| 独创性声明 | 第1页 |
| 学位论文版权使用授权书 | 第3-6页 |
| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-26页 |
| ·微生物学传统与现代研究方法回顾 | 第10-13页 |
| ·传统微生物学研究方法 | 第10-12页 |
| ·现代微生物学研究方法 | 第12-13页 |
| ·微生物的多样性及研究现状 | 第13-15页 |
| ·土壤微生物多样性及研究现状 | 第13-14页 |
| ·水环境微生物的多样性及研究现状 | 第14页 |
| ·其它环境中微生物的多样性 | 第14-15页 |
| ·宏基因组学方法在微生物研究上的应用与进展 | 第15-17页 |
| ·宏基因组学概念的提出 | 第15-16页 |
| ·宏基因组学研究方法的分类 | 第16-17页 |
| ·以宏基因组学为基础的微生物生态学研究方法 | 第17-19页 |
| ·交性梯度凝胶电泳(Denaturing Gradient Gel Electrophoresis,DGGE)技术 | 第17-18页 |
| ·PCR特异性扩增技术 | 第18页 |
| ·PCR限制型片段长度多态性分析(PCR-RFLP) | 第18-19页 |
| ·细菌整合子-基因盒系统 | 第19-26页 |
| ·整合子的种类和结构 | 第19-20页 |
| ·基因盒 | 第20-22页 |
| ·基因盒的插入、剪切和表达 | 第22页 |
| ·整合子与细菌基因组进化的关系 | 第22-24页 |
| ·整合子的检测方法 | 第24-26页 |
| 第二章 绪论 | 第26-30页 |
| ·研究目的和意义 | 第26-28页 |
| ·关于家蚕肠道细菌 | 第26-27页 |
| ·关于整合子-基因盒系统 | 第27-28页 |
| ·研究范围和内容 | 第28-30页 |
| ·家蚕肠道细菌群体调查与分析 | 第28-29页 |
| ·以宏基因组学为基础的整合子-基因盒研究初探 | 第29-30页 |
| 第三章 家蚕肠道细菌群体调查与分析 | 第30-40页 |
| ·材料、试剂与设备 | 第30-31页 |
| ·菌株与质粒 | 第30页 |
| ·其它材料及试剂 | 第30-31页 |
| ·分离培养基的制备 | 第31页 |
| ·主要设备 | 第31页 |
| ·主要软件 | 第31页 |
| ·方法 | 第31-33页 |
| ·家蚕肠道微生物总DNA的提取 | 第31-32页 |
| ·16S rRNA基因的PCR扩增 | 第32页 |
| ·PCR产物的纯化 | 第32页 |
| ·16S rDNA文库的构建与筛选 | 第32页 |
| ·阳性克隆子的PCR-RFLP分析 | 第32页 |
| ·测序和分析 | 第32-33页 |
| ·家蚕肠道细菌的分离培养 | 第33页 |
| ·结果与分析 | 第33-37页 |
| ·家蚕肠道微生物总DNA的抽提 | 第33-34页 |
| ·从总DNA中扩增16S rRNA基因及其文库的构建 | 第34页 |
| ·16S rDNA文库的筛选 | 第34页 |
| ·序列比对及系统发育分析 | 第34-35页 |
| ·家蚕肠道细菌的分离培养 | 第35-37页 |
| ·讨论 | 第37-40页 |
| 第四章 以宏基因组学为基础的整合子-基因盒研究初探 | 第40-52页 |
| ·材料和方法 | 第40-41页 |
| ·材料 | 第40-41页 |
| ·方法 | 第41-42页 |
| ·水样中抽提总DNA | 第41页 |
| ·PCR扩增 | 第41页 |
| ·克隆、测序和生物信息学分析 | 第41-42页 |
| ·结果 | 第42-50页 |
| ·水样微生物总DNA的抽提 | 第42页 |
| ·PCR扩增结果 | 第42页 |
| ·重组质粒电泳分析 | 第42-43页 |
| ·DNA序列分析、ORF功能分析 | 第43-50页 |
| ·讨论 | 第50-52页 |
| 第五章 小结与展望 | 第52-56页 |
| ·小结 | 第52-54页 |
| ·家蚕肠道细菌群体调查与分析 | 第52-53页 |
| ·以宏基因组学为基础的整合子-基因盒研究初探 | 第53-54页 |
| ·展望 | 第54-56页 |
| ·关于家蚕肠道细菌群体结构研究 | 第54页 |
| ·关于整合子-基因盒研究 | 第54-56页 |
| 参考文献 | 第56-68页 |
| 附录 发表文章 | 第68-70页 |
| 致谢 | 第70页 |
