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意蜂哺育蜂与采集蜂头部mRNAs与miRNAs表达谱Solexa测序比较分析及其调控网络研究

目录第1-10页
摘要第10-12页
Abstract第12-15页
主要英文缩写与译名第15-16页
第1章 文献综述第16-40页
   ·蜜蜂劳动分工调控因子研究概述第16-23页
     ·蜂群中劳动分工的调节第17-18页
     ·社会影响第18页
     ·生理影响第18-20页
     ·基因型变异第20-21页
     ·采集行为的成熟第21-22页
     ·级型比较的进化观点第22页
     ·小结第22-23页
   ·蜜蜂劳动分工相关的基因表达的研究进展第23-30页
     ·Period基因第24-26页
     ·乙酰胆碱脂酶第26-27页
     ·环状G-依赖性蛋白激酶第27页
     ·蜜蜂脑部EST计划第27-29页
     ·小结第29-30页
   ·蜜蜂领域的miRNA研究进展第30-33页
     ·miRNA的起源第31页
     ·miRNA的生物合成及其生物功能第31-32页
     ·miRNA在蜜蜂上的研究第32-33页
   ·第二代高通量测序技术第33-37页
     ·罗氏/454焦磷酸测序第34-35页
     ·SOLiD测序技术第35页
     ·Solexa测序技术第35-37页
   ·本研究的目的意义及主要研究内容第37-40页
     ·目的意义第37-39页
     ·主要研究内容第39-40页
第2章 哺育蜂与采集蜂头部mRNAs的检测第40-80页
   ·实验材料和方法第41-48页
     ·蜜蜂第41页
     ·RNA的提取第41-42页
     ·标签序列文库的构建和高通量测序第42-44页
     ·数据分析与统计第44-45页
     ·表达量分布统计第45页
     ·测序饱和度分析第45页
     ·标签的基因注释、标准化和确定基因的表达量第45-47页
     ·差异基因的筛选第47页
     ·Gene Ontology功能显著性富集分析第47-48页
     ·Pathway显著性富集分析第48页
   ·结果第48-73页
     ·检测结果和数据处理第48-49页
     ·表达量分布统计第49-51页
     ·标签基因注释、标准化和确定基因表达量第51-53页
     ·哺育蜂与采集蜂中差异表达基因检测结果第53-60页
     ·反义基因的注释第60-68页
     ·Gene Ontology功能显著性分析和pathway显著性富集分析第68-73页
   ·讨论第73-80页
     ·哺育蜂和采集蜂头部数字化基因表达谱第73页
     ·哺育蜂和采集蜂头部表达丰度最高的基因分析第73-74页
     ·哺育蜂和采集蜂头部差异基因分析第74-78页
     ·哺育蜂和采集蜂反义基因注释第78-79页
     ·GO功能显著性富集分析和KEGG pathway分析第79-80页
第3章 哺育蜂与采集蜂头部microRNAs的检测第80-112页
   ·实验材料和方法第80-90页
     ·试剂及主要仪器第80-81页
     ·蜜蜂第81页
     ·RNA的提取第81-82页
     ·RNA文库的构建和高通量测序第82页
     ·基本生物信息分析第82-84页
     ·高级生物信息分析第84页
     ·预测新的miRNA第84-85页
     ·已知的miRNA差异表达分析第85-86页
     ·茎环RT-PCR第86-87页
     ·引物的设计和合成第87-89页
     ·引物效率的测定第89页
     ·实时定量PCR第89-90页
   ·实验结果第90-110页
     ·基本生物信息分析第90-93页
     ·高级生物信息分析第93-104页
     ·qRT-PCR验证ame-mir-31a和ame-mir-13b第104-108页
     ·新的miRNA预测和鉴定第108-110页
   ·讨论第110-112页
第4章 哺育蜂和采集蜂头部mRNA和miRNA调控网络分析第112-123页
   ·实验方法第112-114页
     ·miRNAs靶基因的预测第112-113页
     ·miRNA与靶基因进行网络分析第113页
     ·生物信息学分析第113-114页
   ·结果第114-121页
     ·表达差异显著性miRNA靶基因的预测第114页
     ·miRNA与靶基因进行网络分析结果第114-117页
     ·GO分析和Pathway分析第117-121页
   ·讨论第121-123页
第5章 主要结论、创新和后续研究展望第123-125页
   ·主要结论第123-124页
   ·创新第124页
   ·后续研究展望第124-125页
参考文献第125-138页
附录第138-143页
博士期间发表的论文第143-144页
国际交流及会议第144-145页
致谢第145页

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