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RBSDV与SRBSDV病毒质蛋白P9-1结合单链RNA的结构与生化特性研究

摘要第7-9页
ABSTRACT第9-11页
第一章 文献综述第12-36页
    1 两种水稻黑条矮缩病毒病的概述第12-19页
        1.1 水稻黑条矮缩病毒病第12-15页
            1.1.1 水稻黑条矮缩病毒病的发生与危害第12-13页
            1.1.2 水稻黑条矮缩病毒病的发病症状及传播媒介第13-15页
        1.2 南方水稻黑条矮缩病毒病第15-19页
            1.2.1 南方水稻黑条矮缩病毒的发现第15-16页
            1.2.2 南方水稻黑条矮缩病毒病的发生与危害第16页
            1.2.3 南方水稻黑条矮缩病毒病的发病症状及传播媒介第16-19页
    2 两种水稻黑条矮缩病毒的分子生物学特性第19-28页
        2.1 水稻黑条矮缩病毒(RBSDV)的基因组及其所编码的蛋白第19-24页
            2.1.1 RBSDV病毒粒体第19页
            2.1.2 RBSDV的基因组结构第19-21页
            2.1.3 RBSDV编码的蛋白及其生物学功能第21-23页
            2.1.4 RBSDV病毒蛋白的互作研究第23-24页
        2.2 南方水稻黑条矮缩病毒(SRBSDV)的基因组及其所编码的蛋白第24-28页
            2.2.1 SRBSDV病毒粒体第24-25页
            2.2.2 SRBSDV的基因组结构第25-26页
            2.2.3 SRBSDV编码的蛋白及其生物学功能第26-28页
            2.2.4 SRBSDV病毒蛋白的互作研究第28页
    3 呼肠孤病毒的复制第28-36页
        3.1 呼肠孤病毒的侵染与复制第28-30页
        3.2 呼肠孤病毒的复制场所第30-33页
            3.2.1 呼肠孤病毒的病毒质(包涵体)结构第31-32页
            3.2.2 病毒质蛋白形成病毒质(包涵体)的特点第32页
            3.2.3 病毒质蛋白的生物学特性第32-33页
        3.3 斐济病毒属病毒质及病毒质蛋白的研究进展第33-36页
第二章 RBSDV病毒质蛋白P9-1结合单链RNA的结构与生化特性研究第36-70页
    1 材料第36-37页
    2 试验方法第37-49页
        2.1 表达载体及体外转录载体的构建第37-42页
            2.1.1 PCR扩增片段第37-38页
            2.1.2 割胶回收第38页
            2.1.3 酶切第38-39页
            2.1.4 连接第39-40页
            2.1.5 感受态细胞DH5α制备及转化第40页
            2.1.6 菌落PCR筛选阳性克隆第40-41页
            2.1.7 质粒小提第41-42页
            2.1.8 测序第42页
            2.1.9 序列分析第42页
        2.2 蛋白原核表达第42-47页
            2.2.1 感受态细胞Rosstta(DE3)制备及转化第42页
            2.2.2 原核表达第42-44页
            2.2.3 烟草蚀纹病毒(TEV)切割蛋白第44页
            2.2.4 蛋白透析第44页
            2.2.5 蛋白浓度定量第44-45页
            2.2.6 SDS-PAGE第45页
            2.2.7 Western Blot第45-46页
            2.2.8 非变性蛋白胶(Blue Native PAGE)第46页
            2.2.9 分子筛层析法(Size Exclusion Chromatography, SEC)第46-47页
        2.3 体外转录第47-48页
            2.3.1 RNA体外转录第47-48页
            2.3.2 RNA纯化回收第48页
        2.4 凝胶阻滞实验第48-49页
    3 结果与分析第49-66页
        3.1 RBSDV P9-1蛋白体外表达纯化及结合单链RNA特性鉴定第49-50页
        3.2 RBSDV P9-1蛋白优先结合单链核酸但不具有结合特异性第50-51页
        3.3 RBSDV P9-1蛋白与单链RNA结合形成不同迁移大小的核酸蛋白复合体第51-53页
        3.4 RBSDV P9-1蛋白形成一系列多聚体状态第53-55页
        3.5 RBSDV P9-1蛋白优先以八体结构结合单链RNA第55-57页
        3.6 RBSDV P9-1 C端手臂缺失突变体不再形成八体并且影响对单链RNA的结合第57-60页
        3.7 RBSDVP9-1结合RNA的重要结构域及在P9-1三维晶体结构中的定位第60-63页
        3.8 RBSDVP9-1重要结构域中带正电荷氨基酸对结合RNA具有关键作用第63-66页
    4 讨论第66-70页
第三章 SRBSDV病毒质蛋白P9-1结合单链RNA的结构与生化特性研究第70-84页
    1 材料第70页
    2 试验方法第70-71页
        2.1 载体构建第71页
    3 结果与分析第71-80页
        3.1 SRBSDV P9-1蛋白形成多种多聚体蛋白类型第71-72页
        3.2 SRBSDV P9-1蛋白具有单链RNA结合活性第72-73页
        3.3 SRBSDV P9-1蛋白优先以高聚体蛋白形式结合单链RNA第73-75页
        3.4 SRBSDV P9-1蛋白C端手臂对该蛋白形成多体类型及结合单链RNA能力的影响第75-78页
        3.5 SRBSDV P9-1 N端带正电荷氨基酸是重要的RNA结合位点第78页
        3.6 SRBSDV P9-1蛋白131-160位氨基酸残基序列对RBSDV P9-1蛋白结合单链RNA能力的影响第78-80页
    4 讨论第80-84页
第四章 全文总结第84-86页
    1 全文总结第84-85页
        1.1 RBSDV病毒质蛋白P9-1结合单链RNA的结构与生化特性研究第84页
        1.2 SRBSDV病毒质蛋白P9-1结合单链RNA的结构与生化特性研究第84-85页
    2 本研究创新点第85-86页
参考文献第86-94页
附录A 番茄斑萎病毒侵染性克隆的相关研究第94-110页
附录B 本论文主要的重要缩写词及中文对照第110-112页
附录C 本研究所用的引物第112-116页
附录D 本研究所用溶液、缓冲液及培养基配方第116-122页
附录E 研究生期间发表的学术论文第122-124页
致谢第124页

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