| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-9页 |
| 插图索引 | 第13-15页 |
| 表格索引 | 第15-17页 |
| 第一章 绪论 | 第17-27页 |
| 1.1 引言 | 第17-22页 |
| 1.1.1 基因数据压缩的背景及意义 | 第17-19页 |
| 1.1.2 光谱成像中压缩感知测量值压缩的背景及意义 | 第19-22页 |
| 1.2 无损数据压缩与信源编码 | 第22-24页 |
| 1.2.1 数据压缩意义和基础 | 第22-23页 |
| 1.2.2 信源编码及其冗余 | 第23-24页 |
| 1.3 本文主要贡献和章节安排 | 第24-27页 |
| 第二章 基于非连续上下文建模和最大熵原则的FASTA格式基因压缩 | 第27-49页 |
| 2.1 引言 | 第27页 |
| 2.2 相关研究工作 | 第27-30页 |
| 2.2.1 基于字典（替代）的基因压缩 | 第27-28页 |
| 2.2.2 基于统计特性的基因压缩 | 第28-29页 |
| 2.2.3 基于参考序列的基因压缩 | 第29-30页 |
| 2.3 基于非连续上下文建模和最大熵原则的压缩方法研究 | 第30-39页 |
| 2.3.1 方法概述 | 第30-31页 |
| 2.3.2 步骤一：基于类LZ字典法的替代编码 | 第31-34页 |
| 2.3.3 步骤二：基于非连续上下文建模和最大熵原则的预测编码 | 第34-39页 |
| 2.4 实验结果与分析 | 第39-46页 |
| 2.4.1 实验设置与参数分析 | 第39-41页 |
| 2.4.2 结果与分析 | 第41-46页 |
| 2.5 本章小结 | 第46-49页 |
| 第三章 基于多参考序列和序列分级的SAM/BAM格式基因压缩 | 第49-67页 |
| 3.1 序言 | 第49页 |
| 3.2 相关研究工作 | 第49-52页 |
| 3.3 基于多参考序列和序列分级的SAM/BAM格式基因压缩方法 | 第52-62页 |
| 3.3.1 方法概述 | 第52页 |
| 3.3.2 Sequence域的压缩设计 | 第52-57页 |
| 3.3.3 Quality Value域的压缩设计 | 第57-60页 |
| 3.3.4 其他域的压缩设计 | 第60-62页 |
| 3.4 实验结果与分析 | 第62-66页 |
| 3.4.1 实验设置与数据来源 | 第62-63页 |
| 3.4.2 结果与分析 | 第63-66页 |
| 3.5 本章小结 | 第66-67页 |
| 第四章 基于编码孔径和嵌入式变换编码的CASSI系统测量值压缩 | 第67-79页 |
| 4.1 序言 | 第67页 |
| 4.2 编码孔径快照光谱成像仪CASSI系统介绍及数学表示 | 第67-69页 |
| 4.3 基于编码孔径和嵌入式变换编码的CASSI系统测量值压缩 | 第69-76页 |
| 4.3.1 CASSI系统测量值的基于熵的表示 | 第69-70页 |
| 4.3.2 CASSI系统测量值的统计模型 | 第70-72页 |
| 4.3.3 CASSI系统测量值在已知编码孔径条件下的嵌入式变换编码 | 第72-74页 |
| 4.3.4 Y_(remainder)利用编码孔径信息的位平面编码 | 第74-76页 |
| 4.4 实验结果与分析 | 第76-77页 |
| 4.4.1 实验设置 | 第76页 |
| 4.4.2 结果分析 | 第76-77页 |
| 4.5 本章小结 | 第77-79页 |
| 第五章 总结与展望 | 第79-83页 |
| 5.1 全文总结 | 第79-80页 |
| 5.2 未来研究工作展望 | 第80-83页 |
| 参考文献 | 第83-93页 |
| 致谢 | 第93-95页 |
| 攻读学位论文期间发表的学术论文和科研成果目录 | 第95页 |
