前言 | 第1-22页 |
第一章 材料和方法 | 第22-29页 |
1.1 材料 | 第22-24页 |
1.1.1 组织来源: | 第22页 |
1.1.2 主要试剂: | 第22-23页 |
1.1.3 cDNA微阵列GF211: | 第23页 |
1.1.4 试剂盒: | 第23页 |
1.1.5 其他仪器: | 第23页 |
1.1.6 相关软件 | 第23-24页 |
1.2 方法: | 第24-29页 |
1.2.1 切片制备 | 第24页 |
1.2.2 待切割组织片的制备 | 第24页 |
1.2.3 正常鼻咽组织及鼻咽癌组织总RNA提取: | 第24页 |
1.2.4 总RNA中去DNA消化处理: | 第24页 |
1.2.5 探针标记、纯化及变性: | 第24-25页 |
1.2.6 预杂交、杂交、洗膜及显影定影: | 第25页 |
1.2.7 X片扫描,数据均一化(Normalization)及分析: | 第25页 |
1.2.8 GF211微阵列表达谱数据统计学处理,聚类分析 | 第25页 |
1.2.9 基于基因表达改变的频次而构建的鼻咽癌发生发展的树模型: | 第25-26页 |
1.2.10 运用PubGene分析基因芯片表达谱数据: | 第26-29页 |
第二章 实验结果 | 第29-75页 |
2.1 GF211微阵列杂交图及其数据处理 | 第29-39页 |
2.1.1 HE染色后,筛选所得到鼻咽癌标本及部分光镜下的图片 | 第29页 |
2.1.2 成人鼻咽组织、鼻咽癌RNA的提取 | 第29-30页 |
2.1.3 成人鼻咽组织、鼻咽癌RNA的DNase Ⅰ处理及PCR扩增鉴定RNA样品是否存在gDNA污染 | 第30-31页 |
2.1.4 正常鼻咽组织及鼻咽癌组织总RNA标记探针与微阵列GF211杂交的放射自显影图谱 | 第31-33页 |
2.1.5 Pathways4.0软件对放射自显影TIFF图象处理,数据均一化 | 第33-39页 |
2.2 GF211微阵列基因表达谱的建立 | 第39-49页 |
2.2.1 4133个基因建立的全貌(GLOBAL)表达谱 | 第39-43页 |
2.2.2 SAM筛选出来的基因建立的表达谱 | 第43-49页 |
2.3 鼻咽低分化鳞癌的分子分类 | 第49-64页 |
2.3.1 基于4133个基因的表达谱的分类 | 第49-54页 |
2.3.2 基于328个基因的鼻咽癌的分子分类 | 第54-64页 |
2.4 鼻咽癌发生发展的文献表达谱及树模型的构建 | 第64-75页 |
2.4.1 鼻咽癌4133个基因表达的文献网络(Literature network)表达谱 | 第64-67页 |
2.4.2 鼻咽癌发生发展的树模型的构建 | 第67-75页 |
第三章 讨论 | 第75-91页 |
参考文献 | 第91-99页 |
综述一 | 第99-108页 |
综述二 | 第108-122页 |
致谢 | 第122-124页 |
博士学习期间发表的与博士论文课题相关的文章 | 第124页 |