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土壤中烟草根黑腐病菌实时定量PCR检测方法研究

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-10页
1 绪论第10-25页
   ·引言第10页
   ·烟草根黑腐病的病原、病症、致病机制及传播途径第10页
   ·植物病原菌的检测方法第10-16页
     ·传统方法第10-11页
     ·生物技术在植物病原菌检测方面的应用第11-14页
     ·PCR 技术第14-16页
   ·提取和纯化土壤及沉积物微生物总DNA 的研究进展第16-20页
   ·土壤病原真菌的定量方法第20-23页
     ·选择性培养基培养计数第20页
     ·PCR 技术第20-23页
   ·研究目的与内容第23-24页
     ·研究目的第23页
     ·主要研究内容第23-24页
   ·技术路线第24页
   ·本研究的创新点第24-25页
2 烟草根黑腐病病菌常规PCR 检测体系的建立第25-33页
   ·材料与仪器第25-27页
     ·供试菌株第25页
     ·主要培养基第25页
     ·细菌及真菌基因组DNA 提取试剂第25-26页
     ·其他主要试剂第26页
     ·主要仪器设备第26-27页
   ·实验方法第27-30页
     ·细菌基因组DNA 的制备第27-28页
     ·真菌基因组DNA 的制备第28页
     ·烟草根黑腐病病菌常规PCR 检测体系的建立第28-30页
   ·结果与分析第30-32页
     ·引物的筛选第30-31页
     ·常规PCR 检测体系的建立和优化第31-32页
   ·讨论第32-33页
3 土壤中烟草根黑腐病病菌常规PCR 检测体系的建立第33-39页
   ·材料与仪器第33页
     ·供试土壤样品第33页
     ·土壤基因组DNA 提取试剂第33页
     ·实验仪器第33页
   ·实验方法第33-35页
     ·烟草根黑腐病菌分生孢子悬液的制备第33页
     ·土壤接种第33页
     ·土壤基因组总DNA 的制备第33-34页
     ·土壤中烟草根黑腐病病菌常规PCR 体系的优化建立第34页
     ·PCR 扩增产物克隆、转化和鉴定第34-35页
   ·结果与分析第35-37页
     ·土壤基因组总DNA 制备第35-36页
     ·土壤中烟草根黑腐病病菌常规PCR 体系的优化建立第36页
     ·PCR 产物扩增条带正确性的验证第36-37页
   ·讨论第37-39页
4 土壤中烟草根黑腐病病菌SYBR GREENⅠ实时定量PCR 检测体系的建立第39-46页
   ·材料与仪器第39页
     ·供试菌株第39页
     ·主要试剂第39页
     ·实验仪器第39页
   ·实验方法第39-40页
     ·土壤总DNA 的制备第39页
     ·SYBR GreenⅠPCR 检测体系的建立和优化第39页
     ·SYBR GreenⅠ实时定量PCR 特异性检测第39-40页
     ·SYBR GreenⅠPCR 灵敏度检测及标准曲线的绘制第40页
     ·接种土壤的SYBR GreenⅠ实时定量PCR 的检测第40页
   ·结果与分析第40-44页
     ·SYBR GreenⅠPCR 检测体系的建立和优化第40页
     ·SYBR GreenⅠPCR 特异性检测第40-41页
     ·SYBR GreenⅠPCR 灵敏度检测及标准曲线的绘制第41-43页
     ·接种土壤的SYBR GreenⅠ实时定量PCR 检测第43-44页
   ·讨论第44-46页
5 土壤中烟草根黑腐病病菌TAQMAN 实时定量PCR 检测体系的建立第46-52页
   ·材料与仪器第46页
     ·供试菌株第46页
     ·主要试剂第46页
     ·实验仪器第46页
   ·实验方法第46-47页
     ·土壤总DNA 的制备第46页
     ·TaqMan 探针检测体系的建立第46-47页
   ·结果与分析第47-50页
     ·TaqMan 探针实时定量PCR 最优检测体系的建立和优化第47-48页
     ·TaqMan 探针实时定量PCR 特异性检测第48页
     ·TaqMan 探针实时定量PCR 灵敏度检测及标准曲线的绘制第48-49页
     ·接种土壤的TaqMan 探针实时定量PCR 检测第49-50页
   ·讨论第50-52页
6 主要结论与后续工作展望第52-54页
   ·主要结论第52页
   ·后续工作展望第52-54页
致谢第54-55页
参考文献第55-63页
附录第63页
 A 硕士学位期间发表的论文及专利目录第63页
 B 攻读硕士学位期间参与的科研项目第63页

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