| 摘要 | 第1-12页 |
| Abstract | 第12-14页 |
| 1 引言 | 第14-32页 |
| ·miRNA 的产生 | 第14-16页 |
| ·miRNA 的作用方式 | 第16-17页 |
| ·与植物生长发育相关的miRNA | 第17-21页 |
| ·miRNA 参与植物开花及花器官发育 | 第17-18页 |
| ·miRNA 对植物叶和茎发育的影响 | 第18-19页 |
| ·miRNA 对根发育的影响 | 第19-20页 |
| ·miRNA 参与发育时序调控及其它调控作用 | 第20-21页 |
| ·与植物逆境胁迫相关的miRNA | 第21-27页 |
| ·miRNA 与植物非生物胁迫 | 第21-26页 |
| ·miRNA 与植物营养胁迫 | 第21-24页 |
| ·miRNA 与低温胁迫 | 第24-25页 |
| ·miRNA 与干旱胁迫 | 第25页 |
| ·miRNA 与其它非生物胁迫 | 第25-26页 |
| ·miRNA 与植物生物胁迫 | 第26-27页 |
| ·miRNA 的研究方法 | 第27-30页 |
| ·miRNA 的发现方法 | 第27-29页 |
| ·miRNA 文库的构建、克隆和测序 | 第27-28页 |
| ·计算机预测法 | 第28-29页 |
| ·miRNA 靶基因的预测与验证 | 第29-30页 |
| ·展望 | 第30页 |
| ·本研究的立题依据与目的意义 | 第30-32页 |
| 2 材料与方法 | 第32-43页 |
| ·试验材料 | 第32-34页 |
| ·植物材料与病原菌 | 第32页 |
| ·酶与各种生化试剂 | 第32页 |
| ·试验用探针序列和引物序列 | 第32-33页 |
| ·主要仪器 | 第33-34页 |
| ·生物信息分析所用的数据库 | 第34页 |
| ·生物信息分析所用的分析软件 | 第34页 |
| ·miRNA 的预测标准 | 第34页 |
| ·试验方法 | 第34-43页 |
| ·棉苗培养与盐胁迫处理 | 第34-35页 |
| ·棉苗培养与病菌接种 | 第35页 |
| ·棉花总RNA 的提取 | 第35-36页 |
| ·miRNA 芯片试验 | 第36-37页 |
| ·Northern blot 检测miRNA 的表达 | 第37-39页 |
| ·RT-PCR 定量检测 | 第39-40页 |
| ·小分子RNA 文库的构建 | 第40页 |
| ·小分子RNA 的测序 | 第40-41页 |
| ·小分子RNA 文库的生物信息学分析 | 第41-42页 |
| ·miRNA 靶基因的预测方法 | 第42-43页 |
| 3 结果与分析 | 第43-65页 |
| ·植物miRNA 预测方法的改进和棉花miRNA 的预测 | 第43-47页 |
| ·植物miRNA 的保守性分析 | 第43-44页 |
| ·改进植物miRNA 的预测方法 | 第44-45页 |
| ·改进植物miRNA 的预测方法的应用 | 第45-47页 |
| ·盐诱导棉花miRNA 的差异表达分析 | 第47-52页 |
| ·棉花miRNA 芯片的杂交结果 | 第47-48页 |
| ·利用Northern blot 验证盐诱导表达的棉花miRNA 家族 | 第48页 |
| ·利用RT-PCR 验证盐诱导表达的棉花miRNA | 第48-50页 |
| ·盐诱导条件下miRNA 靶基因的表达情况 | 第50-52页 |
| ·黄萎病菌侵染条件下棉花miRNA 的差异表达分析 | 第52-65页 |
| ·小RNA 测序的初步分析结果 | 第52-54页 |
| ·棉花miRNA 的鉴定 | 第54-56页 |
| ·黄萎病菌诱导棉花miRNA 的表达 | 第56-58页 |
| ·黄萎病菌侵染条件下,差异表达 miRNA 的靶基因 | 第58-65页 |
| 4 讨论 | 第65-73页 |
| ·同源搜索miRNA 方法的改进 | 第65-66页 |
| ·基因芯片检测miRNA 的表达 | 第66-67页 |
| ·高通量测序技术为小分子RNA 的研究提供了强有力的平台 | 第67页 |
| ·测序结果中体现了丰富的miRNA 信息 | 第67-69页 |
| ·miRNA 在耐盐过程中的作用 | 第69页 |
| ·miRNA 的特异性表达 | 第69-70页 |
| ·miRNA 在抗黄萎病中的作用 | 第70-72页 |
| ·进一步研究设想 | 第72-73页 |
| 5 结论 | 第73-75页 |
| 参考文献 | 第75-97页 |
| 致谢 | 第97-98页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第98-99页 |
| 博士学位论文内容简介及自评 | 第99页 |
