| 摘要 | 第1-10页 |
| Abstract | 第10-13页 |
| 主要英文缩写 | 第13-14页 |
| 前言 | 第14-18页 |
| 第一章 JAK-STAT信号转导通路蛋白及其相互作用蛋白筛选成人肝cDNA文库 | 第18-43页 |
| 一、材料和方法 | 第21-30页 |
| 1 材料 | 第21-23页 |
| ·菌株 | 第21页 |
| ·质粒 | 第21页 |
| ·PCR引物 | 第21页 |
| ·主要试剂 | 第21页 |
| ·cDNA 文库 | 第21页 |
| ·培养基及常用试剂 | 第21-22页 |
| ·主要仪器设备 | 第22-23页 |
| 2 方法 | 第23-30页 |
| ·分子克隆 | 第23页 |
| ·RT-PCR | 第23页 |
| ·人肝脏cDNA 文库质量控制及其扩增 | 第23-24页 |
| ·Y2H筛选 | 第24-30页 |
| 二、结果 | 第30-38页 |
| 1 文库鉴定及其扩增 | 第30页 |
| 2 诱饵载体的构建 | 第30页 |
| 3 诱饵自激活检测 | 第30-31页 |
| 4 Y2H筛库 | 第31-34页 |
| ·文库筛选及表型鉴定 | 第31-32页 |
| ·Y2H筛库结果 | 第32-34页 |
| 5 筛库结果初步分析 | 第34-38页 |
| 三、讨论 | 第38-43页 |
| 第二章 相互作用数据的评价 | 第43-60页 |
| 一、材料和方法 | 第44-46页 |
| 1 酵母回转验证 | 第44-45页 |
| 2 生物信息学分析 | 第45-46页 |
| 二、结果 | 第46-56页 |
| 1 酵母回转验证 | 第46-47页 |
| 2 生物信息学分析 | 第47-53页 |
| 3 相互作用数据的整体评价 | 第53-56页 |
| 三、讨论 | 第56-60页 |
| 第三章 相互作用网络的构建及重要相互作用的发现 | 第60-75页 |
| 一、技术策略与方法 | 第60页 |
| 1 LCI数据的产生 | 第60页 |
| 2 网络的构建 | 第60页 |
| 3 重要相互作用的分析、发现 | 第60页 |
| 二、相互作用网络的构建 | 第60-66页 |
| 1 LCI相互作用网络 | 第60-63页 |
| 2 Y2H相互作用网络 | 第63-66页 |
| 3 整合LCI 和Y2H相互作用的网络 | 第66页 |
| 三、重要相互作用的分析、发现 | 第66-73页 |
| 1 潜在信号通路间的交联 | 第66-69页 |
| 2 重要蛋白的调节机制 | 第69-70页 |
| 3 从机制上证实蛋白新功能 | 第70页 |
| 4 揭示未知蛋白功能 | 第70-72页 |
| 5 揭示转录调控规律 | 第72-73页 |
| 四、讨论 | 第73-75页 |
| 总结 | 第75-78页 |
| 存在问题和展望 | 第78-79页 |
| 参考文献 | 第79-87页 |
| 附表 | 第87-145页 |
| 附录1 构建诱饵载体引物 | 第87-91页 |
| 附录2 诱饵蛋白结构域信息 | 第91-94页 |
| 附录3 猎物基因名和全名 | 第94-97页 |
| 附表1-1 酵母双杂交方法构建JAK-STAT信号转导通路相互作用网络所选诱饵基因 | 第97-98页 |
| 附表1-2 诱饵载体构建情况 | 第98-99页 |
| 附表1-3 自激活实验结果 | 第99-100页 |
| 附表1-4 诱饵筛库转化子数及其读框正确克隆的表型分布统计 | 第100-102页 |
| 附表1-5 Y2H筛库所得相互作用对 | 第102-110页 |
| 附表1-6 Y2H筛库结果－各选定基因筛到的相互作用 | 第110-118页 |
| 附表1-7 Y2H筛库结果－各选定基因筛到的相互作用对数 | 第118-119页 |
| 附表1-8 我们筛库结果同NATURE、CELL结果比较 | 第119-122页 |
| 附表2-1 回转验证实验结果 | 第122-131页 |
| 附表2-2 Y2H筛库所得共享3 级或以上GO-生物学过程或功能注释的相互作用对 | 第131-133页 |
| 附表2-3 大网络中含我们相互作用对的三环、四环的数量统计 | 第133-137页 |
| 附表2-4 诱饵猎物基因敲除表型相似或相同的筛库所得相互作用对 | 第137-139页 |
| 附表2-5 Y2H筛库所得各相互作用对经16 个标准评分后的得分总和 | 第139-143页 |
| 附表3-1 Y2H筛库所得相互作用网络中65 个已知与疾病有关的蛋白 | 第143-145页 |
| 在读期间发表或投稿的论文 | 第145-146页 |
| 个人简历 | 第146-147页 |
| 致谢 | 第147页 |
