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马铃薯Y病毒新变异株系的克隆鉴定及马铃薯—病毒互作机制研究

摘要第1-8页
Abstract第8-9页
第一章 文献综述第9-24页
   ·马铃薯病毒抗性类型第10-13页
     ·极端抗性与过敏性抗性第11-12页
     ·其它抗病毒类型第12-13页
   ·植物抗病毒机制第13-19页
     ·植物R基因介导的病毒抗性第13-16页
     ·隐性基因介导的病毒抗性第16-17页
     ·RNA沉默介导的病毒抗性第17-19页
   ·马铃薯病毒抗性基因第19-22页
     ·马铃薯显性抗性基因Rx第19-20页
     ·马铃薯Y属病毒的隐形抗性基因第20-21页
     ·其它抗性基因第21-22页
   ·小结第22页
   ·研究目的与内容第22-24页
第二章 材料与方法第24-39页
   ·植物材料第24页
   ·病毒材料的保存第24页
   ·病毒接种第24-25页
     ·机械摩擦接种第24页
     ·嫁接接种第24-25页
   ·RNA抽提第25-27页
     ·Na_2SO_3法提取马铃薯叶片和块茎组织的总RNA第25页
     ·LiCl法提取马铃薯叶片和块茎组织的总RNA第25-27页
   ·ELISA检测第27-28页
     ·ELISA检测步骤第27页
     ·ELISA检测试剂第27-28页
   ·RT-PCR第28-30页
     ·RT-PCR反应条件第28-29页
     ·主要PCR引物第29-30页
   ·GeneSnare差异显示第30-32页
     ·总RNA的准备第30-31页
     ·ACP引物的制备第31页
     ·GeneSnare差异显示步骤第31-32页
   ·片段回收、克隆及测序第32-34页
     ·片段回收与扩增第32-33页
     ·目标片段的克隆第33-34页
     ·阳性克隆筛选、鉴定与测序第34页
   ·NanoString nCounter基因表达分析第34-38页
     ·NanoString nCounter基因表达分析的条件第35页
     ·NanoString nCounter探针的设计与合成第35-36页
     ·NanoString nCounter表达分析第36-38页
   ·Realtime qPCR分析第38-39页
     ·Realtime qPCR引物第38页
     ·Realtime qPCR第38-39页
第三章 马铃薯Y病毒PVY~O强毒、弱毒株系的克隆鉴定及分子检测第39-54页
   ·前言第39-40页
   ·材料与方法第40-42页
     ·病毒取样第40页
     ·酶联免疫分析(ELISA)第40页
     ·症状观察第40页
     ·RT-PCR病毒检测鉴定第40-41页
     ·病毒全基因组克隆和测序第41-42页
   ·结果分析第42-52页
     ·田间病毒样品的血清学、分子和烟草活体鉴定分析第42-45页
     ·PVY~O-FL和PVY~O-RB的测序第45-49页
     ·PVY~O类型的区分鉴定第49-52页
   ·讨论第52-54页
第四章 马铃薯品种对5个PVY株系的特异性反应第54-73页
   ·前言第54-55页
   ·材料与方法第55-57页
     ·植物材料第55页
     ·病毒株系第55-56页
     ·病毒接种第56页
     ·ELISA和RT-PCR检测第56页
     ·症状观测第56-57页
   ·结果第57-71页
     ·ELISA和RT-PCR检测结果第57页
     ·各种PVY株系侵染导致的症状类型第57-58页
     ·各马铃薯品种对PVY株系的反应第58-65页
     ·初次侵染和次生侵染植株症状的比较第65-68页
     ·各PVY株系对马铃薯产量的影响第68-71页
   ·讨论第71-73页
第五章 马铃薯-病毒亲和与非亲和互作中基因表达差异研究第73-106页
   ·前言第73-75页
   ·材料与方法第75-77页
     ·植物材料第75页
     ·病毒株系第75页
     ·病毒接种及取样第75页
     ·RT-PCR病毒检测及症状观测第75页
     ·差异表达基因(DEGs)筛选、回收、克隆和测序第75-76页
     ·NanoString nCounter~(TM)表达模式分析第76页
     ·Realtime PCR分析DEGs相对表达量第76-77页
     ·DEGs表达模式聚类分析第77页
   ·结果第77-100页
     ·‘Shepody’对PVA、PVY嫁接接种的症状反应第77-79页
     ·RT-PCR病毒检测结果第79-83页
     ·GeneSnare~(TM)筛选差异表达基因(DEGs)第83页
     ·DEGs片段回收、克隆和测序第83-84页
     ·DEGs片段功能检索及分类第84-90页
     ·DEGs表达模式分析第90-100页
   ·讨论第100-106页
     ·关键实验技术的可靠性第100页
     ·‘Shepody’对PVA的抗性第100-101页
     ·PVA和PVY诱导的‘Shepody’基因表达变化第101-104页
     ·亲和与非亲和互作中的基因表达差异第104-106页
第六章 总结第106-109页
   ·马铃薯Y病毒PVY~O新变异株系的克隆鉴定第106页
   ·马铃薯品种对不同PVY株系的反应第106-107页
   ·‘Shepody’与PVY和PVA互作中的基因表达差异第107页
   ·展望第107-109页
参考文献第109-128页
致谢第128-129页
发表或整理的论文第129页

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