| 摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-12页 |
| 第1章 绪论 | 第13-17页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第13-14页 |
| 1.2 研究现状 | 第14-15页 |
| 1.3 本文的主要内容 | 第15-16页 |
| 1.4 论文的组织结构 | 第16-17页 |
| 第2章 全基因组结构变异组合优化问题建模 | 第17-22页 |
| 2.1 邻接、断点以及相关符号介绍 | 第17-18页 |
| 2.2 基因组比较建模 | 第18-19页 |
| 2.3 平凡基因组的重组排序问题 | 第19-20页 |
| 2.4 一般基因组的重组排序问题 | 第20-21页 |
| 2.5 结论 | 第21-22页 |
| 第3章 一般翻转排序的近似算法 | 第22-30页 |
| 3.1 算法的实现目标 | 第22页 |
| 3.2 怎样翻转排序 | 第22-28页 |
| 3.2.1 匹配与匹配块 | 第22-23页 |
| 3.2.2 同位置匹配块的翻转操作 | 第23-24页 |
| 3.2.3 异位置匹配块的翻转操作 | 第24-26页 |
| 3.2.4 特殊情况下的特殊处理 | 第26-27页 |
| 3.2.5 完整算法描述 | 第27-28页 |
| 3.2.6 算法的优化 | 第28页 |
| 3.3 ReversalSort算法的近似性能比 | 第28-29页 |
| 3.4 总结 | 第29-30页 |
| 第4章 一种特殊情况下的精确算法 | 第30-52页 |
| 4.1 无交叉图 | 第30-31页 |
| 4.2 最小次数的翻转排序算法 | 第31-34页 |
| 4.2.1 算法的目标 | 第31-32页 |
| 4.2.2 无交叉图的翻转排序算法 | 第32-33页 |
| 4.2.3 完整算法描述 | 第33-34页 |
| 4.3 最优性的证明 | 第34-51页 |
| 4.3.1 无交叉图的三种简单结构 | 第34-35页 |
| 4.3.2 三种简单结构下的翻转操作 | 第35-41页 |
| 4.3.3 一般无交叉图的约减过程 | 第41-46页 |
| 4.3.4 MinReversalSort的最优性证明 | 第46-51页 |
| 4.4 总结 | 第51-52页 |
| 第5章 总结与展望 | 第52-54页 |
| 5.1 本文总结 | 第52页 |
| 5.2 研究展望 | 第52-54页 |
| 参考文献 | 第54-58页 |
| 致谢 | 第58-59页 |
| 攻读硕士期间发表的学术论文列表 | 第59-60页 |
| 攻读硕士期间参与科研项目情况 | 第60-61页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第61页 |