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实时可视化PMA-LAMP方法检测三种食源性微生物活菌方法研究

致谢第1-7页
摘要第7-9页
Abstract第9-21页
缩略词汇总第21-22页
1 绪论第22-40页
   ·霍乱弧菌第22-26页
     ·霍乱弧菌分类第22-23页
     ·霍乱弧菌的生物学特性第23页
     ·霍乱弧菌的毒理作用和主要毒力因子第23-24页
     ·霍乱弧菌流行病学第24页
     ·霍乱弧菌检测方法研究进展第24-26页
       ·常规检测方法第24-25页
       ·免疫学方法第25页
       ·分子生物学方法第25-26页
   ·副溶血性弧菌第26-29页
     ·副溶血性弧菌生物学特性第26页
     ·副溶血性弧菌的致病机理及相关基因第26-27页
     ·副溶血性弧菌流行病学第27-28页
     ·副溶血性弧菌检测方法现阶段研究进展第28-29页
       ·常规生化方法第28页
       ·免疫学方法第28页
       ·分子生物学方法第28-29页
   ·沙门氏菌第29-32页
     ·沙门氏菌分类第29页
     ·沙门氏菌生物学特性第29页
     ·沙门氏菌毒力因子第29-30页
     ·沙门氏菌流行病学第30页
     ·沙门氏菌检测方法研究进展第30-32页
       ·常规生化方法第30-31页
       ·免疫学方法第31页
       ·分子生物学方法第31-32页
   ·环介导等温扩增技术(LAMP)概述第32-37页
     ·LAMP技术介绍第32-35页
       ·LAMP的原理第32-33页
       ·LAMP引物设计第33页
       ·LAMP技术的特点第33-35页
     ·LAMP反应产物鉴定第35页
     ·基于钙黄绿素染料的实时可视化LAMP技术介绍第35-36页
     ·LAMP技术的应用第36-37页
   ·死活菌检测技术研究进展第37-38页
     ·死活菌检测现状及相关检测方法第37-38页
       ·基于RNA水平的检测第37页
       ·基于DNA结合染料的检测第37-38页
   ·本论文研究内容及意义第38-40页
     ·本论文研究内容第38-39页
     ·本论文研究意义第39-40页
2 食品中霍乱弧菌实时可视化PMA-LAMP方法的建立第40-67页
   ·实验材料第40-43页
     ·菌株第40-41页
     ·仪器设备第41页
     ·主要试剂第41-43页
   ·实验方法第43-51页
     ·样本的制备第43-44页
       ·细菌培养第43页
       ·基因组DNA模板的提取第43-44页
       ·相关菌液的制备第44页
     ·LAMP引物和qPCR引物设计第44页
     ·目的片段的PCR扩增第44-46页
     ·PCR产物回收及纯化第46-47页
     ·标准质粒构建第47-48页
       ·回收纯化的PCR产物与载体连接第47页
       ·转化第47页
       ·菌液PCR初步鉴定第47页
       ·重组质粒测序与同源性比对分析第47-48页
       ·重组质粒提取第48页
     ·实时可视化LAMP体系和qPCR体系的建立第48-49页
       ·qPCR反应体系的建立第48-49页
       ·可视化LAMP反应体系的建立第49页
     ·可视化LAMP反应体系的优化第49-50页
     ·可视化LAMP体系特异性实验及与qPCR体系的比较第50页
     ·可视化LAMP体系灵敏度及与qPCR体系的比较第50页
     ·PMA处理条件优化第50-51页
     ·实时可视化PMA-LAMP体系的灵敏度及与PMA-qPCR体系的比较30第51页
     ·模拟食样实时可视化PMA-LAMP体系与PMA-qPCR体系灵敏度的比较第51页
     ·实际样品检测第51页
   ·结果与分析第51-65页
     ·标准质粒构建与鉴定第51-53页
       ·目的片段电泳鉴定第51-52页
       ·标准质粒测序鉴定第52-53页
     ·霍乱弧菌可视化LAMP体系优化和建立第53-56页
       ·Mg~(2+)终浓度优化第53页
       ·甜菜碱终浓度优化第53-54页
       ·内外引物浓度比优化第54页
       ·钙黄绿素终浓度优化第54-55页
       ·Mn~(2+)终浓度优化第55-56页
     ·霍乱弧菌可视化LAMP和qPCR分析方法特异性比较第56页
     ·霍乱弧菌可视化LAMP和qPCR分析方法灵敏度比较第56-59页
     ·PMA浓度优化第59-60页
       ·PMA浓度范围初步确定第59页
       ·PMA工作浓度优化第59-60页
     ·基质中细胞浓度对PMA处理效果的影响第60-62页
     ·霍乱弧菌实时可视化PMA-LAMP和PMA-qPCR分析方法灵敏度的比较第62页
     ·模拟食样中霍乱弧菌实时可视化PMA-LAMP和PMA-qPCR分析方法灵敏度的比较第62-65页
     ·实时可视化PMA-LAMP检测方法在实际样品中的应用第65页
   ·小结第65-67页
3 食品中副溶血性弧菌实时可视化PMA-LAMP方法的建立第67-83页
   ·材料与方法第67-71页
     ·实验材料第67-69页
       ·菌种第67-68页
       ·仪器设备第68页
       ·主要试剂第68-69页
     ·实验方法第69-71页
       ·样本的制备第69页
       ·副溶血性弧菌LAMP引物和qPCR引物设计第69页
       ·副溶血性弧菌标准质粒的制备第69-70页
       ·实时可视化LAMP体系和qPCR体系的建立第70页
       ·实时可视化LAMP和qPCR特异性和灵敏度分析第70页
       ·PMA浓度优化第70-71页
       ·培养基对PMA处理效果的影响第71页
       ·PMA处理上限第71页
       ·实时可视化PMA-LAMP的灵敏度及与PMA-qPCR的比较第71页
       ·实时可视化PMA-LAMP与PMA-qPCR方法模拟食样实验第71页
       ·实际样品检测第71页
   ·结果与分析第71-81页
     ·标准质粒构建与鉴定第72-73页
       ·目的片段电泳鉴定第72页
       ·标准质粒测序鉴定第72-73页
     ·副溶血性弧菌可视化LAMP和qPCR分析方法特异性比较第73页
     ·副溶血性弧菌可视化LAMP和qPCR分析方法灵敏度比较第73-76页
     ·PMA处理条件优化第76-78页
       ·PMA浓度优化第76-77页
       ·PMA处理菌液浓度上限第77页
       ·不同培养基对PMA处理效果的影响第77-78页
     ·副溶血性弧菌实时可视化PMA-LAMP和PMA-qPCR分析方法灵敏度的比较第78页
     ·模拟食样中副溶血性弧菌实时可视化PMA-LAMP和PMA-qPCR分析方法灵敏度的比较第78-80页
     ·实时可视化PMA-LAMP检测方法在实际样品中的应用第80-81页
   ·小结第81-83页
4 食品中沙门氏菌实时可视化PMA-LAMP方法的建立第83-98页
   ·材料与方法第83-87页
     ·实验材料第83-84页
       ·菌种第83页
       ·仪器设备第83-84页
     ·实验方法第84-87页
       ·样本的制备第84页
       ·沙门氏菌LAMP引物和qPCR引物设计第84-85页
       ·沙门氏菌标准质粒的制备第85页
       ·实时可视化LAMP体系和qPCR体系的建立第85-86页
       ·实时可视化LAMP和qPCR特异性和灵敏度分析第86页
       ·PMA浓度优化第86页
       ·细菌浓度对PMA处理效果的影响第86页
       ·实时可视化PMA-LAMP的灵敏度及与PMA-qPCR的比较第86页
       ·实时可视化PMA-LAMP与PMA-qPCR方法模拟食样实验第86-87页
       ·实际样品检测第87页
   ·结果与分析第87-96页
     ·标准质粒构建与鉴定第87-88页
       ·目的片段电泳鉴定第87页
       ·标准质粒测序鉴定第87-88页
     ·沙门氏菌可视化LAMP和qPCR分析方法特异性比较第88-89页
     ·沙门氏菌可视化LAMP和qPCR分析方法灵敏度比较第89-90页
     ·PMA处理条件优化第90-93页
       ·PMA浓度优化第90-92页
       ·PMA处理菌液浓度上限第92-93页
     ·沙门氏菌实时可视化PMA-LAMP和PMA-qPCR分析方法灵敏度的比较第93-94页
     ·模拟食样中沙门氏菌实时可视化PMA-LAMP和PMA-qPCR分析方法灵敏度的比较第94-95页
     ·实时可视化PMA-LAMP检测方法在实际样品中的应用第95-96页
   ·小结第96-98页
5 讨论第98-100页
   ·LAMP引物设计第98页
   ·实时LAMP的初步探索第98页
   ·样品的前增菌和稀释第98-99页
   ·基因组DNA提取第99页
   ·钙黄绿素染料的注意事项第99-100页
6 总结、创新与展望第100-102页
   ·总结第100-101页
   ·创新点第101页
   ·展望第101-102页
参考文献第102-110页
作者简历第110-111页

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