| 中文摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4页 |
| 第一章 β-内酰胺酶与抗生素耐药 | 第7-20页 |
| 1.1 β-内酰胺酶及其分类 | 第7-8页 |
| 1.2 TEMβ-内酰胺酶 | 第8-15页 |
| 1.2.1 TEMβ-内酰胺酶的由来及流行 | 第8-14页 |
| 1.2.2 TEMβ-内酰胺酶结构生物学特征 | 第14-15页 |
| 1.3 β-内酰胺类抗生素 | 第15-16页 |
| 1.4 β-内酰胺酶抑制剂 | 第16页 |
| 1.5 β-内酰胺酶耐药机制研究进展 | 第16-20页 |
| 第二章 计算分子模拟方法简介 | 第20-26页 |
| 2.1 研究方法简介 | 第20-22页 |
| 2.1.1 直接耦合分析计算 | 第20页 |
| 2.1.2 蛋白质分子动力学模拟 | 第20-22页 |
| 2.1.3 可药性(Druggable)结合位点预测 | 第22页 |
| 2.1.4 构象变化阻挫度(ConformationFrustrationDegree)计算 | 第22页 |
| 2.2 具体方法应用描述 | 第22-26页 |
| 2.2.1 TEM分子结构文件的准备 | 第22-23页 |
| 2.2.2 DCA计算 | 第23页 |
| 2.2.3 TEM-1与TEM-52简化分子动力学模拟 | 第23-24页 |
| 2.2.4 可药性结合位点预测 | 第24页 |
| 2.2.5 靶向变构位点的潜在活性化合物筛选 | 第24-25页 |
| 2.2.6 TEM-1与TEM-52长时间分子动力学模拟 | 第25-26页 |
| 第三章 β-内酰胺酶突变引起抗生素耐药的分子机制研究 | 第26-40页 |
| 3.1 .TEM的共进化耦合残基对预测 | 第26-31页 |
| 3.2 TEM-1与TEM-52构象变化分析 | 第31-33页 |
| 3.3 .TEM-1与TEM-52蛋白质结构阻挫度分析 | 第33-34页 |
| 3.4 潜在的变构活性化合物的发现 | 第34-36页 |
| 3.5 TEM-1与TEM-52长时间全原子分子动力学模拟结果 | 第36-38页 |
| 3.6 章小结 | 第38-40页 |
| 第四章 结论 | 第40-44页 |
| 4.1 主要结论 | 第40-41页 |
| 4.2 研究展望 | 第41-44页 |
| 参考文献 | 第44-49页 |
| 附表 | 第49-61页 |
| 在学期间的研究成果 | 第61-62页 |
| 致谢 | 第62页 |
