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产酶溶杆菌转录因子LeClp调控几丁质酶和次级代谢产物生物合成的机制研究

摘要第7-9页
ABSTRACT第9-10页
上篇 文献综述第11-26页
    1 溶杆菌的分类及鉴定第12页
    2 产酶溶杆菌的生物学特性第12-20页
        2.1 胞外水解酶第14-16页
        2.2 次级代谢产物第16-20页
    3 产酶溶杆菌调控机理方面的研究进展第20-22页
        3.1 产酶溶杆菌中ctp的功能第20-21页
        3.2 产酶溶杆菌中cel的功能第21页
        3.3 产酶溶杆菌中tatC的功能第21页
        3.4 产酶溶杆菌中rpfG的功能第21页
        3.5 产酶溶杆菌中rpfF的功能第21页
        3.6 产酶溶杆菌中lenB2的功能第21-22页
        3.7 产酶溶杆菌中lesR的功能第22页
        3.8 产酶溶杆菌中物的功能第22页
    4 全局性调控因子CLP的功能研究第22-23页
        4.1 Clp的研究概述第22-23页
        4.2 产酶溶杆菌中Clp的研究进展第23页
    5 转录因子的研究方法第23-24页
    6 本文的研究目的及意义第24-26页
下篇 研究内容第26-89页
    第一章 产酶溶杆菌全局性调控因子LeClp的蛋白表达与功能分析第27-41页
        1 材料与方法第29-35页
            1.1 材料第29页
            1.2 方法第29-35页
        2 结果与分析第35-38页
            2.1 LeClp蛋白原核表达载体的验证第35-36页
            2.2 LeClp蛋白的原核表达诱导第36-37页
            2.3 LeClp蛋白的定量和Western杂交验证第37-38页
            2.4 MST检测LeClp与c-di-GMP结合第38页
        3 讨论第38-41页
    第二章 全局性调控因子LECLP调控几丁质酶生物合成的机制研究第41-59页
        1 材料与方法第42-48页
            1.1 材料第42-43页
            1.2 方法第43-48页
        2 结果与分析第48-58页
            2.1 chiA互补菌株构建以及几丁质酶活性检测第48页
            2.2 Leclp位于chiA上游,并调控几丁质酶的生物合成第48-49页
            2.3 生物信息学分析猜测LeClp通过直接结合在chiA的启动子区来调控几丁质酶的生物活性第49-50页
            2.4 体外实验证明LeClp通过直接结合在chiA的启动子区来调控几丁质酶的生物活性第50-53页
            2.5 体内实验证明LeClp通过直接结合在chiA的启动子区来调控几丁质酶的生物活性第53-56页
            2.6 c-di-GMP的添加并未影响LeClp与chiA基因的启动子区的结合第56-57页
            2.7 推测LeClp与chiA基因的启动子区的结合在产酶溶杆菌中是保守的第57-58页
        3 讨论第58-59页
    第三章 全局性调控因子LECLP调控次级代谢产物HSAF生物合成的机制研究第59-77页
        1 材料与方法第60-65页
            1.1 材料第60-61页
            1.2 方法第61-65页
        2 结果与分析第65-74页
            2.1 生物信息学分析猜测LeClp通过直接结合在pks/nrps基因的启动子区来调控HSAF的生物合成第65-66页
            2.2 体外实验证明LeClp通过直接结合在pks/nrps基因的启动子区来调控HSAF的生物合成第66-68页
            2.3 c-di-GMP的添加并未影响LeClp与pks/nrps基因的启动子区的结合第68-69页
            2.4 HTH结构域双过表达菌株的构建与验证第69-71页
            2.5 LesR中HTH结构域通过调控Leclp来调控HSAF的合成第71-72页
            2.6 Western实验揭示LeClp在蛋白水平受到LesR的调控第72-73页
            2.7 RNA-Seq结果揭示Leclp和lesR在基因调控方面的协同作用第73-74页
        3 讨论第74-77页
    第四章 全局性调控因子LECLP调控次级代谢产物WAP-8294A2生物合成的机制研究第77-89页
        1 材料与方法第78-81页
            1.1 材料第78-79页
            1.2 方法第79-81页
        2 结果与分析第81-87页
            2.1 WAP-8294A2生物合成基因簇启动子分析第81-82页
            2.2 细菌单杂交实验证明LeClp无法直接结合在WAP-8294A2合成基因簇的启动子区来调控WAP-8294A2的生物合成第82页
            2.3 ChIP-Seq方法寻找LeClp直接结合的因子第82-84页
            2.4 ChIP-Seq数据的验证第84页
            2.5 LeClp通过直接结合在OH11-1052启动子区来调控WAP-8294A2的生物合成第84-86页
            2.6 c-di-GMP的添加并未影响LeClp与OH11-1052基因的启动子区的结合第86-87页
        3 讨论第87-89页
参考文献第89-97页
全文总结第97-99页
本论文创新点第99-101页
附录一第101-107页
附录二第107-113页
    1 培养基配制第107-108页
    2 试剂及溶液配制第108-113页
致谢第113-115页
攻读博士期间发表的论文第115页

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