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运用多座位外显方差法分析荷斯坦牛候选基因与乳房炎易感性的关系

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
第一章 文献综述第10-20页
    1 奶牛乳房炎的分类和临床表现第10-20页
        1.1 乳房炎的分类第10页
            1.1.1 临床乳房炎第10页
            1.1.2 隐性乳房炎第10页
            1.1.3 慢性乳房炎第10页
        1.2 隐性乳房炎的危害第10-11页
            1.2.1 隐性乳房炎造成产奶量下降第10-11页
            1.2.2 隐性乳房炎使乳汁营养成分下降第11页
            1.2.3 隐性乳房炎影响食品卫生及人体健康第11页
            1.2.4 隐性乳房炎造成严重的经济损失第11页
        1.3 奶牛乳房炎抗性相关候选基因的研究进展第11-14页
            1.3.1 白介素-8及其受体基因的研究进展第11-12页
            1.3.2 TLR4基因的研究进展第12-14页
            1.3.3 溶菌酶(LYSOZYME)基因的研究进展第14页
        1.4 乳房炎抗性的分子遗传学研究第14-16页
            1.4.1 候选基因法第15页
            1.4.2 数量性状位点定位法第15页
            1.4.3 分子标记法第15-16页
        1.5 多基因聚合目前的研究现状第16-19页
            1.5.1 多因子降维法第16-17页
            1.5.2 LOGISTIC回归模型第17页
            1.5.3 MPVA(MULTI-LOCUS PENETRANCE VARIANCE ANALYSIS)法第17-18页
            1.5.4 贝叶斯网络(BAYESIAN NETWORKS)法第18-19页
        1.6 研究的目的和意义第19-20页
第二章 IL8、CXCR1、TLR4、LYZ和LF基因的多态性第20-33页
    1 材料与方法第20-24页
        1.1 实验材料第20-22页
            1.1.1 样本采集第20页
            1.1.2 主要仪器第20页
            1.1.3 实验试剂第20-21页
            1.1.4 主要试剂配制第21-22页
        1.2 实验方法第22-24页
            1.2.1 DNA浓度和纯度的检测第22页
            1.2.2 引物设计及PCR扩增第22-24页
            1.2.4 分析工具第24页
            1.2.5 SSCP分析第24页
            1.2.6 PCR产物的的直接测序第24页
    2 结果与分析第24-31页
        2.1 IL8基因SNP分析第24-26页
        2.2 CXCR1基因SNP分析第26-27页
        2.3 LYZ基因的SNP分析第27-28页
        2.4 TLR4基因SNP分析第28-30页
            2.4.1 PCR-RFLP结果第28-29页
            2.4.2 PCR-SSCP分析第29-30页
        2.5 LF基因SNP分析第30-31页
            2.5.1 PCR-RFLP结果第30页
            2.5.2 PCR-SSCP分析第30-31页
        2.6 所有基因位点汇总第31页
    3 讨论第31-33页
第三章 聚合模型分析第33-38页
    1 材料与方法第33-36页
        1.1 数据来源第33页
        1.2 奶牛乳房炎易感性的判定第33页
        1.3 数据分析第33-36页
            1.3.1 MPVA运算步骤第33-34页
            1.3.2 MPVA软件主界面第34-35页
            1.3.3 MPVA软件数据导入格式第35-36页
            1.3.4 MPVA软件操作说明第36页
    2 结果第36-37页
    3 讨论第37-38页
第四章 聚合模型的验证第38-45页
    引言第38页
    1 材料与方法第38-39页
        1.1 采样及生产性能记录第38页
        1.2 奶牛乳房炎易感性的判定第38页
        1.3 引物设计第38页
        1.4 PCR-SSCP方法第38页
        1.5 基因型排列分组第38-39页
    2 结果与分析第39-43页
        2.1 CXCR1-1830、CXCR1-1768、CXCR1783位点的SNP分析第39-40页
            2.1.1 基因型频率与等位基因频率第40页
        2.2 IL85'位点的SNP分析第40-41页
            2.2.1 IL-8基因5'侧翼区的基因型频率和等位基因频率第41页
        2.3 LF基因5'侧翼区-3727(C>G)&-3717(A>G)位点的SNP分析第41-42页
            2.3.1 LF基因5'侧翼区的基因型频率和等位基因频率第41-42页
        2.4 LYZ位点的SNP分析第42-43页
            2.4.1 LYZ位点的基因型频率和等位基因频率第42-43页
    3 数据分析第43-44页
    4 讨论第44-45页
全文结论第45-46页
参考文献第46-52页
致谢第52-53页
攻读学位期间发表和参与发表的学术论文目录第53-54页

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