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肝癌干细胞相关基因和长链非编码RNA调控自我更新的分子机制研究

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
第一部分 C8orf4调控肝癌干细胞分子机制研究第14-42页
    第一章 文献综述第14-24页
        1.1 C8orf4结构和功能概述第14-15页
        1.2 肝癌及肝癌干细胞第15-19页
            1.2.1 肝癌概述第15页
            1.2.2 肝癌发生过程第15-17页
            1.2.3 肝癌干细胞概述第17-18页
            1.2.4 肝癌干细胞研究前沿第18-19页
        1.3 Notch信号第19-24页
            1.3.1 Notch信号概述第19-22页
            1.3.2 Notch信号与肿瘤干细胞第22-23页
            1.3.3 Notch信号,肝癌和肝癌干细胞第23-24页
    第二章 实验材料和方法第24-34页
        2.1 细胞系及其培养条件第24页
        2.2 抗体及试剂第24页
        2.3 C8orf4 KO细胞系的制备第24-25页
        2.4 C8orf4敲低和高表细胞系及原代细胞的制备第25-26页
        2.5 RNA抽提、RT-PCR和Realtime PCR第26页
        2.6 酵母双杂交第26-29页
        2.7 Western blot第29-30页
        2.8 免疫荧光第30页
        2.9 免疫组化第30-31页
        2.10 核质分离第31-32页
        2.11 小球形成第32页
        2.12 Side population分选第32页
        2.13 流式细胞术第32-33页
        2.14 IP和co-IP第33页
        2.15 肿瘤生长和梯度稀释成瘤第33页
        2.16 组学分析和数据挖掘第33-34页
    第三章 实验结果及讨论第34-40页
        3.1 C8orf4在肝癌中低表达第34-35页
        3.2 C8orf4在肝癌干细胞中低表达第35-36页
        3.3 C8orf4负调控肝癌干细胞第36页
        3.4 C8orf4负调控Notch信号第36-37页
        3.5 C8orf4与Notch2相互作用,并影响其入核第37-38页
        3.6 Notch2及其下游信号在肝癌干细胞中发挥重要作用第38-39页
        3.7 Notch信号与肝癌临床有密切关系第39-40页
    第四章 讨论与小结第40-42页
第二部分 Zic2调节肝癌干细胞分子机制研究第42-57页
    第一章 文献综述第42-43页
        1.1 Zic2结构和功能概述第42页
        1.2 NURF复合物第42-43页
        1.3 Oct4第43页
    第二章 实验材料和方法第43-47页
        2.1 细胞系及其培养条件第43页
        2.2 抗体及试剂第43-44页
        2.3 KO和KD细胞系的制备第44页
        2.4 Luciferase第44-45页
        2.5 ChIP实验第45-46页
        2.6 EMSA第46-47页
        2.7 DNase Ⅰ敏感性实验第47页
    第三章 实验结果及讨论第47-55页
        3.1 Zic2在肝癌中高表达第48页
        3.2 Zic2在肝癌干细胞中高表达第48-49页
        3.3 Zic2对肝癌干细胞的自我更新至关重要第49-50页
        3.4 Zic2影响OCT4信号第50-51页
        3.5 Zic2结合到OCT4的promoter上第51-52页
        3.6 Zic2招募NURF复合物第52-53页
        3.7 NURF复合物对肝癌干细胞的干性维持不可或缺第53-54页
        3.8 NURF复合物与肝癌的临床严重性和预后有关第54-55页
    第四章 讨论和小结第55-57页
第三部分 Lnc-β-Catm影响肝癌干细胞的分子机制研究第57-82页
    第一章 文献综述第57-64页
        1.1 Long noncoding RNA第57-59页
            1.1.1 LncRNA概述第57页
            1.1.2 LncRNA发挥作用的机制第57-58页
            1.1.3 LncRNA与肿瘤的关系第58-59页
        1.2 Wnt/β-catenin第59-60页
            1.2.1 概述第59-60页
            1.2.2 Wnt/β-catenin与肿瘤和干性的关系第60页
        1.3 EZH2第60-61页
            1.3.1 EZH2概述第60-61页
            1.3.2 EZH2与肿瘤和干性的关系第61页
        1.4 蛋白质翻译后修饰第61-64页
            1.4.1 翻译后修饰概述第61-62页
            1.4.2 甲基化修饰第62-63页
            1.4.3 磷酸化修饰第63页
            1.4.4 泛素化修饰第63-64页
    第二章 实验材料和方法第64-69页
        2.1 FISH第64-65页
        2.2 RNA EMSA第65-66页
        2.3 Northem第66-68页
        2.4 RNA-IP第68页
        2.5 RNA-Pull down第68-69页
    第三章 实验结果及讨论第69-80页
        3.1 Lnc-β-Catm在肝癌中高表达第71-72页
        3.2 Lnc-β-Catm在肝癌干细胞中高表达第72页
        3.3 Lnc-β-Catm对肝癌干细胞的自我更新至关重要第72-73页
        3.4 Lnc-β-Catm与β-catenin和EZH2相互作用第73-74页
        3.5 Lnc-β-Catm促进β-catenin和EZH2的相互作用第74-75页
        3.6 EZH2能够甲基化β-catenin第75-76页
        3.7 EZH2甲基化β-catenin的位点是K49第76-77页
        3.8. β-catenin甲基化抑制其磷酸化和泛素化第77-78页
        3.9. Lnc-β-Catm通过β-catenin促进肝癌干细胞的自我更新第78-79页
        3.10. Lnc-β-Catm和Wnt/β-catenin与肝癌临床相关第79-80页
    第四章 讨论和小结第80-82页
第四部分第82-98页
    第一章 文献综述第82-87页
        1.1 SWI/SNF复合物第82-85页
            1.1.1 SWI/SNF复合物概述第82-83页
            1.1.2 SWI/SNF复合物与肿瘤第83页
            1.1.3 SWI/SNF复合物与肿瘤干细胞第83-84页
            1.1.4 Brg1和Brm第84-85页
        1.2 Yap1信号通路第85-86页
            1.2.1 Yap1信号通路概述第85页
            1.2.2 Yap1与肿瘤及肿瘤干细胞第85-86页
        1.3 Klf4第86-87页
            1.3.1 Klf4与干性维持第86-87页
            1.3.2 Klf4与肿瘤发生第87页
    第二章 实验方法第87-88页
    第三章 实验结果及分析第88-96页
        3.1. LncBrm在肝癌中高表达第88-89页
        3.2. LncBrm在肝癌干细胞中高表达第89-90页
        3.3. LncBrm敲低抑制肝癌干细胞的自我更新第90-91页
        3.4. LncBrm高表达促进肝癌肝癌细胞的自我更新第91-92页
        3.5. LncBrm和Brm相互作用第92-93页
        3.6. Brm/Brg1影响Yap1的信号通路的活化第93-94页
        3.7. Yap1信号通路促进肝癌干细胞的自我更新第94-95页
        3.8. Yap信号通路的活化与肝癌临床严重程度密切相关第95-96页
    第四章 讨论和小结第96-98页
符号说明第98-99页
参考文献第99-109页
博士期间发表论文第109-111页
致谢第111页

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