基于表达谱和遗传学数据的老年痴呆症（Alzheimers Disease）致病机理的网络分析
| 论文摘要 | 第1-6页 |
| 英文摘要 | 第6-7页 |
| 目录 | 第7-9页 |
| 第一部分：开发网络构建和网络分析工具 | 第9-25页 |
| 摘要 | 第9-10页 |
| Abstract | 第10-11页 |
| 二、引言 | 第11-13页 |
| 三、材料与方法 | 第13-21页 |
| 1. 工具概览 | 第13-14页 |
| 2. 数据来源 | 第14页 |
| 3. 构建数据库 | 第14-15页 |
| ·基因ID转换 | 第14-15页 |
| ·数据表的设计 | 第15页 |
| 4. 开发服务器端 | 第15-19页 |
| ·网络构建算法 | 第16-18页 |
| ·功能富集方法 | 第18-19页 |
| 5. 开发客户端 | 第19-21页 |
| 四、结果 | 第21-23页 |
| 五、讨论 | 第23-25页 |
| 第二部分：AD致病机理的探索 | 第25-51页 |
| 摘要 | 第25-27页 |
| Abstract | 第27-29页 |
| 二、引言 | 第29-31页 |
| 三、材料与方法 | 第31-33页 |
| 1. 实验数据 | 第31页 |
| 2. 寻找差异表达基因 | 第31-33页 |
| ·芯片的预处理 | 第31-32页 |
| ·寻找差异表达基因 | 第32-33页 |
| 四、结果 | 第33-49页 |
| 1. 构建种子基因集 | 第33页 |
| 2. AD参照网络 | 第33-39页 |
| ·构建AD参照网络 | 第33-34页 |
| ·AD参照网络初步分析 | 第34-35页 |
| ·AD背景网络功能模块 | 第35-39页 |
| ·模块划分 | 第35-37页 |
| ·AD六个不同脑区模块被扰动情况分析 | 第37-38页 |
| ·受衰老影响的模块 | 第38-39页 |
| 3. 构建AD功能蛋白质相互作用网络 | 第39-49页 |
| ·功能蛋白质相互作用网络的构建 | 第39-40页 |
| ·KEGG pathway富集 | 第40-44页 |
| ·富集结果 | 第40-42页 |
| ·富集结果的解释 | 第42-44页 |
| ·寻找调控网络的上游转录因子 | 第44-49页 |
| ·转录因子的筛选 | 第45-46页 |
| ·寻找转录因子和AD相关的证据 | 第46-49页 |
| 五、讨论 | 第49-51页 |
| 参考文献 | 第51-57页 |
| 致谢 | 第57页 |
