| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-7页 |
| 第一章 绪论 | 第7-15页 |
| ·SNP 相关知识介绍 | 第7-9页 |
| ·SNP 概念与特点 | 第7-8页 |
| ·SNP 研究价值 | 第8-9页 |
| ·全基因组关联分析介绍 | 第9-12页 |
| ·复杂疾病介绍 | 第9-11页 |
| ·全基因组关联分析介绍 | 第11-12页 |
| ·本文主要工作 | 第12页 |
| ·本文结构 | 第12-15页 |
| 第二章 疾病模型 | 第15-27页 |
| ·SNP 数据与疾病模型 | 第15-21页 |
| ·SNP 数据 | 第15-16页 |
| ·单位点疾病模型与多位点疾病模型 | 第16-19页 |
| ·本文使用的疾病模型 | 第19-21页 |
| ·疾病模型参数介绍 | 第21-24页 |
| ·MAF | 第21-22页 |
| ·MES | 第22-23页 |
| ·Prevalence 和 Penetrance | 第23-24页 |
| ·疾病模型中参数的求解 | 第24-25页 |
| ·one-way 疾病模型参数求解 | 第24页 |
| ·two-way 疾病模型参数求解 | 第24-25页 |
| ·本章小结 | 第25-27页 |
| 第三章 疾病模型性质的研究及其对关联性测度的影响 | 第27-51页 |
| ·关联性测度介绍 | 第27-31页 |
| ·互信息 | 第27-29页 |
| ·Chi-2 | 第29-30页 |
| ·B Statistic | 第30-31页 |
| ·P-value | 第31页 |
| ·疾病模型对关联性测度的影响 | 第31-50页 |
| ·one-way 关联性测度实验比较 | 第31-36页 |
| ·one-way 疾病模型与噪声模型的关联性测度比较 | 第36-37页 |
| ·two-way 关联性测度实验比较 | 第37-50页 |
| ·本章小结 | 第50-51页 |
| 第四章 不同模型与参数下关联算法检测能力的比较 | 第51-65页 |
| ·主流关联算法的简介 | 第51-56页 |
| ·ANTEpiSeeker 算法 | 第51-53页 |
| ·SNPRuler 算法 | 第53-54页 |
| ·Boost 算法 | 第54-56页 |
| ·关联算法对不同模型与参数检出能力比较的实验 | 第56-63页 |
| ·实验的设计 | 第56页 |
| ·Power 的计算 | 第56-57页 |
| ·关联算法比较的 Power 实验结果与分析 | 第57-63页 |
| ·各关联算法时间复杂度的比较 | 第63页 |
| ·本章小结 | 第63-65页 |
| 第五章 AMD与肺癌的真实SNP数据的实验研究 | 第65-69页 |
| ·AMD 数据实验 | 第65-66页 |
| ·肺癌（lung）数据实验 | 第66-67页 |
| ·本章小结 | 第67-69页 |
| 第六章 总结与展望 | 第69-71页 |
| 致谢 | 第71-73页 |
| 参考文献 | 第73-75页 |