| 摘要 | 第2-3页 |
| abstract | 第3-4页 |
| 1 引言 | 第14-22页 |
| 1.1 研究背景和意义 | 第14-19页 |
| 1.1.1 骆驼进化 | 第14页 |
| 1.1.2 双峰驼、哺乳动物血糖生理学研究 | 第14-15页 |
| 1.1.3 糖代谢基础研究 | 第15-16页 |
| 1.1.4 糖尿病世界现状 | 第16-18页 |
| 1.1.5 疾病机制假说 | 第18-19页 |
| 1.2 国内外研究进展 | 第19-22页 |
| 1.2.1 转录组测序技术应用 | 第19-20页 |
| 1.2.2 糖尿病治疗 | 第20-21页 |
| 1.2.3 双峰驼生理特征研究进展 | 第21-22页 |
| 1.3 本文研究内容 | 第22页 |
| 1.3.1 研究内容 | 第22页 |
| 1.3.2 技术路线 | 第22页 |
| 2 双峰驼多组织转录组测序及基础分析 | 第22-56页 |
| 2.1 材料与方法 | 第23-29页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第23页 |
| 2.1.2 RNA提取及TotalRNA样品检测 | 第23页 |
| 2.1.3 建库测序 | 第23-26页 |
| 2.1.3.1 文库构建 | 第24-25页 |
| 2.1.3.2 文库检测 | 第25页 |
| 2.1.3.3 测序 | 第25-26页 |
| 2.1.4 生物信息学分析 | 第26-29页 |
| 2.1.4.1 原始测序数据过滤评估 | 第26页 |
| 2.1.4.2 参考序列比对 | 第26页 |
| 2.1.4.3 可变剪接分析 | 第26-27页 |
| 2.1.4.4 新转录本预测 | 第27页 |
| 2.1.4.5 SNP和InDel分析 | 第27页 |
| 2.1.4.6 基因表达水平分析 | 第27页 |
| 2.1.4.7 不同样品相关性分析 | 第27页 |
| 2.1.4.8 差异表达分析 | 第27-28页 |
| 2.1.4.9 差异基因GO富集分析 | 第28页 |
| 2.1.4.10 差异基因KEGG富集分析 | 第28-29页 |
| 2.1.4.11 反义转录本预测 | 第29页 |
| 2.1.4.12 TSS和TTS预测 | 第29页 |
| 2.2 结果与分析 | 第29-55页 |
| 2.2.1 RNA提取检测结果 | 第29-32页 |
| 2.2.1.1 琼脂糖凝胶电泳检测结果 | 第29页 |
| 2.2.1.2 五个组织样本总RNA浓度、纯度、完整度检测 | 第29-32页 |
| 2.2.2 原始数据分析 | 第32-55页 |
| 2.2.2.1 测序错误率分布 | 第32-33页 |
| 2.2.2.2 碱基含量分布检查 | 第33-35页 |
| 2.2.2.3 参考序列比对分析 | 第35-36页 |
| 2.2.2.4 可变剪接分析 | 第36-37页 |
| 2.2.2.5 新转录本预测 | 第37-38页 |
| 2.2.2.6 SNP分析 | 第38页 |
| 2.2.2.7 基因表达水平分析 | 第38-39页 |
| 2.2.2.8 样品间相关性分析 | 第39-40页 |
| 2.2.2.9 基因差异表达分析 | 第40-42页 |
| 2.2.2.10 差异基因GO | 第42-53页 |
| 2.2.2.11 反义转录本预测 | 第53-55页 |
| 2.2.2.12 TSS和TTS预测 | 第55页 |
| 2.3 讨论 | 第55-56页 |
| 2.3.1 转录组测序物种的选择 | 第55-56页 |
| 2.3.2 测序平台与策略 | 第56页 |
| 2.3.3 测序数据初级分析 | 第56页 |
| 2.4 结论 | 第56页 |
| 3 双峰驼多组织代谢分析 | 第56-68页 |
| 3.1 材料与方法 | 第56-58页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第56页 |
| 3.1.2 多组织基因表达特征 | 第56-57页 |
| 3.1.3 糖酵解限速酶基因差异表达 | 第57页 |
| 3.1.4 糖酵解途径下游基因差异表达 | 第57页 |
| 3.1.5 抗氧化基因差异表达 | 第57页 |
| 3.1.6 HSP家族基因差异表达 | 第57页 |
| 3.1.7 SLC家族基因差异表达 | 第57-58页 |
| 3.1.8 肾源分泌型抗氧化基因差异表达 | 第58页 |
| 3.2 结果与分析 | 第58-65页 |
| 3.2.1 多组织表达特征 | 第58-60页 |
| 3.2.2 糖酵解限速酶基因差异表达 | 第60-61页 |
| 3.2.3 糖酵解途径下游基因差异表达 | 第61-62页 |
| 3.2.4 抗氧化基因差异表达 | 第62-63页 |
| 3.2.5 HSP家族基因差异表达 | 第63-64页 |
| 3.2.6 SLC家族基因差异表达 | 第64-65页 |
| 3.2.7 肾源分泌型抗氧化基因差异表达 | 第65页 |
| 3.3 讨论 | 第65-67页 |
| 3.3.1 双峰驼各组织基因表达特点 | 第65-66页 |
| 3.3.2 双峰驼糖酵解限速酶基因表达特点 | 第66页 |
| 3.3.3 双峰驼糖酵解途径下游基因表达特点 | 第66页 |
| 3.3.4 双峰驼抗氧化基因表达特点 | 第66-67页 |
| 3.3.5 双峰驼HSP家族基因表达特点 | 第67页 |
| 3.3.6 双峰驼SLC家族基因表达特点 | 第67页 |
| 3.3.7 双峰驼肾源分泌型抗氧化基因特点 | 第67页 |
| 3.4 结论 | 第67-68页 |
| 4 候选基因筛选及高血糖耐受机制 | 第68-74页 |
| 4.1 材料与方法 | 第68-69页 |
| 4.1.1 实验材料 | 第68页 |
| 4.1.2 实验器材 | 第68页 |
| 4.1.3 RNA提取 | 第68页 |
| 4.1.4 RNA反转录cDNA及检测 | 第68页 |
| 4.1.5 引物设计 | 第68页 |
| 4.1.6 引物退火温度 | 第68页 |
| 4.1.7 定量分析 | 第68-69页 |
| 4.1.8 肝脏DNA提取、检测、凝胶电泳 | 第69页 |
| 4.2 结果与分析 | 第69-72页 |
| 4.2.1 反转录结果检测 | 第69页 |
| 4.2.2 引物选择 | 第69页 |
| 4.2.3 定量PCR结果 | 第69-71页 |
| 4.2.4 GCK组织表达结果 | 第71-72页 |
| 4.3 讨论 | 第72-74页 |
| 4.4 结论 | 第74页 |
| 5 骆驼肾皮质蛋白质质谱分析 | 第74-87页 |
| 5.1 材料与方法 | 第75-78页 |
| 5.1.1 实验材料 | 第75页 |
| 5.1.2 蛋白质提取 | 第75页 |
| 5.1.3 蛋白质胶内酶解 | 第75-76页 |
| 5.1.4 SCX分肽段提取 | 第76页 |
| 5.1.5 基于Triple TOF 5600的LC-ESI-MSMS分析 | 第76页 |
| 5.1.6 蛋白质信息分析 | 第76-78页 |
| 5.1.6.1 数据格式转换 | 第77页 |
| 5.1.6.2 选择数据库 | 第77-78页 |
| 5.1.6.3 Mascot搜索 | 第78页 |
| 5.1.6.4 鉴定质量评估 | 第78页 |
| 5.1.6.5 GO注释 | 第78页 |
| 5.2 结果与分析 | 第78-86页 |
| 5.2.1 数据格式转换 | 第78-79页 |
| 5.2.2 肽段匹配误差分布 | 第79页 |
| 5.2.3 肽段电荷分布 | 第79-80页 |
| 5.2.4 蛋白质鉴定 | 第80-84页 |
| 5.2.4.1 基本鉴定信息 | 第80-81页 |
| 5.2.4.2 鉴定肽段序列长度分布 | 第81-82页 |
| 5.2.4.3 蛋白的鉴定肽段和谱图个数分布 | 第82-84页 |
| 5.2.4.4 蛋白鉴定覆盖度分布 | 第84页 |
| 5.2.5 GO注释 | 第84-86页 |
| 5.3 讨论 | 第86-87页 |
| 5.4 结论 | 第87页 |
| 6 血液尿酸含量及尿液葡萄糖含量分析 | 第87-89页 |
| 6.1 材料与方法 | 第87页 |
| 6.1.1 实验材料 | 第87页 |
| 6.1.2 实验器材 | 第87页 |
| 6.1.3 血尿酸含量及尿液中尿糖含量检测 | 第87页 |
| 6.1.4 统计分析 | 第87页 |
| 6.2 结果与分析 | 第87-88页 |
| 6.2.1 血尿酸含量检查 | 第87-88页 |
| 6.2.2 统计结果分析 | 第88页 |
| 6.2.3 尿糖含量检测 | 第88页 |
| 6.3 讨论 | 第88页 |
| 6.4 结论 | 第88-89页 |
| 7 全文总结 | 第89-91页 |
| 7.1 全文结论 | 第89页 |
| 7.2 本研究创新点 | 第89页 |
| 7.3 未来研究 | 第89-91页 |
| 致谢 | 第91-92页 |
| 参考文献 | 第92-102页 |
| 附录 | 第102-108页 |
| 作者简介 | 第108页 |