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HBV自身表达miRNA的验证及功能初探和HBV对肝癌细胞系miRNA表达谱的影响分析

摘要第1-6页
Abstract第6-9页
第一章 :综述第9-23页
 一、引言第9页
 二、乙型肝炎病毒基因组结构第9-12页
 三、miRNA及其产生机制第12-14页
   ·miRNA简介第12页
   ·miRNA编码基因及其产生机制第12-14页
 四、miRNA的作用机制第14-16页
   ·RISC及其成分第14-15页
   ·miRNA抑制靶基因表达的作用方式第15-16页
 五、病毒自身表达miRNA的发现及功能第16-18页
   ·病毒自身表达miRNA的发现第16-17页
   ·病毒miRNA的功能第17-18页
 六、miRNA的表达特性第18页
 七、miRNA的功能及其与肿瘤发生发展的关系第18-21页
   ·miRNA的功能涉及生物体通路的多个方面第18-20页
   ·miRNA作为tumor suppressor或cancer inducer发挥作用第20-21页
 八、miRNA在HCC的发生发展中具有重要作用第21-23页
第二章 : HBV自身表达miRNA的验证及功能研究和HBV对肝癌细胞系miRNA表达谱的影响第23-48页
 一、引言第23-25页
   ·HBV基因组具有表达自身miRNA的序列特征第23-24页
   ·HBV可能影响肝癌细胞系人源miRNA表达谱第24-25页
   ·研究思路第25页
 二、材料和方法第25-34页
   ·主要实验材料第25-29页
     ·细胞系第25-26页
     ·各种功能载体第26-28页
     ·主要试剂/试剂盒第28-29页
     ·其他实验材料第29页
   ·研究方法第29-34页
     ·小RNA SOLiD高通量测序第29页
     ·Northern Blotting验证hbv-miR-BCP的表达第29-30页
     ·克隆测序鉴定hbv-miR-BCP的表达第30页
     ·软件预测miRNA靶基因第30-31页
     ·重组质粒的构建第31-32页
     ·细胞转染第32-33页
     ·双荧光素酶报告系统信号检测与统计处理第33页
     ·qRT-PCR验证人源miRNA表达谱第33-34页
     ·半定量PCR和Westem Blotting检测HepG2中HBx的表达第34页
 三、 结果分析与讨论1——HBV自身表达miRNA的验证和功能研究第34-41页
   ·结果与分析第34-39页
     ·SOLiD测序发现一个由HBVBCP区表达的miRNA—hbv-miR-BCP第34-35页
     ·Northern Blotting证实hbv-miR-BCP的表达第35页
     ·克隆测序验证hbv-miR-BCP的表达第35-37页
     ·miRanda预测得到3个hbv-miR-BCP的候选靶基因第37-38页
     ·成功优化三种质粒共同转染体系第38页
     ·TRADD可能为hbv-miR-BCP的靶基因第38-39页
   ·讨论第39-41页
     ·克隆测序中上游引物的设计第39-40页
     ·hbv-miR-BCP序列3’端游离不定第40页
     ·靶基因预测范围设计第40页
     ·hbv-miR-BCP靶基因与病毒在宿主体内感染与存活的关系第40-41页
 四、 结果分析与讨论2——HBV对肝癌细胞系人源miRNA表达谱的影响分析第41-47页
   ·结果与分析第41-46页
     ·SOLiD测序得到多种差异表达的人源miRNA第41-42页
     ·qRT-PCR验证了10种差异表达的人源miRNA第42页
     ·差异表达的人源miRNA对HCC发展起到一定作用第42-43页
     ·成功构建HBV X基因表达载体第43-44页
     ·RNA半定量显示HBx在HepG2中表达第44-45页
     ·Westem blotting显示HBx在HepG2中存在表达第45页
     ·高表达HBx的HepG2细胞中人源miRNA的表达存在差异第45-46页
   ·讨论第46-47页
     ·在HepG2和HepG2.2.15间差异表达的人源miRNA功能分析第46-47页
     ·HBV X蛋白影响HepG2.2.15中人源miRNA表达谱的可能性分析第47页
 五、结论第47-48页
   ·HBV能够表达自身miRNA—-hbv-miR-BCP,并初步鉴定TRADD可能为其的靶基因第47页
   ·HBV的存在可影响肝癌细胞系中多种人源miRNA的表达第47-48页
附表第48-50页
参考文献第50-60页
致谢第60页

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