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厦门霉素生物合成基因簇在吸水链霉菌FR008和白色链霉菌中的异源表达及其生物信息学分析

中文摘要第5-7页
英文摘要第7-8页
第一章 绪论第11-28页
    1.1 放线菌第11-12页
    1.2 异源表达第12-15页
    1.3 链霉菌基因转移方法第15-18页
        1.3.1 接合转移第15-17页
        1.3.2 噬菌体转导第17页
        1.3.3 转化第17-18页
    1.4 苯并吡喃类化合物的生物活性概述第18-21页
    1.5 厦门霉素生物合成过程第21-22页
    1.6 生物信息学简介第22-25页
    1.7 本实验研究意义第25-28页
第二章 实验材料与方法第28-39页
    2.1 实验材料第28-33页
        2.1.1 菌株、质粒及引物第28-29页
        2.1.2 主要实验仪器第29页
        2.1.3 常用培养基和溶液第29-33页
        2.1.4 本研究中所用的抗生素第33页
    2.2 实验方法第33-39页
        2.2.1 感受态细胞的制备第33-34页
        2.2.2 质粒提取第34页
        2.2.3 热激法转化第34-35页
        2.2.4 链霉菌孢子悬液的制备第35页
        2.2.5 链霉菌少量DNA的提取第35页
        2.2.6 聚合酶链式反应(PCR)第35-36页
        2.2.7 接合转移第36页
        2.2.8 链霉菌发酵条件第36-37页
        2.2.9 样品处理第37页
        2.2.10 色谱条件第37-38页
        2.2.11 质谱条件第38页
        2.2.12 生物信息学分析所用的主要网站第38-39页
第三章 实验结果第39-83页
    3.1 厦门霉素异源表达第39-48页
        3.1.1 PCR验证接合转移第39-40页
        3.1.2 HPLC验证异源表达第40-42页
        3.1.3 质谱验证异源表达第42-43页
        3.1.4 小结讨论第43-48页
    3.2 厦门链霉菌和吸水链霉菌FR008-09404的培养基筛选第48-55页
        3.2.1 厦门链霉菌基础培养基筛选第48-49页
        3.2.2 吸水链霉菌FR008-09404培养基筛选第49-54页
        3.2.3 小结讨论第54-55页
    3.3 生物信息学分析厦门霉素基因簇第55-83页
        3.3.1 ProtParam分析蛋白质氨基酸理化性质第56-64页
        3.3.2 ProtScale分析蛋白质的疏水性第64-68页
        3.3.3 Gor预测蛋白质的二级结构第68-75页
        3.3.4 TMHMM Server v.2.0 预测蛋白质跨膜区第75-76页
        3.3.5 预测蛋白质的亚细胞定位第76-77页
        3.3.6 蛋白质指纹分析第77-81页
        3.3.7 预测蛋白质的三级结构第81-82页
        3.3.8 小结讨论第82-83页
第四章 总结与展望第83-85页
参考文献第85-90页
致谢第90-91页
已发表的论文第91页

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