| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 目录 | 第7-10页 |
| 1 前言 | 第10-21页 |
| ·香蕉 | 第10页 |
| ·香蕉枯萎病 | 第10-14页 |
| ·香蕉枯萎病的病原菌 | 第10-11页 |
| ·香蕉枯萎病的分布与危害 | 第11页 |
| ·香蕉枯萎病菌的生物学特性 | 第11-12页 |
| ·香蕉枯萎病的症状与传播 | 第12页 |
| ·香蕉枯萎病的防治 | 第12-14页 |
| ·检验检疫 | 第13页 |
| ·选育和利用抗性品种 | 第13页 |
| ·香蕉枯萎病的化学防治 | 第13-14页 |
| ·香蕉枯萎病的生物防治 | 第14页 |
| ·香蕉基因组测序计划 | 第14-15页 |
| ·香蕉转录组学研究进展 | 第15-16页 |
| ·数字基因表达谱测序技术 | 第16-17页 |
| ·半定量RT-PCR技术 | 第17页 |
| ·cDNA末端快速扩增技术 | 第17-18页 |
| ·RACE技术的特点 | 第17-18页 |
| ·RACE技术的原理 | 第18页 |
| ·本研究的目的意义、内容与技术路线 | 第18-21页 |
| ·目的与意义 | 第18-19页 |
| ·研究内容 | 第19-20页 |
| ·技术路线 | 第20-21页 |
| 2 材料与方法 | 第21-36页 |
| ·植物材料与枯萎病病原菌 | 第21页 |
| ·主要仪器及试剂 | 第21-22页 |
| ·尖孢镰刀菌古巴专化型的活化与培养 | 第22页 |
| ·香蕉的枯萎病接种与取样 | 第22-23页 |
| ·数字基因表达谱测序 | 第23页 |
| ·香蕉基因表达谱的生物信息学分析 | 第23-26页 |
| ·测序质量评估分析 | 第24页 |
| ·基因表达量统计 | 第24-25页 |
| ·差异表达基因统计分析 | 第25页 |
| ·Gene Ontology功能显著性富集分析 | 第25-26页 |
| ·Pathway显著性富集分析 | 第26页 |
| ·香蕉叶片总RNA提取方法与检测 | 第26-27页 |
| ·香蕉总RNA提取的器具准备 | 第26页 |
| ·香蕉叶片总RNA提取 | 第26-27页 |
| ·香蕉叶片总RNA的质量检测 | 第27页 |
| ·半定量RT-PCR | 第27-31页 |
| ·RT-PCR引物设计 | 第27-29页 |
| ·cDNA第一链的合成 | 第29-30页 |
| ·半定量RT-PCR扩增 | 第30-31页 |
| ·cDNA全长的扩增与分析 | 第31-36页 |
| ·基因cDNA全长扩增的引物设计 | 第31-32页 |
| ·RACE-Ready cDNA的准备 | 第32页 |
| ·巢式PCR快速扩增显著差异基因cDNA末端 | 第32-33页 |
| ·基因扩增片段的切胶回收 | 第33-34页 |
| ·扩增片段与T载体的连接 | 第34页 |
| ·重组质粒的遗传转化 | 第34页 |
| ·阳性克隆鉴定 | 第34-35页 |
| ·目的基因片段的测序及生物信息学分析 | 第35-36页 |
| 3 结果与分析 | 第36-79页 |
| ·病原菌的活化情况 | 第36页 |
| ·香蕉枯萎病尖孢镰刀菌接种 | 第36-37页 |
| ·香蕉的数字基因表达谱测序结果 | 第37-64页 |
| ·测序数据统计分析 | 第37-38页 |
| ·测序质量评估 | 第38-39页 |
| ·测序饱和度分析 | 第39-40页 |
| ·测序随机性统计分析 | 第40-41页 |
| ·Reads在参考基因组上的分布分析 | 第41-42页 |
| ·基因表达量统计 | 第42-43页 |
| ·差异基因的筛选 | 第43-45页 |
| ·香蕉接种病原菌后不同时间点的差异表达基因 | 第45-47页 |
| ·Gene Ontology功能分类 | 第47-48页 |
| ·Gene Ontology显著性富集分析 | 第48-52页 |
| ·Pathway显著性富集分析 | 第52-56页 |
| ·植物与病原互作pathway分析 | 第56-64页 |
| ·差异表达基因的RT-PCR验证 | 第64-69页 |
| ·香蕉总RNA的检测结果 | 第64页 |
| ·植物与病原互作通路中显著差异基因的RT-PCR分析验证 | 第64-69页 |
| ·重要基因cDNA全长的扩增与分析 | 第69-74页 |
| ·GSMUA_Achr1T02750_001和GSMUA_AchrUn_randomT21800-001基因在染色体上的分布 | 第74-75页 |
| ·GSMUA_Achr1T02750_001和GSMUA AchrUn_randomT21800_001基因编码氨基酸预测 | 第75-77页 |
| ·GSMUA Achr1T02750_001和GSMUA_AchrUn_randomT21800_001蛋白结构域分析 | 第77-79页 |
| 4 讨论 | 第79-82页 |
| ·香蕉枯萎病病原菌接种方法的选择 | 第79页 |
| ·香蕉与枯萎病尖孢镰刀菌互作的分子机制推测 | 第79-81页 |
| ·尖孢镰刀菌枯萎病胁迫下香蕉根与叶片数字基因表达谱比较分析 | 第81页 |
| ·本研究后续工作 | 第81-82页 |
| 5 结论 | 第82-83页 |
| 参考文献 | 第83-88页 |
| 致谢 | 第88页 |
