| 摘要 | 第5-7页 |
| abstract | 第7-8页 |
| 1 前言 | 第11-23页 |
| 1.1 梨小食心虫的分布与危害 | 第11页 |
| 1.2 梨小食心虫种群遗传研究进展 | 第11-13页 |
| 1.3 种群遗传研究的DNA分子标记技术 | 第13-14页 |
| 1.3.1 DNA分子标记的发展 | 第13-14页 |
| 1.3.2 SNPs标记及开发技术 | 第14页 |
| 1.4 RAD-seq技术及其在昆虫种群遗传学中的应用 | 第14-20页 |
| 1.4.1 RAD-seq的基本流程 | 第15页 |
| 1.4.2 RAD-seq技术的种类 | 第15-18页 |
| 1.4.3 RAD-seq及SNPs在昆虫种群遗传学中的应用 | 第18-20页 |
| 1.5 昆虫内共生菌Wolbachia对种群结构的影响 | 第20-21页 |
| 1.6 本研究的目的与意义 | 第21-23页 |
| 2 材料与方法 | 第23-32页 |
| 2.1 样本采集与鉴定 | 第23-24页 |
| 2.2 试验仪器与试剂 | 第24页 |
| 2.2.1 主要仪器 | 第24页 |
| 2.2.2 主要试剂 | 第24页 |
| 2.3 基因组DNA的提取与保存 | 第24-26页 |
| 2.4 梨小食心虫ddRAD双酶切组合的筛选 | 第26-27页 |
| 2.4.1 昆虫基因组下载 | 第26页 |
| 2.4.2 限制酶及电脑模拟程序 | 第26-27页 |
| 2.4.3 实验验证 | 第27页 |
| 2.5 ddRAD文库构建与测序 | 第27-28页 |
| 2.5.1 基因组DNA双酶切反应 | 第27-28页 |
| 2.5.2 接头adapter的连接 | 第28页 |
| 2.5.3 目的片段回收 | 第28页 |
| 2.5.4 PCR富集 | 第28页 |
| 2.6 数据统计与分析 | 第28-32页 |
| 2.6.1 酶切优化结果分析 | 第28-29页 |
| 2.6.2 ddRAD测序结果分析 | 第29页 |
| 2.6.3 中性位点和受选择位点的界定 | 第29-30页 |
| 2.6.4 种群遗传分析 | 第30-31页 |
| 2.6.5 内共生菌Wolbachia对种群结构的影响 | 第31页 |
| 2.6.6 受选择位点相关基因的解析 | 第31页 |
| 2.6.7 环境因子相关性分析 | 第31-32页 |
| 3 结果与分析 | 第32-49页 |
| 3.1 梨小食心虫ddRAD双酶切组合的筛选 | 第32-38页 |
| 3.1.1 酶切片段数与基因组大小的线性关系 | 第32-33页 |
| 3.1.2 电脑模拟酶切结果 | 第33页 |
| 3.1.3 实验验证结果 | 第33-38页 |
| 3.2 ddRAD文库测序结果及位点过滤 | 第38-40页 |
| 3.2.1 测序数据统计 | 第38页 |
| 3.2.2 SNPs识别及注释 | 第38-40页 |
| 3.3 中性位点和受选择位点 | 第40页 |
| 3.4 梨小食心虫的种群遗传分析 | 第40-45页 |
| 3.4.1 种群遗传多样性 | 第40-41页 |
| 3.4.2 种群遗传结构 | 第41-44页 |
| 3.4.3 遗传距离与地理距离间的相关性 | 第44-45页 |
| 3.5 共生菌Wolbachia感染分布特征 | 第45-46页 |
| 3.6 受选择位点相关基因的解析 | 第46-47页 |
| 3.7 与环境因子相关的位点解析 | 第47-49页 |
| 4 结论与讨论 | 第49-53页 |
| 4.1 结论 | 第49-50页 |
| 4.1.1 梨小食心虫ddRAD双酶切组合的筛选 | 第49页 |
| 4.1.2 梨小食心虫种群遗传分析 | 第49页 |
| 4.1.3 梨小食心虫种群结构的影响因素及形成机制 | 第49-50页 |
| 4.2 讨论 | 第50-53页 |
| 4.2.1 梨小食心虫ddRAD双酶切组合的筛选 | 第50-51页 |
| 4.2.2 梨小食心虫的种群遗传结构 | 第51页 |
| 4.2.3 梨小食心虫种群遗传结构形成的影响因素和机制 | 第51-53页 |
| 参考文献 | 第53-60页 |
| 附录 | 第60-63页 |
| 个人简介 | 第63-64页 |
| 导师简介 | 第64-65页 |
| 致谢 | 第65页 |
