山茶科及紫茎属的系统发育和生物地理研究
| 致谢 | 第1-5页 |
| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-14页 |
| 图示索引 | 第14-16页 |
| 表格索引 | 第16-17页 |
| 缩略语 | 第17-19页 |
| 第1章 前言 | 第19-45页 |
| ·系统发育学的研究背景 | 第19-27页 |
| ·系统发育学概念 | 第19页 |
| ·植物基因组简介 | 第19-24页 |
| ·核基因组 | 第20-21页 |
| ·叶绿体基因组 | 第21-23页 |
| ·线粒体基因组 | 第23-24页 |
| ·系统发育树的构建方法 | 第24-26页 |
| ·距离法 | 第24-25页 |
| ·最大简约法 | 第25-26页 |
| ·最大似然法 | 第26页 |
| ·系统发育树的评估 | 第26-27页 |
| ·间断分布的研究背景 | 第27-31页 |
| ·山茶科的研究背景 | 第31-39页 |
| ·系统学位置及分类系统 | 第31-34页 |
| ·研究进展 | 第34-37页 |
| ·地理分布 | 第37-39页 |
| ·存在的问题 | 第39页 |
| ·紫茎属和折柄茶属的研究背景 | 第39-43页 |
| ·研究内容 | 第39-40页 |
| ·研究进展 | 第40-42页 |
| ·存在问题 | 第42-43页 |
| ·研究目的和意义 | 第43-45页 |
| 第2章 山茶科研究 | 第45-91页 |
| ·实验材料 | 第46-50页 |
| ·实验方法 | 第50-65页 |
| ·植物基因组DNA的提取 | 第50-51页 |
| ·目的片段PCR扩增 | 第51-53页 |
| ·PCR扩增条件 | 第51-52页 |
| ·PCR产物纯化 | 第52-53页 |
| ·目的片段测序 | 第53-62页 |
| ·循环测序 | 第54页 |
| ·清洁 | 第54-55页 |
| ·克隆测序 | 第55-62页 |
| ·数据分析 | 第62-65页 |
| ·序列处理 | 第62页 |
| ·系统发育分析 | 第62-64页 |
| ·祖先特征重建 | 第64-65页 |
| ·分歧时间估算 | 第65页 |
| ·实验结果 | 第65-87页 |
| ·SSC序列分析 | 第65-70页 |
| ·IR序列分析 | 第70页 |
| ·联合序列分析 | 第70-77页 |
| ·分歧时间估算 | 第77-81页 |
| ·祖先特征重建 | 第81-87页 |
| ·地理分布 | 第81页 |
| ·萼片-花被过渡类型 | 第81-82页 |
| ·中轴 | 第82页 |
| ·习性 | 第82页 |
| ·子房室数目 | 第82-83页 |
| ·胚乳丰富程度 | 第83-87页 |
| ·讨论 | 第87-91页 |
| ·山茶科的界定和分类 | 第87-88页 |
| ·大头茶族的属间关系 | 第88-89页 |
| ·紫茎族的属间关系 | 第89页 |
| ·山茶科的形态演化 | 第89-90页 |
| ·生物地理 | 第90-91页 |
| 第3章 紫茎属研究 | 第91-159页 |
| ·实验材料 | 第91-101页 |
| ·实验方法 | 第101-103页 |
| ·实验结果 | 第103-135页 |
| ·形态特征统计 | 第103-114页 |
| ·地理分布统计 | 第114-119页 |
| ·分子数据分析 | 第119-132页 |
| ·rbcL分析 | 第119页 |
| ·ITS分析 | 第119-123页 |
| ·trnL-F分析 | 第123-126页 |
| ·psbA-trnH分析 | 第126-129页 |
| ·联合数据分析 | 第129-132页 |
| ·祖先分布区重建 | 第132-135页 |
| ·讨论 | 第135-159页 |
| ·紫茎属和折柄茶属的系统学地位 | 第135-138页 |
| ·分类处理 | 第138-156页 |
| ·分类系统修订 | 第138-141页 |
| ·属下处理 | 第141-142页 |
| ·种的处理 | 第142-155页 |
| ·其他种的处理 | 第155-156页 |
| ·紫茎属的生物地理和分布格局 | 第156-159页 |
| 第4章 总结和展望 | 第159-163页 |
| ·总结 | 第159-161页 |
| ·展望 | 第161-163页 |
| 参考文献 | 第163-182页 |
| 附录一：地质年代表 | 第182-183页 |
| 附录二：查阅的标本 | 第183-193页 |
| 在读期间发表论文 | 第193-194页 |
| 个人简历 | 第194页 |
