| 摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-11页 |
| 缩略词中英文对照 | 第11-13页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-31页 |
| 1 转录组的研究概况 | 第13-21页 |
| ·转录组简介 | 第14-15页 |
| ·研究转录组的基本方法 | 第15-17页 |
| ·转录组分析的基本流程 | 第17-18页 |
| ·测序平台简介 | 第18-20页 |
| ·转录组数据注释常用的数据库 | 第20-21页 |
| 2 microRNA的研究进展 | 第21-30页 |
| ·microRNA的发现历程 | 第22-23页 |
| ·microRNA的产生与加工 | 第23-25页 |
| ·microRNA的特征与鉴定 | 第25-28页 |
| ·microRNA的调控机理 | 第28页 |
| ·microRNA的功能研究 | 第28-30页 |
| 3 本文研究内容 | 第30-31页 |
| 第二章 基于小菜蛾转录组数据的microRNA预测 | 第31-43页 |
| 摘要 | 第31页 |
| 1 材料与方法 | 第31-33页 |
| ·数据来源 | 第31-32页 |
| ·原始数据组装和注释 | 第32页 |
| ·转录组中的microRNA预测 | 第32页 |
| ·数据验证 | 第32-33页 |
| 2 结果与分析 | 第33-41页 |
| ·转录组数据处理 | 第33-34页 |
| ·microRNA预测结果 | 第34-35页 |
| ·microRNA的分布 | 第35页 |
| ·microRNA的长度统计 | 第35-36页 |
| ·microRNA二级结构预测及与成熟体保守情况 | 第36-39页 |
| ·microRNA表达分析 | 第39-40页 |
| ·小RNA文库验证 | 第40-41页 |
| 3 讨论 | 第41-43页 |
| 第三章 小菜蛾microRNA与靶基因的互作 | 第43-55页 |
| 摘要 | 第43-44页 |
| 1 材料与方法 | 第44页 |
| ·数据来源 | 第44页 |
| ·小菜蛾microRNA靶标预测 | 第44页 |
| ·靶标基因注释与分析 | 第44页 |
| 2 结果与分析 | 第44-53页 |
| ·microRNA靶标分析 | 第44-46页 |
| ·靶标基因与microRNA的相互作用关系 | 第46-48页 |
| ·靶基因在GO数据库中的注释情况 | 第48-49页 |
| ·靶基因在KEGG数据库中的分类 | 第49-50页 |
| ·microRNA在代谢相关通路中的协同作用 | 第50-53页 |
| 3 讨论 | 第53-55页 |
| 第四章 昆虫转录组中抗药性相关的microRNA靶标预测 | 第55-69页 |
| 摘要 | 第55-56页 |
| 1 材料与方法 | 第56-57页 |
| ·数据来源 | 第56页 |
| ·数据组装和注释 | 第56页 |
| ·抗药性相关的基因序列搜索 | 第56页 |
| ·鳞翅目昆虫转录组中Bt毒素受体相关基因的进化分析 | 第56-57页 |
| ·抗药性相关基因的3'UTR预测 | 第57页 |
| ·抗药性相关的microRNA | 第57页 |
| 2 结果与分析 | 第57-65页 |
| ·转录组数据处理 | 第57页 |
| ·农药受体相关基因 | 第57-59页 |
| ·Bt毒素受体相关基因 | 第59-60页 |
| ·Bt毒素受体相关基因的进化分析 | 第60-64页 |
| ·抗药性相关基因3’UTR序列的发现 | 第64-65页 |
| ·与抗药性相关的microRNA基因 | 第65页 |
| 3 讨论 | 第65-69页 |
| 全文总结 | 第69-71页 |
| 附录一：小菜蛾microRNA预测结果 | 第71-76页 |
| 附录二：小菜蛾microRNA在四个发育时期的分布 | 第76-81页 |
| 参考文献 | 第81-89页 |
| 攻读硕士学位期间学术论文发表情况 | 第89-91页 |
| 致谢 | 第91页 |
