| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-13页 |
| 第一章 绪论 | 第13-34页 |
| ·耐辐射异常球菌研究进展 | 第13-19页 |
| ·耐辐射异常球菌的分离和分类 | 第13-16页 |
| ·耐辐射异常球菌的特性研究 | 第16-18页 |
| ·耐辐射异常球菌的应用 | 第18-19页 |
| ·耐辐射异常球菌全局性调控蛋白IRRE 的研究进展 | 第19-25页 |
| ·IrrE 蛋白的晶体结构研究 | 第19-21页 |
| ·耐辐射异常球菌irrE 是组成型表达 | 第21-22页 |
| ·IrrE 对耐辐射异常球菌极端辐射抗性的贡献 | 第22-25页 |
| ·细菌耐盐性的研究进展 | 第25-32页 |
| ·功能蛋白在细菌耐盐性中的作用 | 第25-29页 |
| ·转录因子在细菌耐盐性中的作用 | 第29-30页 |
| ·利用转录谱研究细菌耐盐性 | 第30-31页 |
| ·细菌耐盐基因在植物耐盐转基因的应用 | 第31-32页 |
| ·立题依据 | 第32-34页 |
| 第二章 IRRE 提高大肠杆菌的非生物胁迫抗性 | 第34-54页 |
| ·材料与方法 | 第34-43页 |
| ·试验菌株来源 | 第34页 |
| ·培养基、酶类及主要生化试剂 | 第34-35页 |
| ·菌株的培养条件 | 第35页 |
| ·主要仪器 | 第35页 |
| ·细胞的电镜观察 | 第35页 |
| ·大肠杆菌感受态细胞的制备与转化 | 第35-36页 |
| ·基因组DNA、质粒DNA 的提取 | 第36-37页 |
| ·PCR 及引物设计 | 第37页 |
| ·PCR 反应体系及反应条件 | 第37-39页 |
| ·DNA 片段的回收与纯化 | 第39页 |
| ·DNA 片段的酶切反应 | 第39页 |
| ·DNA 片段的连接 | 第39-40页 |
| ·大肠杆菌对非生物胁迫的抗性分析 | 第40-41页 |
| ·高盐胁迫下细胞的生长 | 第41页 |
| ·盐胁迫下大肠杆菌细胞的电镜观察 | 第41-42页 |
| ·M9 限制性培养基中细胞的生长 | 第42页 |
| ·利用Biolog 平板分析菌体的代谢 | 第42-43页 |
| ·结果 | 第43-51页 |
| ·IrrE 表达载体的构建 | 第43-44页 |
| ·IrrE 增强大肠杆菌对非生物逆境的耐受性 | 第44-49页 |
| ·IrrE 促进大肠杆菌在限制性培养中生长 | 第49页 |
| ·IrrE 对大肠杆菌代谢谱的影响 | 第49-51页 |
| ·讨论 | 第51-54页 |
| ·氧化胁迫和UV 辐射抗性 | 第51页 |
| ·高温抗性 | 第51页 |
| ·抗酸性 | 第51-52页 |
| ·抗盐性 | 第52-54页 |
| 第三章 转录谱研究IRRE 对大肠杆菌的全局调控作用 | 第54-86页 |
| ·材料与方法 | 第54-61页 |
| ·试验菌株来源 | 第54页 |
| ·培养基及主要生化试剂 | 第54-56页 |
| ·菌株的生长及处理 | 第56页 |
| ·主要仪器 | 第56页 |
| ·RNA 提取 | 第56-57页 |
| ·RNA 的纯化 | 第57-58页 |
| ·cDNA 的合成与纯化 | 第58-59页 |
| ·cDNA 的片段化 | 第59页 |
| ·cDNA 的末端标记 | 第59-60页 |
| ·芯片杂交 | 第60页 |
| ·洗脱芯片 | 第60-61页 |
| ·扫描芯片 | 第61页 |
| ·结果 | 第61-81页 |
| ·菌体RNA 提取及纯化 | 第61-62页 |
| ·反转录、片段化、探针标记 | 第62页 |
| ·芯片杂交 | 第62-63页 |
| ·芯片数据的收集 | 第63页 |
| ·上调基因（包括小分子RNA）的功能及分类 | 第63-73页 |
| ·下调基因（包括小分子RNA）的功能及分类 | 第73-77页 |
| ·RpoS 依赖型基因的表达 | 第77-80页 |
| ·海藻糖代谢途径相关基因的表达 | 第80页 |
| ·谷氨酸型耐酸系统基因的表达 | 第80-81页 |
| ·讨论 | 第81-86页 |
| ·差异表达基因的功能分类 | 第82页 |
| ·胁迫响应蛋白的转录表达 | 第82-83页 |
| ·大肠杆菌海藻糖代谢途径 | 第83页 |
| ·IrrE 对大肠杆菌耐酸性能的影响 | 第83-84页 |
| ·IrrE 对大肠杆菌RpoS 依赖型基因的影响 | 第84-86页 |
| 第四章 盐冲击下IRRE 对大肠杆菌全局调控的转录谱分析 | 第86-126页 |
| ·材料与方法 | 第86-87页 |
| ·试验菌株来源 | 第86页 |
| ·培养基及主要生化试剂 | 第86页 |
| ·菌株的生长及处理 | 第86页 |
| ·主要仪器 | 第86页 |
| ·RNA 提取 | 第86页 |
| ·RNA 的纯化 | 第86-87页 |
| ·DNA 的合成与纯化 | 第87页 |
| ·cDNA 的片段化 | 第87页 |
| ·cDNA 的末端标记 | 第87页 |
| ·芯片杂交 | 第87页 |
| ·洗脱芯片 | 第87页 |
| ·扫描芯片 | 第87页 |
| ·结果 | 第87-122页 |
| ·菌体RNA 的纯化 | 第87-88页 |
| ·反转录、片段化、探针标记 | 第88页 |
| ·芯片杂交 | 第88页 |
| ·芯片数据的收集及分析 | 第88-89页 |
| ·盐冲击下差异表达上调基因及小分子RNA 的分类 | 第89-111页 |
| ·盐冲击下差异表达下调基因及小分子RNA 的分类 | 第111-119页 |
| ·高盐冲击对甘油有氧降解途径的抑制作用 | 第119页 |
| ·IrrE 促进细胞积累海藻糖的作用 | 第119-120页 |
| ·IrrE 对渗透保护物质转运系统的影响 | 第120页 |
| ·IrrE 对甘氨酸甜菜碱合成的作用 | 第120-121页 |
| ·IrrE 对嘌呤嘧啶合成基因的作用 | 第121-122页 |
| ·IrrE 对鞭毛合成基因的作用 | 第122页 |
| ·讨论 | 第122-126页 |
| ·E. coli 的盐胁迫适应性反应 | 第122-123页 |
| ·海藻糖降解相关基因表达的分析 | 第123-124页 |
| ·甘油降解相关基因表达的分析 | 第124页 |
| ·渗透保护物质转运及合成相关基因表达的分析 | 第124-126页 |
| 第五章 结论 | 第126-128页 |
| 参考文献 | 第128-144页 |
| 致谢 | 第144-145页 |
