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结核分枝杆菌干扰巨噬细胞自噬的初步研究

摘要第6-8页
ABSTRACT第8-9页
缩略词表第10-12页
第一章 文献综述第12-22页
    引言第12页
    1.1 结核分枝杆菌与巨噬细胞的相互作用第12-16页
        1.1.1 细胞免疫与结核分枝杆菌第13页
        1.1.2 自噬与结核分枝杆菌第13-14页
        1.1.3 活性氧成分与结核分枝杆菌第14-15页
        1.1.4 结核分枝杆菌在宿主中的生存机制第15-16页
    1.2 CRISPR-Cas系统在基因敲入和基因干扰中的应用第16-19页
        1.2.1 CRISPR-Cas系统与基因敲入第17-18页
        1.2.2 CRISPR-Cas系统与真核细胞基因干扰第18-19页
    1.3 双荧光指示系统与细胞自噬第19-22页
        1.3.1 pH敏感型GFP第19-20页
        1.3.2 串联蛋白GFPph-mCherry-LC3与自噬监视第20-22页
第二章 目的与意义第22-23页
第三章 材料与方法第23-39页
    3.1 试验材料第23-27页
        3.1.1 细胞、菌株、质粒及培养条件第23页
        3.1.2 实验仪器及耗材第23-24页
        3.1.3 主要的工具酶、抗体及试剂第24-25页
        3.1.4 主要培养基、抗生素及其配置第25-26页
        3.1.5 缓冲液及其配置第26-27页
        3.1.6 主要的生物学分析软件第27页
    3.2 试验方法第27-39页
        3.2.1 结核分枝杆菌H37Ra及耻垢分枝杆菌mc2155感受态的制备第27页
        3.2.2 结核分枝杆菌的电击转化第27页
        3.2.3 sgRNA的设计及合成第27-28页
        3.2.4 G418筛选浓度及维持浓度的确定第28-29页
        3.2.5 Raw264.7 细胞的转染及后期筛选第29页
        3.2.6 雷帕霉素诱导细胞自噬的分析第29-30页
        3.2.7 CRISPRi/CRISPRa系统的构建第30-31页
        3.2.8 细胞基因组的提取第31页
        3.2.9 Western Blot实验第31-32页
        3.2.10 以氯化钙法制备感受态细胞第32-33页
        3.2.11 相关引物的设计及合成第33-34页
        3.2.12 常规分子克隆实验第34-39页
第四章 技术路线第39-40页
第五章 结果和分析第40-50页
    5.1 结核分枝杆菌H37Ra表达CFP菌株的构建与鉴定第40-41页
        5.1.1 CFP重组表达质粒的构建第40页
        5.1.2 H37Ra的BFP/CFP荧光表达菌株的鉴定第40-41页
    5.2 双荧光巨噬细胞系的构建及验证第41-46页
        5.2.1 G418工作浓度的筛选第41-42页
        5.2.2 CRISPR相关剪切质粒的构建第42页
        5.2.3 EGFP基因序列的改造第42-43页
        5.2.4 同源重组片段的克隆第43页
        5.2.5 稳定转染细胞系的构建及初步筛选第43-45页
        5.2.6 细胞系GFPph-mCerry-LC3融合蛋白表达检测第45页
        5.2.7 细胞系指示自噬的功能验证第45-46页
    5.3 干扰自噬相关结核蛋白的筛选第46-47页
    5.4 鼠源自噬基因gRNA文库的构建第47-50页
        5.4.1 CRISPRi/CRISPRa系统功能验证第47-48页
        5.4.2 相关鼠源自噬基因的筛选及gRNA设计第48-50页
第六章 讨论与结论第50-53页
    6.1 青色荧光结核分枝杆菌的构建第50-51页
    6.2 双荧光巨噬细胞系的构建第51-52页
    6.3 结核蛋白Rv0847对自噬的干扰的初步研究第52页
    6.4 结论第52-53页
参考文献第53-63页
致谢第63页

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