基于数据融合的生物网络推断
摘要 | 第4-5页 |
Abstract | 第5页 |
引言 | 第8-11页 |
1 背景及相关工作 | 第11-20页 |
1.1 生物网络推断概述 | 第11-13页 |
1.2 蛋白质相互作用网络推断的背景及相关工作 | 第13-15页 |
1.3 疾病与基因关联网络预测的背景及相关工作 | 第15-18页 |
1.4 相关技术 | 第18-19页 |
1.4.1 排序整合 | 第18页 |
1.4.2 矩阵分解 | 第18页 |
1.4.3 凸优化 | 第18-19页 |
1.5 本章小结 | 第19-20页 |
2 基于排序整合和错误发现率控制的PPI预测 | 第20-38页 |
2.1 算法描述 | 第20-25页 |
2.1.1 数据预处理 | 第21-22页 |
2.1.2 排序整合 | 第22-25页 |
2.1.3 错误发现率的控制 | 第25页 |
2.2 模拟实验 | 第25-28页 |
2.3 真实数据实验 | 第28-36页 |
2.3.1 数据描述 | 第28-29页 |
2.3.2 结果分析与评估 | 第29-36页 |
2.4 本章小结 | 第36-38页 |
3 基于凸优化的疾病与基因关联网络推断算法 | 第38-54页 |
3.1 方法描述 | 第38-42页 |
3.1.1 方法概述 | 第38页 |
3.1.2 详细描述 | 第38-41页 |
3.1.3 参数估计 | 第41-42页 |
3.2 模拟实验 | 第42-50页 |
3.2.1 简单数据模拟 | 第43-46页 |
3.2.2 生物特性数据模拟 | 第46-49页 |
3.2.3 参数影响 | 第49-50页 |
3.3 实际数据实验 | 第50-53页 |
3.4 本章小结 | 第53-54页 |
结论 | 第54-55页 |
参考文献 | 第55-59页 |
攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第59-60页 |
致谢 | 第60-61页 |