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麦类作物染色体重排与淀粉代谢相关基因的鉴定

摘要第9-13页
Abstract第13-17页
第1章 文献综述第18-30页
    1.1 染色体结构变异第19-21页
    1.2 小麦染色体结构变异第21-23页
    1.3 淀粉概述第23-24页
    1.4 淀粉生物合成机制第24-27页
        1.4.1 直链淀粉的合成第25-26页
        1.4.2 支链淀粉的合成第26-27页
    1.5 淀粉生物降解机制第27-28页
        1.5.1 叶片中的淀粉降解途径第27页
        1.5.2 种子中淀粉降解途径第27-28页
    1.6 立题依据和研究内容第28-30页
第2章 基于基因序列分析小麦4A-5A-7B染色体易位和倒位第30-38页
    2.1 前言第30-31页
    2.2 材料与方法第31-32页
    2.3 结果与分析第32-35页
        2.3.1 5AL染色体上基因的具体分布第32页
        2.3.2 7BS染色体上基因的具体分布第32-33页
        2.3.3 ‘4AL’染色体上基因的具体分布第33-34页
        2.3.4 ‘4AS’染色体上基因的具体分布第34-35页
    2.4 讨论第35-38页
第3章 基于全基因组扫描普通小麦‘中国春’基因型中的染色体臂间倒位第38-52页
    3.1 前言第38-39页
    3.2 材料与方法第39-41页
        3.2.1 数据搜集第39页
        3.2.2 染色体臂间重排分析第39-40页
        3.2.3 小麦4A染色体的结构说明第40页
        3.2.4 3B染色体臂的鉴定第40-41页
        3.2.5 基于PCR方法验证基因染色体位置第41页
    3.3 结果与分析第41-47页
        3.3.1 1A染色体上的臂间重排分析第43-44页
        3.3.2 第四同源群中的臂间重排分析第44-46页
        3.3.3 第二、三、五、六和七同源群的染色体重排现象分析第46-47页
    3.4 讨论第47-52页
        3.4.1 臂间倒位是一个比较普遍的现象第47-48页
        3.4.2 臂间倒位是否存在于整倍体的‘中国春’小麦中?第48-50页
        3.4.3 臂间倒位集中于着丝粒附近的区域第50-51页
        3.4.4 ‘4AS’末端出现一个与4BS和4DS同源的倒位片段第51-52页
第4章 基于全基因组分析小麦‘中国春’染色体间的重排现象第52-62页
    4.1 前言第52-53页
    4.2 材料与方法第53-54页
        4.2.1 数据搜集与分析第53-54页
        4.2.2 小麦4A染色体的结构说明第54页
        4.2.3 基于PCR方法验证基因染色体位置第54页
    4.3 结果与分析第54-60页
    4.4 讨论第60-62页
第5章 糯大麦突变体waxy基因分子鉴定与表达分析第62-79页
    5.1 前言第62-63页
    5.2 材料与方法第63-67页
        5.2.1 植物材料第63-64页
        5.2.2 淀粉测定第64页
        5.2.3 SDS-PAGE凝胶电泳第64页
        5.2.4 waxy基因启动子和开放阅读框的分离第64-65页
        5.2.5 实时定量PCR(RT-qPCR)第65页
        5.2.6 瞬时表达分析第65-67页
        5.2.7 淀粉籽粒扫描电镜分析第67页
        5.2.8 数据整理第67页
    5.3 结果与分析第67-76页
        5.3.1 淀粉含量测定和GBSS I蛋白鉴定第67-68页
        5.3.2 waxy基因的分离和特征性分析第68-71页
        5.3.3 waxy基因的表达分析第71页
        5.3.4 其他几个淀粉代谢基因的表达分析第71-72页
        5.3.5 启动子分析第72-75页
        5.3.6 淀粉结构观测第75-76页
    5.4 讨论第76-79页
第6章 大麦籽粒皱缩突变体鉴定第79-90页
    6.1 前言第79-80页
    6.2 材料与方法第80-84页
        6.2.1 植物材料第80-82页
        6.2.2 淀粉测定第82页
        6.2.3 SDS-PAGE凝胶电泳第82页
        6.2.4 waxy基因的分离第82页
        6.2.5 实时定量PCR(RT-qPCR)第82页
        6.2.6 淀粉籽粒扫描电镜分析第82页
        6.2.7 数据整理第82-84页
    6.3 结果与分析第84-88页
        6.3.1 淀粉测定和颗粒结合蛋白鉴定第84页
        6.3.2 淀粉代谢主要基因的表达分析第84页
        6.3.3 waxy基因分离鉴定第84-87页
        6.3.4 淀粉结构第87-88页
    6.4 讨论第88-90页
第7章 大麦淀粉磷酸化酶基因的结构与表达分析第90-108页
    7.1 前言第90-91页
    7.2 材料与方法第91-96页
        7.2.1 植物材料第91-92页
        7.2.2 数据搜集第92-93页
        7.2.3 Pho1和Pho2基因的分离第93页
        7.2.4 实时定量PCR(RT-qPCR)第93页
        7.2.5 基因结构和蛋白结构分析第93页
        7.2.6 多重比对和进化分析第93-94页
        7.2.7 启动子区顺式作用元件的分析第94-95页
        7.2.8 表达模式分析第95-96页
    7.3 结果与分析第96-106页
        7.3.1 Pho1和Pho2基因的特征性分析第96-98页
        7.3.2 蛋白结构和进化树分析第98-101页
        7.3.3 表达分析HvPho1和HvPho2基因第101-102页
        7.3.4 启动子分析和基于芯片技术的表达分析第102-106页
    7.4 讨论第106-108页
第8章 表达分析大麦磷酸酶基因starch excess 4第108-124页
    8.1 前言第108-109页
    8.2 材料与方法第109-115页
        8.2.1 植物材料第109-110页
        8.2.2 数据搜集第110页
        8.2.3 SEX4基因的分离第110-112页
        8.2.4 SEX4基因的染色体定位第112-113页
        8.2.5 实时定量PCR(RT-qPCR)第113页
        8.2.6 基因结构和蛋白结构分析第113页
        8.2.7 多重比对和进化分析第113页
        8.2.8 启动子区顺式作用元件的分析第113-114页
        8.2.9 表达模式分析第114-115页
    8.3 结果与分析第115-122页
        8.3.1 SEX4基因的分离和染色体定位第115-116页
        8.3.2 SEX4基因结构第116-117页
        8.3.3 蛋白结构和进化树分析第117-119页
        8.3.4 SEX4基因的组织特异性表达分析第119-120页
        8.3.5 SEX4基因昼夜节律表达分析第120-121页
        8.3.6 SEX4基因在胁迫下的表达调控分析第121-122页
    8.4 讨论第122-124页
第9章 淀粉磷酸酶基因Like Sex Four1和Like Sex Four2具有不同生物学功能第124-138页
    9.1 前言第124-125页
    9.2 材料与方法第125-127页
        9.2.1 数据搜集第125页
        9.2.2 LSF1和LSF2基因的鉴定第125页
        9.2.3 LSF1和LSF2基因的染色体定位第125页
        9.2.4 基因结构和蛋白结构分析第125页
        9.2.5 多重比对和进化分析第125-126页
        9.2.6 启动子区顺式作用元件的分析第126页
        9.2.7 表达模式分析第126-127页
    9.3 结果与分析第127-136页
        9.3.1 LSF1和LSF2基因的鉴定和染色体定位第127-128页
        9.3.2 LSF1和LSF2基因的结构分析第128-129页
        9.3.3 蛋白结构和进化分析第129页
        9.3.4 LSF1和LSF2基因的组织特异性表达分析第129-132页
        9.3.5 LSF1和LSF2基因昼夜节律性分析第132-133页
        9.3.6 LSF1和LSF2在胁迫下的表达调控分析第133-136页
    9.4 讨论第136-138页
参考文献第138-149页
附录第149-244页
    附表第149-229页
    附图第229-244页
致谢第244-246页
攻读博士学位期间发表的论文第246-247页

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