蛋白质构象预测算法的研究
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 第1章 绪论 | 第9-17页 |
| ·研究课题的目的和意义 | 第9-11页 |
| ·国内外的综合研究现状 | 第11-15页 |
| ·虚拟细胞的研究现状 | 第11-12页 |
| ·蛋白质构象预测算法的研究现状 | 第12-15页 |
| ·本文的研究工作和内容安排 | 第15-17页 |
| 第2章 蛋白质构象预测的相关知识简介 | 第17-27页 |
| ·蛋白质的相关知识 | 第17-21页 |
| ·蛋白质分子的组成 | 第17-18页 |
| ·蛋白质分子的层次结构 | 第18-21页 |
| ·蛋白质分子的计算机模拟模型 | 第21-25页 |
| ·全原子模型 | 第21-22页 |
| ·格点模型 | 第22-24页 |
| ·非格点模型 | 第24-25页 |
| ·构象预测的精确算法及复杂度分析 | 第25-26页 |
| ·本章小结 | 第26-27页 |
| 第3章 HP格点模型的预测算法 | 第27-44页 |
| ·蚁群优化算法简介 | 第27-32页 |
| ·蚁群优化算法的基本原理 | 第27-28页 |
| ·蚁群优化算法的数学模型及实现 | 第28-30页 |
| ·蚁群优化算法的特点 | 第30-32页 |
| ·应用蚁群优化算法求解蛋白质构象预测问题 | 第32-39页 |
| ·备选构象生成 | 第33-35页 |
| ·局部搜索算法 | 第35-38页 |
| ·全局信息素更新 | 第38页 |
| ·算法流程 | 第38-39页 |
| ·实验结果及分析 | 第39-41页 |
| ·实验结果 | 第39-41页 |
| ·实验结果比较 | 第41页 |
| ·算法应用于三维HP格点模型 | 第41-43页 |
| ·本章小结 | 第43-44页 |
| 第4章 HP非格点模型的预测算法 | 第44-54页 |
| ·模拟退火算法简介 | 第44-48页 |
| ·物理退火过程 | 第44页 |
| ·Metropolis准则 | 第44-45页 |
| ·优化问题与物理退火的相似性 | 第45-46页 |
| ·模拟退火算法的基本思想 | 第46-47页 |
| ·模拟退火算法的改进 | 第47-48页 |
| ·应用模拟退火算法求解蛋白质构象预测问题 | 第48-53页 |
| ·算法思想与步骤 | 第48-50页 |
| ·实验结果及分析 | 第50-53页 |
| ·本章小结 | 第53-54页 |
| 第5章 蛋白质构象仿真系统的设计与实现 | 第54-62页 |
| ·仿真系统的构成 | 第54-55页 |
| ·仿真系统的流程及主要参数介绍 | 第55-57页 |
| ·仿真结果 | 第57-61页 |
| ·HP 格点模型的预测仿真结果 | 第58-60页 |
| ·HP 非格点模型的预测仿真结果 | 第60-61页 |
| ·本章小结 | 第61-62页 |
| 结论 | 第62-64页 |
| 参考文献 | 第64-68页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第68-70页 |
| 致谢 | 第70页 |
