基因启动子序列模式建模与发现
| 摘要 | 第1-4页 |
| ABSTRACT | 第4-8页 |
| 第一章 绪论 | 第8-13页 |
| ·研究背景与意义 | 第8-9页 |
| ·序列模式发现的问题描述及研究现状 | 第9-11页 |
| ·问题描述 | 第9页 |
| ·研究现状 | 第9-11页 |
| ·论文的研究内容和主要工作 | 第11-12页 |
| ·论文结构安排 | 第12-13页 |
| 第二章 基因启动子序列模式发现 | 第13-21页 |
| ·序列模式发现流程 | 第13-14页 |
| ·序列模式发现的数据源 | 第14-15页 |
| ·模拟数据集 | 第14页 |
| ·真实数据集 | 第14-15页 |
| ·序列模式发现工具 | 第15-16页 |
| ·序列模式建模 | 第16-18页 |
| ·模式相似性度量 | 第18-20页 |
| ·序列模式聚类分析 | 第20-21页 |
| 第三章 变长模式的定长建模方法 | 第21-29页 |
| ·序列模式特征信息 | 第21页 |
| ·基于特征向量的序列模式建模 | 第21-24页 |
| ·位置信息量的统计信息 | 第22-23页 |
| ·双碱基依赖性 | 第23-24页 |
| ·实验设计与结果分析 | 第24-28页 |
| ·实验设计 | 第24-25页 |
| ·结果分析 | 第25-28页 |
| ·讨论及本章小结 | 第28-29页 |
| 第四章 基于概率的序列模式相似性度量 | 第29-36页 |
| ·序列模式相似性度量 | 第29-30页 |
| ·基于概率的相似性度量 | 第30-32页 |
| ·实验设计与结果分析 | 第32-35页 |
| ·实验设计 | 第32-33页 |
| ·结果分析 | 第33-35页 |
| ·讨论及本章小结 | 第35-36页 |
| 第五章 基于无融合相似模式的层次聚类模式发现 | 第36-49页 |
| ·序列模式的聚类分析 | 第36页 |
| ·基于无融合相似模式的聚类分析 | 第36-41页 |
| ·聚类质量的评分函数 | 第37-38页 |
| ·聚类准确率的评估 | 第38-39页 |
| ·聚类族代表样本的选择 | 第39页 |
| ·序列模式的显著性计算 | 第39-40页 |
| ·序列模式的生物功能分析 | 第40-41页 |
| ·实验设计与结果分析 | 第41-48页 |
| ·两种不同聚类分析的实验结果与对比分析 | 第41-42页 |
| ·层次聚类的聚类族个数确定 | 第42-43页 |
| ·人类组织特异性基因的实验结果 | 第43-48页 |
| ·讨论及本章小结 | 第48-49页 |
| 第六章 总结与展望 | 第49-51页 |
| 参考文献 | 第51-55页 |
| 发表论文和参加科研情况说明 | 第55-56页 |
| 致谢 | 第56页 |
