基于BWT的DNA从头测序重叠群生成算法
| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5页 |
| 第1章 绪论 | 第8-17页 |
| 1.1 课题背景 | 第8-10页 |
| 1.2 研究目的和意义 | 第10-12页 |
| 1.3 国内外研究现状和分析 | 第12-13页 |
| 1.4 本文主要研究内容 | 第13-17页 |
| 第2章 序列拼接模型的建立 | 第17-26页 |
| 2.1 初始数据分析 | 第17-21页 |
| 2.2 建立序列拼接模型 | 第21-23页 |
| 2.3 模型求解 | 第23-25页 |
| 2.4 本章小结 | 第25-26页 |
| 第3章 BWT 索引的建立 | 第26-38页 |
| 3.1 BWT 原理和作用 | 第26-27页 |
| 3.2 BWT 索引的建立 | 第27-31页 |
| 3.3 BWT 匹配算法 | 第31-37页 |
| 3.3.1 向前匹配 | 第31-33页 |
| 3.3.2 向后匹配 | 第33-37页 |
| 3.4 本章小结 | 第37-38页 |
| 第4章 contig 生成算法 | 第38-48页 |
| 4.1 最优重叠查找算法 | 第39-42页 |
| 4.2 contig 的延伸算法 | 第42-46页 |
| 4.3 contig 的修剪算法 | 第46-47页 |
| 4.4 本章小结 | 第47-48页 |
| 第5章 系统的运行结果及评价 | 第48-56页 |
| 5.1 系统的输入与输出 | 第48-49页 |
| 5.2 评价内容 | 第49-51页 |
| 5.3 评价方法 | 第51-53页 |
| 5.4 评价结果 | 第53-55页 |
| 5.5 本章小结 | 第55-56页 |
| 结论 | 第56-57页 |
| 参考文献 | 第57-61页 |
| 致谢 | 第61页 |
