DEV UL13基因编码蛋白的分子特性分析第36-43页
                3.3.1 DEVUL13基因ORF翻译及肽链基本特性分析第36-37页
                3.3.2 DEVUL13蛋白理化性质分析第37-41页
                3.3.3 DEVUL13编码蛋白的二级结构预测第41-42页
                3.3.4 DEVUL13编码蛋白的三级结构预测第42页
                3.3.5 DEVUL13编码蛋白与疱疹病毒家族成员各CHPK序列比对第42-43页
        4 讨论第43-46页
            4.1 DEVUL13基因特性分析第43页
            4.2 DEVUL13基因编码蛋白的特性分析第43-46页
    第二章 鸭肠炎病毒UL13基因克隆、原核表达及多克隆抗体制备第46-61页
        1 试验材料第46-47页
            1.1 毒株、菌株及载体第46页
            1.2 材料与试剂第46-47页
                1.2.1 试验材料第46页
                1.2.2 试验试剂第46-47页
            1.3 主要试剂的配制第47页
            1.4 仪器设备第47页
        2 试验方法第47-51页
            2.1 鸭肠炎病毒UL13基因截段克隆、原核表达及纯化第47-50页
                2.1.1 DEVUL13基因截段克隆第47-49页
                2.1.2 DEVUL13截段蛋白诱导表达第49页
                2.1.3 DEVUL13截段蛋白表达条件的优化第49页
                2.1.4 DEVUL13截段重组蛋白的大量制备第49页
                2.1.5 鸭肠炎病毒UL13截段重组蛋白的纯化第49-50页
                2.1.6 鸭肠炎病毒UL13截段重组蛋白的透析复性第50页
            2.2 抗鸭肠炎病毒UL13蛋白多克隆抗体制备第50-51页
                2.2.1 鸭肠炎病毒UL13截段重组蛋白作为抗原免疫动物第50-51页
                2.2.2 DEVUL13多克隆抗体的粗提第51页
                2.2.3 Western-blot分析DEVUL13蛋白的反应原性及所制备血清的特异性第51页
        3 实验结果第51-59页
            3.1 鸭肠炎病毒UL13基因截段克隆、原核表达及纯化第51-57页
                3.1.1 鸭肠炎病毒UL13截段基因的扩增、克隆与鉴定结果第51-53页
                3.1.2 鸭肠炎病毒UL13截段蛋白的原核诱导表达第53-54页
                3.1.3 UL13截段重组蛋白表达条件的优化第54-56页
                3.1.4 鸭肠炎病毒UL13截段蛋白的纯化第56-57页
            3.2 抗鸭肠炎病毒UL13蛋白多克隆抗体制备第57-59页
                3.2.1 兔抗UL13截段重组蛋白多克隆抗体的制备及其免疫原性测定第57-58页
                3.2.2 鸭肠炎病毒UL13截段蛋白与DEV抗血清的反应原性分析第58页
                3.2.3 兔抗鸭肠炎病毒UL13截段蛋白血清特异性分析第58-59页
        4 讨论第59-61页
            4.1 DEVUL13截段重组蛋白原核表达第59-60页
            4.2 DEVUL13截段重组蛋白多克隆抗体的制备第60-61页
    第三章 鸭肠炎病毒UL13基因类型及转录、表达分析第61-75页
        1 试验材料第61-62页
            1.1 毒株、菌株及引物第61页
            1.2 材料与试剂第61-62页
                1.2.1 试验材料第61页
                1.2.2 试验试剂第61-62页
            1.3 主要试剂的配制第62页
            1.4 仪器设备第62页
        2 试验方法第62-66页
            2.1 鸭肠炎病毒UL13基因类型分析第62-64页
                2.1.1 鸭胚成纤维细胞的培养第62页
                2.1.2 药物抑制试验第62-63页
                2.1.3 样品RNA提取和cDNA合成第63页
                2.1.4 样品的检测第63-64页
            2.2 实时荧光定量PCR法(RT-PCR)检测鸭肠炎病毒体外感染宿主细胞UL13基因转录时相分析第64-66页
                2.2.1 实时荧光定量PCR引物特异性检测及PCR反应体系优化第64-65页
                2.2.2 RNA提取和cDNA合成第65页
                2.2.3 样品的定量检测第65页
                2.2.4 统计分析第65-66页
            2.3 WESTERN-BLOT法检测鸭肠炎病毒体外感染宿主细胞UL13蛋白的表达时相分析第66页
                2.3.1 鸭胚成纤维细胞的培养和病毒感染第66页
                2.3.2 DEVUL13蛋白表达时相分析第66页
        3 实验结果第66-72页
            3.1 鸭肠炎病毒UL13基因类型分析第66-68页
                3.1.1 RNA纯度及完整性检测第66-67页
                3.1.2 药物抑制试验判定UL13基因类型第67-68页
            3.2 DEV体外感染DEF细胞中UL13基因转录时相分析第68-72页
                3.2.1 引物特异性检测第68-69页
                3.2.2 标准曲线绘制第69-70页
                3.2.3 UL13基因转录时相分析第70-72页
            3.3 UL13蛋白的表达时相分析第72页
        4 讨论第72-75页
    第四章 鸭肠炎病毒UL13蛋白激酶活性研究第75-119页
        1 试验材料第75-78页
            1.1 毒株、菌株、引物、载体及细胞第75-76页
            1.2 材料与试剂第76-77页
                1.2.1 试验材料第76页
                1.2.2 试验试剂第76-77页
            1.3 主要试剂的配制第77-78页
                1.3.1 重组杆状病毒感染性克隆构建所用试剂第77页
                1.3.2 间接免疫荧光分析(IFA)试验所用试剂第77页
                1.3.3 Red重组及空斑试验相关溶液第77页
                1.3.4 体内磷酸化试验所用试剂第77-78页
            1.4 仪器设备第78页
        2 试验方法第78-91页
            2.1 DEV UL13蛋白激酶体外酶活测定第78-84页
                2.1.1 DEV UL13蛋白体外真核表达及纯化第78-81页
                2.1.2 DEV ΔUL13(K179M)蛋白体外真核表达及纯化第81-82页
                2.1.3 DEV UL13及ΔUL13(K179M)自磷酸化活性测定第82-83页
                2.1.4 DEV UL13蛋白激酶潜在底物的表达与纯化第83页
                2.1.5 DEV UL13及ΔUL13(K179M)蛋白体外磷酸化外源底物活性测定第83-84页
            2.2 DEV UL13及ΔUL13(K179M)蛋白激酶体内酶活测定第84-91页
                2.2.1 DEV CHv-BACΔUL13(K179M)重组毒的构建第84-88页
                2.2.2 CHv-BACΔUL13(K179M)R重组毒的构建第88-89页
                2.2.3 RFLP分析第89页
                2.2.4 重组鸭肠炎病毒CHv-BACΔUL13(K179M)及CHv-BACΔUL13(K179M)R体外细胞培养特性研究第89-90页
                2.2.5 兔抗DEV UL13蛋白激酶潜在底物蛋白抗体的粗提第90页
                2.2.6 重组鸭肠炎病毒UL13蛋白体内激酶活性分析第90-91页
        3 实验结果第91-114页
            3.1 DEV UL13蛋白激酶体外酶活测定第91-105页
                3.1.1 DEV UL13及ΔUL13(K179M)蛋白真核表达体系的构建第91-100页
                3.1.2 DEV UL13蛋白激酶体外酶活测定第100-105页
            3.2 UL13蛋白体内激酶活性分析第105-114页
                3.2.1 DEV CHv-BACΔUL13(K179M)及DEV CHv-BACΔUL13(K179M)R重组毒的构建第105-109页
                3.2.2 RFLP分析第109-110页
                3.2.3 空斑试验第110-111页
                3.2.4 生长曲线分析第111-112页
                3.2.5 体内激酶活性分析第112-114页
        4 讨论第114-119页
            4.1 DEV UL13及DEVΔUL13(K179M)蛋白的真核表达及酶活测定第114-116页
            4.2 DEVCHv-BACΔUL13(K179M)及DEV CHv-BACΔUL13(K179M)R重组毒构建及特性研究第116-119页
    第五章 鸭肠炎病毒UL13基因编码蛋白的定位研究第119-159页
        1 试验材料第119-123页
            1.1 毒株、菌株、引物及载体第119-123页
            1.2 材料与试剂第123页
            1.3 主要试剂的配制第123页
            1.4 仪器设备第123页
        2 试验方法第123-135页
            2.1 DEV UL13蛋白在细胞内的定位及定位信号分析第123-131页
                2.1.1 DEV UL13基因编码蛋白在体外培养的感染细胞中的定位分析第123-124页
                2.1.2 DEV UL13蛋白核定位信号的确定第124-128页
                2.1.3 DEV UL13蛋白入核机制的初探第128-129页
                2.1.4 DEV UL13蛋白核输出信号功能判定第129-131页
            2.2 DEVUL13蛋白入核的功能初探第131-135页
                2.2.1 DEV CHv-BAC UL13-ΔNLS重组毒的构建第131-134页
                2.2.2 RFLP分析第134页
                2.2.3 重组鸭肠炎病毒CHv-BACUL13-ΔNLS体外细胞培养特性研究第134页
                2.2.4 DEV UL13-ANLS蛋白激酶活性分析第134-135页
        3 实验结果第135-155页
            3.1 DEV UL13蛋白在细胞内的定位及定位信号分析第135-147页
                3.1.1 DEV UL13基因编码蛋白在体外培养的感染细胞中的定位分析第135-136页
                3.1.2 DEV UL13蛋白入核信号确定第136-143页
                3.1.3 鸭肠炎病毒UL13蛋白入核机制初步判定第143-145页
                3.1.4 DEV UL13蛋白核输出信号功能判定第145-147页
            3.2 DEV UL13蛋白入核的功能初探第147-155页
                3.2.1 CHv-BAC UL13-ΔNLS重组毒的构建第148-151页
                3.2.2 RFLP分析第151-152页
                3.2.3 DEV CHv-BAC UL13-ANLS体外细胞培养特性分析第152-154页
                3.2.4 UL13-ΔNLS蛋白体内激酶活性探索第154-155页
        4 讨论第155-159页
            4.1 DEV UL13蛋白在细胞内的定位及定位信号分析第155-157页
            4.2 DEV UL13蛋白不入核对病毒生理活动的影响第157-159页
    第六章 鸭肠炎病毒UL13缺失重组毒构建及体外生物学特性研究第159-171页
        1 试验材料第159-160页
            1.1 毒株、菌株、引物第159页
            1.2 材料与试剂第159-160页
            1.3 仪器设备第160页
        2 试验方法第160-161页
            2.1 CHv-BACAUL13-1/ΔUL13-2重组毒的构建第160-161页
                2.1.1 CHv-BACAUL13-1/ΔUL13-2感染性克隆的构建第160页
                2.1.2 CHv-BACAUL13/AUL13-1/ΔUL13-2重组毒的拯救第160-161页
            2.2 RFLP分析第161页
            2.3 重组鸭肠炎病毒CHv-BACΔUL13/ΔUL13-1/ΔUL13-2细胞生物学特性研究第161页
        3 试验结果第161-167页
            3.1 DEV CHv-BACΔUL13-1和DEV CHv-BACΔUL13-2重组毒的构建第161-164页
                3.1.1 CHv-BACΔUL13-1和DEV CHv-BACΔUL13-2感染性克隆的构建第161-163页
                3.1.2 DEV CHv-BACΔUL13、DEV CHv-BACΔUL13-1及DEV CHv-BACΔUL13-2重组毒拯救及鉴定第163-164页
            3.2 RFLP分析第164-165页
            3.3 DEV CHv-BACΔUL13、DEV CHv-BACΔUL13-1及DEV CHv-BACΔUL13-2体外细胞培养特性分析第165-167页
                3.3.1 空斑试验第165-166页
                3.3.2 生长曲线分析第166-167页
        4 讨论第167-171页
全文总结第171-172页
参考文献第172-182页
致谢第182-183页
作者简介第183页

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