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鼻咽低分化鳞状细胞癌的分子分类

前言第1-22页
第一章 材料和方法第22-29页
 1.1 材料第22-24页
  1.1.1 组织来源:第22页
  1.1.2 主要试剂:第22-23页
  1.1.3 cDNA微阵列GF211:第23页
  1.1.4 试剂盒:第23页
  1.1.5 其他仪器:第23页
  1.1.6 相关软件第23-24页
 1.2 方法:第24-29页
  1.2.1 切片制备第24页
  1.2.2 待切割组织片的制备第24页
  1.2.3 正常鼻咽组织及鼻咽癌组织总RNA提取:第24页
  1.2.4 总RNA中去DNA消化处理:第24页
  1.2.5 探针标记、纯化及变性:第24-25页
  1.2.6 预杂交、杂交、洗膜及显影定影:第25页
  1.2.7 X片扫描,数据均一化(Normalization)及分析:第25页
  1.2.8 GF211微阵列表达谱数据统计学处理,聚类分析第25页
  1.2.9 基于基因表达改变的频次而构建的鼻咽癌发生发展的树模型:第25-26页
  1.2.10 运用PubGene分析基因芯片表达谱数据:第26-29页
第二章 实验结果第29-75页
 2.1 GF211微阵列杂交图及其数据处理第29-39页
  2.1.1 HE染色后,筛选所得到鼻咽癌标本及部分光镜下的图片第29页
  2.1.2 成人鼻咽组织、鼻咽癌RNA的提取第29-30页
  2.1.3 成人鼻咽组织、鼻咽癌RNA的DNase Ⅰ处理及PCR扩增鉴定RNA样品是否存在gDNA污染第30-31页
  2.1.4 正常鼻咽组织及鼻咽癌组织总RNA标记探针与微阵列GF211杂交的放射自显影图谱第31-33页
  2.1.5 Pathways4.0软件对放射自显影TIFF图象处理,数据均一化第33-39页
 2.2 GF211微阵列基因表达谱的建立第39-49页
  2.2.1 4133个基因建立的全貌(GLOBAL)表达谱第39-43页
  2.2.2 SAM筛选出来的基因建立的表达谱第43-49页
 2.3 鼻咽低分化鳞癌的分子分类第49-64页
  2.3.1 基于4133个基因的表达谱的分类第49-54页
  2.3.2 基于328个基因的鼻咽癌的分子分类第54-64页
 2.4 鼻咽癌发生发展的文献表达谱及树模型的构建第64-75页
  2.4.1 鼻咽癌4133个基因表达的文献网络(Literature network)表达谱第64-67页
  2.4.2 鼻咽癌发生发展的树模型的构建第67-75页
第三章 讨论第75-91页
参考文献第91-99页
综述一第99-108页
综述二第108-122页
致谢第122-124页
博士学习期间发表的与博士论文课题相关的文章第124页

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