| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-12页 |
| 第一章 引言 | 第12-18页 |
| ·新一代测序技术简介及其应用 | 第12-14页 |
| ·结构变异简介以及研究意义 | 第14-15页 |
| ·肺癌简介 | 第15页 |
| ·转录组简介 | 第15-16页 |
| ·结构变异检测方法和肺癌研究现状 | 第16页 |
| ·本论文组织结构 | 第16-18页 |
| 第二章 癌症基因组结构变异检测方法研究 | 第18-32页 |
| ·结构变异检测方法介绍 | 第18-19页 |
| ·检测原理 | 第19-23页 |
| ·Paired reads比对串 | 第19-22页 |
| ·窗口覆盖度 | 第22-23页 |
| ·基于mate-pair reads检测缺失的方法 | 第23-26页 |
| ·检测原理 | 第24-26页 |
| ·生成模拟数据并比较检测结果 | 第26-29页 |
| ·模拟数据 | 第26-27页 |
| ·基于mate-pair reads方法检测结果 | 第27-28页 |
| ·PEMer检测结果 | 第28页 |
| ·BreakDancer检测结果 | 第28-29页 |
| ·基于mate-pair reads检测肝癌结构变异 | 第29-30页 |
| ·肝癌样品简介 | 第29-30页 |
| ·检测结构变异结果 | 第30页 |
| ·检测结构变异方法总结 | 第30-32页 |
| 第三章 肺癌转录组测序数据分析 | 第32-58页 |
| ·RNA-Sequencing技术简介 | 第32-33页 |
| ·肺癌数据分析层面及其意义 | 第33-36页 |
| ·肺癌样品简介 | 第36页 |
| ·样品测序与比对结果 | 第36-38页 |
| ·肺癌样品数据分析流程 | 第38-41页 |
| ·SNP分析流程 | 第38-39页 |
| ·融合基因分析流程 | 第39-41页 |
| ·差异表达基因分析流程 | 第41页 |
| ·可变剪切分析流程 | 第41页 |
| ·信号通路分析流程 | 第41页 |
| ·肺癌样品数据分析结果 | 第41-51页 |
| ·单核苷酸突变位点结果 | 第41-43页 |
| ·等位基因特异性表达结果 | 第43-45页 |
| ·融合基因检测结果 | 第45-47页 |
| ·差异表达基因检测结果 | 第47-50页 |
| ·可变剪切位点检测结果 | 第50-51页 |
| ·信号通路检测结果 | 第51页 |
| ·聚类分析 | 第51-54页 |
| ·肺癌转录组数据分析总结 | 第54-58页 |
| 参考文献 | 第58-62页 |
| 简历 | 第62-64页 |
| 致谢 | 第64-65页 |