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CRISPR/Cas9介导烟草NtBSK3的基因编辑及NtBSK家族生物学效应分析

摘要第7-9页
Abstract第9-11页
第一章 文献综述第12-24页
    1.1 生物信息学第12-13页
        1.1.1 生物信息学概述第12页
        1.1.2 生物信息学发展的意义第12页
        1.1.3 生物信息学主要研究内容第12-13页
    1.2 基因组编辑技术简介第13-18页
        1.2.1 ZFNs技术第13-14页
        1.2.2 TALEN技术第14-16页
        1.2.3 CRISPR/Cas系统第16-18页
    1.3 油菜素内酯及其信号转导第18-22页
        1.3.1 油菜素内酯简介第18-19页
        1.3.2 油菜素内酯生物合成和代谢第19页
        1.3.3 油菜素内酯的信号转导第19-22页
    1.4 研究的目的及意义第22-23页
    1.5 技术路线第23-24页
第二章 普通烟草NtBSK1、NtBSK2和NtBSK3基因的生物信息学分析第24-36页
    2.1 材料与方法第24-25页
        2.1.1 烟草BSKs基因家族同源检索第24-25页
        2.1.2 生物信息学在线软件分析第25页
    2.2 结果与分析第25-34页
        2.2.1 烟草NtBSK1/NtBSK2/NtBSK3同源分析第25页
        2.2.2 烟草NtBSK1/NtBSK2/NtBSK3理化性质分析第25-26页
        2.2.3 烟草NtBSK1/NtBSK2/NtBSK3蛋白亲/疏水性分析第26-28页
        2.2.4 烟草NtBSK1/NtBSK2/NtBSK3的功能结构域分析第28页
        2.2.5 烟草NtBSK1/NtBSK2/NtBSK3二级及三级结构的预测分析第28-29页
        2.2.6 烟草NtBSK1/NtBSK2/NtBSK3磷酸化位点的分析第29-30页
        2.2.7 烟草NtBSK1/NtBSK2/NtBSK3的信号肽及跨膜区分析第30-33页
        2.2.8 烟草NtBSK1/NtBSK2/NtBSK3多序列比对和进化分析第33-34页
    2.3 本章小结第34-36页
第三章CRISPR/Cas9定点突变烟草基因NtBSK3第36-54页
    3.1 材料第36-38页
        3.1.1 植物材料第36页
        3.1.2 实验菌株第36页
        3.1.3 实验载体第36-37页
        3.1.4 主要试剂第37页
        3.1.5 植物组织培养基第37-38页
        3.1.6 大肠杆菌培养基第38页
        3.1.7 农杆菌培养基第38页
        3.1.8 实验试剂溶液第38页
    3.2 方法第38-44页
        3.2.1 靶位点的筛选第38页
        3.2.2 靶位点组装到sgRNA载体上第38-41页
        3.2.3 重组sgRNA目的片段插入pCACas9载体第41-42页
        3.2.4 重组表达载体转化农杆菌感受态第42页
        3.2.5 农杆菌的培养及侵染烟草第42页
        3.2.6 获得基因编辑植株第42-43页
        3.2.7 CTAB法提取烟草DNA第43页
        3.2.8 突变体的筛选第43页
        3.2.9 基因突变类型的确定第43-44页
        3.2.10 突变基因NtBSK3的生物信息学分析第44页
    3.3 结果与分析第44-53页
        3.3.1 靶位点的确定第44-46页
        3.3.2 靶位点片段组装到sgRNA上第46页
        3.3.3 sgRNA组装到Cas9载体上第46-47页
        3.3.4 CRISPR/Cas9敲除烟草NtBSK3基因的T0代转基因植株表型及突变体分析第47-49页
        3.3.5 不同位点突变的NtBSK3基因生物信息学分析第49-52页
        3.3.6 脱靶效应检测第52-53页
    3.4 本章小结第53-54页
第四章 外源喷施BR条件下烟草基因NtBSK1/NtBSK2/NtBSK3的定量表达分析第54-64页
    4.1 材料第54页
    4.2 方法第54-57页
        4.2.1 材料处理第54页
        4.2.2 总RNA的提取第54-55页
        4.2.3 烟草总RNA逆转录成cDNA第55-56页
        4.2.4 实时定量PCR引物设计第56-57页
        4.2.5 定量PCR扩增第57页
    4.3 结果分析第57-61页
        4.3.1 提取烟草总RNA的检测第57-58页
        4.3.2 不同处理下基因NtBSK1/NtBSK2/NtBSK3的表达量分析第58-60页
        4.3.3 编辑基因NtBSK3不同处理的表达量量分析第60-61页
    4.4 本章小结第61-64页
第五章 讨论与结论第64-68页
    5.1 讨论第64-65页
    5.2 创新点第65页
    5.3 结论第65-68页
参考文献第68-80页
附录第80-94页
致谢第94页

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