人类基因启动子序列模式组织特异性显著性检验及功能分析
| 摘要 | 第1-4页 |
| ABSTRACT | 第4-8页 |
| 第一章 绪论 | 第8-15页 |
| ·研究背景和意义 | 第8-10页 |
| ·提出问题 | 第8页 |
| ·研究目的 | 第8-9页 |
| ·研究意义 | 第9-10页 |
| ·研究现状 | 第10-13页 |
| ·Motif 发现算法 | 第10-11页 |
| ·Motif 验证过程 | 第11-12页 |
| ·Motif 与组织功能映射 | 第12-13页 |
| ·论文的主要研究内容和工作 | 第13页 |
| ·论文的结构和安排 | 第13-15页 |
| 第二章 模式发现和验证方法技术概述 | 第15-25页 |
| ·人类组织特异性基因启动子序列的数据提取 | 第15-16页 |
| ·组织特异性模式的发现算法 | 第16-19页 |
| ·Motif 模型表示 | 第16-17页 |
| ·Motif 发现算法 | 第17-18页 |
| ·Motif 融合 | 第18-19页 |
| ·Motif 在单个组织中的评分排序过程 | 第19-23页 |
| ·贝叶斯假设检验 | 第19-20页 |
| ·传统假设检验 | 第20-22页 |
| ·二项分布假设检验 | 第22页 |
| ·核平滑子(Kernel Smooth) | 第22-23页 |
| ·组织特异性模式的验证和功能分析 | 第23-25页 |
| ·STAMP | 第23页 |
| ·JASPAR 数据库 | 第23-24页 |
| ·GOMO 和 ProfCom 工具 | 第24-25页 |
| 第三章 组织特异性模式发现算法的融合框架 | 第25-34页 |
| ·组织特异性模式发现算法的融合框架 | 第25-26页 |
| ·模式发现算法融合框架过程 | 第26-28页 |
| ·数据准备 | 第26页 |
| ·Motif 发现 | 第26-27页 |
| ·Motif 融合 | 第27-28页 |
| ·Motif 发现算法融合框架的数据和结果 | 第28-33页 |
| ·小结 | 第33-34页 |
| 第四章 组织特异性模式的组织特异性检验算法 | 第34-44页 |
| ·Motif 的组织特意性验证算法 | 第34-35页 |
| ·motif 的组织特异性检验过程 | 第35-40页 |
| ·motif 的三种假设检验评分过程 | 第36-38页 |
| ·核平滑子技术（Kernel smoother） | 第38-40页 |
| ·Motif 在组织中的显著性表达判断过程 | 第40页 |
| ·实验数据及结果 | 第40-43页 |
| ·Motif 的组织评分过程 | 第40-41页 |
| ·判断 motif 在组织中是否显著表达 | 第41-42页 |
| ·Motif 与 JASPAR 数据库对比结果 | 第42-43页 |
| ·小结 | 第43-44页 |
| 第五章 组织特异性模式的功能分析系统 | 第44-52页 |
| ·组织特异性模式的功能分析系统 | 第44-45页 |
| ·组织功能采集及实验结果 | 第45页 |
| ·Motif 功能采集及实验结果 | 第45-47页 |
| ·Motif 与组织功能映射过程及实验结果 | 第47-50页 |
| ·小结 | 第50-52页 |
| 第六章 结论与展望 | 第52-54页 |
| ·全文总结 | 第52-53页 |
| ·工作展望 | 第53-54页 |
| 参考文献 | 第54-56页 |
| 发表论文和参加科研情况说明 | 第56-57页 |
| 致谢 | 第57页 |
