| 致谢 | 第4-7页 |
| 摘要 | 第7-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第9-18页 |
| 1.1 地黄概况 | 第9-10页 |
| 1.2 连作障碍的危害及产生原因 | 第10-12页 |
| 1.2.1 连作障碍的危害 | 第10页 |
| 1.2.2 连作障碍产生的原因 | 第10-12页 |
| 1.3 地黄连作障碍的研究进展 | 第12-14页 |
| 1.4 数字基因表达谱技术(RNA-Seq)的升级 | 第14-16页 |
| 1.5 钙信号与连作障碍 | 第16页 |
| 1.6 钙荧光指示剂 | 第16-17页 |
| 1.7 本研究的目的和意义 | 第17-18页 |
| 第二章 地黄不同时期的数字基因表达谱分析 | 第18-50页 |
| 引言 | 第18页 |
| 2.1 材料与方法 | 第18-23页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第18页 |
| 2.1.2 材料处理 | 第18页 |
| 2.1.3 仪器与试剂 | 第18-19页 |
| 2.1.4 总RNA提取(采用Trizol法) | 第19页 |
| 2.1.5 构建文库 | 第19页 |
| 2.1.6 数字基因表达谱升级版(RNA-Seq)测序数据处理 | 第19-21页 |
| 2.1.7 数字基因表达谱升级版(RNA-Seq)差异表达基因筛选 | 第21页 |
| 2.1.8 实时荧光定量PCR验证 | 第21-23页 |
| 2.1.8.1 引物设计 | 第21-22页 |
| 2.1.8.2 反转录过程 | 第22-23页 |
| 2.1.8.3 实时荧光定量PCR | 第23页 |
| 2.1.8.4 相对表达量的计算 | 第23页 |
| 2.2 结果与分析 | 第23-44页 |
| 2.2.1 RNA提取结果 | 第23-24页 |
| 2.2.2 测序数据质量评估 | 第24-30页 |
| 2.2.3 差异表达基因分析 | 第30-35页 |
| 2.2.3.1 头茬地黄不同时期的组内差异表达基因的筛选 | 第30-31页 |
| 2.2.3.2 重茬地黄不同时期的组内差异表达基因的筛选 | 第31-32页 |
| 2.2.3.3 头重茬同一时期的组间差异表达基因的筛选 | 第32-35页 |
| 2.2.4 基因表达趋势聚类分析 | 第35-37页 |
| 2.2.5 关键时期差异表达基因的GeneOntology富集分析 | 第37-39页 |
| 2.2.6 差异基因的Pathway富集分析 | 第39-44页 |
| 2.2.7 荧光定量RT-PCR验证分析 | 第44页 |
| 2.3 结论与讨论 | 第44-50页 |
| 第三章 地黄土壤浸提液对幼苗生长的影响 | 第50-61页 |
| 引言 | 第50页 |
| 3.1 材料与方法 | 第50-51页 |
| 3.1.1 实验仪器和试剂 | 第50页 |
| 3.1.2 培养基及培养条件 | 第50-51页 |
| 3.1.3 实验材料 | 第51页 |
| 3.2 实验方法 | 第51-52页 |
| 3.2.1 地黄无菌苗的制备 | 第51页 |
| 3.2.2 幼苗的生根及模拟膨大培养 | 第51-52页 |
| 3.2.3 地黄土壤浸提液的制备： | 第52页 |
| 3.2.4 不同年限的土壤浸提液对地黄膨大过程中的影响 | 第52页 |
| 3.2.5 不同年限的土壤浸提液对地黄幼苗的影响 | 第52页 |
| 3.2.6 荧光共聚焦显微镜观察地黄根尖细胞的钙离子分布 | 第52页 |
| 3.3 结果与分析 | 第52-58页 |
| 3.3.1 地黄无菌苗的制备 | 第52-53页 |
| 3.3.2 无菌苗生根及膨大培养 | 第53-54页 |
| 3.3.3 土壤浸提液对地黄膨大过程中的影响 | 第54-55页 |
| 3.3.4 不同年限的土壤浸提液对地黄幼苗的影响 | 第55-56页 |
| 3.3.5 荧光共聚焦显微镜观察地黄根尖细胞的钙离子分布 | 第56-58页 |
| 3.4 结论与讨论 | 第58-61页 |
| 参考文献 | 第61-68页 |
| ABSTRACT | 第68-70页 |
