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SPR生物传感器用于DNA聚合酶与DNA结合的研究

摘要第1-7页
Abstract第7-9页
第一章 绪论第9-24页
   ·表面等离子激元共振(SPR)技术第9-16页
     ·SPR生物传感器的历史第9-10页
     ·SPR生物传感器原理第10-12页
     ·SPR生物传感器在生物化学领域的应用第12-14页
     ·SPR生物传感器的发展趋势第14-16页
   ·DNA聚合酶及其抑制剂第16-23页
     ·DNA聚合酶功能及其分类第16-17页
     ·DNA聚合酶结构和功能关系第17-20页
     ·DNA聚合的动力学机制第20页
     ·DNA聚合酶抑制剂介绍第20-22页
     ·预稳态动力学的研究方法第22-23页
   ·本工作的目的和思路第23-24页
第二章 SPR生物传感器检测聚合酶和DNA相互作用的方法学第24-34页
   ·引言第24页
   ·实验设计第24-31页
     ·实验设备和材料第24-27页
     ·DNA固定于传感芯片表面第27-28页
     ·DNA固定量、流速和传质效应的关系第28-29页
     ·温度、缓冲液和传感芯片的再生(regeneration)条件第29-30页
     ·实时检测聚合酶和DNA的结合和解离过程第30页
     ·检测dNMP、抑制剂作用下聚合酶和DNA的结合和解离过程第30-31页
   ·SPR数据分析第31-33页
     ·1:1 Langmuir模型第31页
     ·平行反应模型第31-32页
     ·构象变化模型第32页
     ·考虑传质效应的1:1 Langmuir模型第32-33页
   ·小结第33-34页
第三章 研究DNA错配以及“正确”或“错误”dNMP对聚合酶与DNA结合的影响第34-50页
   ·引言第34-36页
   ·实验结果和讨论第36-48页
     ·末端含有不同错配的DNA T-P固定在SPR传感芯片上第36页
     ·SPR传感芯片表面DNA T-P与Taq pol结合的特异性第36-37页
     ·Taq pol与完全匹配和末端含有不同错配的DNA T-P的结合动力学分析第37-40页
     ·dNMP环境中,Taq pol、MMLV RT~-和人源的pol β与DNA T-P的结合动力学分析第40-48页
   ·结论第48-50页
第四章 不同抑制剂对pol β与DNA结合的影响第50-63页
   ·引言第50-52页
   ·结果和讨论第52-61页
     ·抑制剂浓度对人源的polβ与不同DNA底物结合的影响第52-55页
     ·抑制剂作用下人源polβ和DNA T-P的结合动力学分析第55-61页
   ·结论第61-63页
第五章 逆转录酶与DNA的结合以及抑制剂对此过程的影响第63-80页
   ·引言第63-65页
   ·研究MMLV RT~-和固定在芯片表面的DNA结合以及EFV,NVP和槲皮素对此过程的影响第65-72页
     ·DNA修饰的传感芯片表面的稳定性和MMLV RT~-结合的特异性第65-66页
     ·MMLV RT~-与固定于传感芯片表面的不同DNA底物的结合第66-68页
     ·DMSO对MMLV RT~-与含有8nt空隙的DNA复合物结合的影响第68-69页
     ·检测不同的化合物对MMLV RT~-与含8nt空隙的DNA T-P复合物结合的影响第69-71页
     ·结论第71-72页
   ·NRTIs和NNRTIs作用下HIV-1 RT和DNA T-P的结合第72-80页
     ·HIV-1 RT与固定在传感芯片表面的DNA T-P结合的动力学第72-74页
     ·抑制剂存在情况下HIV-1 RT与DNA T-P结合的动力学第74-79页
     ·结论第79-80页
第六章 表面等离子激元共振成像系统的研制第80-92页
   ·引言第80-81页
   ·SPM硬件和软件系统的研制第81-84页
   ·样品池部分的设计第84-88页
   ·SPM系统定标第88-91页
     ·SPM系统信号强度和折射率之间的关系第88-90页
     ·BIAcoreX信号强度和折射率之间的关系第90-91页
   ·小结第91-92页
第七章 总结与展望第92-110页
 缩略符号说明第94-95页
 参考文献第95-110页
博士期间发表论文第110-111页
致谢第111-112页
个人简历第112-113页
学位论文独创性声明第113页
学位论文使用授权声明第113页

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