提要 | 第1-5页 |
缩略语表 | 第5-9页 |
第1章 前言 | 第9-40页 |
·乙酰辅酶A 羧化酶简介 | 第9-14页 |
·ACCase 的分类 | 第9-10页 |
·ACCase 催化的化学反应 | 第10-11页 |
·ACCase 的生物学功能 | 第11-13页 |
·影响ACCase 生物活性的因素 | 第13-14页 |
·ACCase 的羧基转移酶功能域的研究进展 | 第14-18页 |
·APPs 和CHDs 抑制禾本科植物叶绿体ACCase 的CT 功能域研究 | 第14-15页 |
·禾本科植物叶绿体ACCase 的CT 功能域氨基酸点突变的研究 | 第15-16页 |
·同质型ACCase 的CT 功能域结构的研究 | 第16-18页 |
·理论计算方法的简介 | 第18-29页 |
·同源模建 | 第18-21页 |
·分子动力学模拟 | 第21-25页 |
·MM-PBSA 法计算结合自由能 | 第25-29页 |
·本论文立题依据 | 第29-30页 |
·参考文献 | 第30-40页 |
第2章 ACCase 的CT 功能域及其分子动力学模拟参数的优化 | 第40-55页 |
·引言 | 第40-41页 |
·计算方法 | 第41-44页 |
·截短型酵母CT 功能域二聚体的获取 | 第41页 |
·全长型的酵母CT 功能域二聚体的分子动力学模拟 | 第41-42页 |
·截短型CT 功能域二聚体的分子动力学模拟 | 第42-43页 |
·范德华力截断值的优化 | 第43页 |
·积分步长的优化 | 第43-44页 |
·结果与讨论 | 第44-53页 |
·全长型CT 功能域二聚体的分子动力学模拟 | 第44-46页 |
·截短型CT 功能域二聚体的分子动力学模拟 | 第46-47页 |
·截短型CT 功能域二聚体代替全长CT 功能域二聚体进行理论计算的依据 | 第47页 |
·范德华力截断值的优化 | 第47-52页 |
·积分步长的选取 | 第52-53页 |
·小结 | 第53页 |
·参考文献 | 第53-55页 |
第3章 禾本科植物叶绿体ACCase 的CT 功能域对haloxyfop 的对映体选择性的机理研究 | 第55-81页 |
·引言 | 第55-56页 |
·计算方法 | 第56-59页 |
·黑草ACCase 的CT 功能域的同源模建 | 第56-57页 |
·黑草ACCase 的CT 功能域的分子动力学模拟 | 第57-58页 |
·黑草ACCase 的CT 功能域与haloxyfop 结合自由能计算 | 第58-59页 |
·结果与讨论 | 第59-77页 |
·黑草ACCase 的CT 功能域的同源模建 | 第59-66页 |
·黑草ACCase 的CT 功能域的分子动力学模拟 | 第66-69页 |
·黑草ACCase 的CT 功能域对APPs 的对映体选择性的能量分析 | 第69-72页 |
·CT 功能域对APPs 的对映体选择性的现有的解释机理的评估 | 第72-76页 |
·决定黑草CT 功能域对映体选择性的残基的判定 | 第76-77页 |
·小结 | 第77-78页 |
·参考文献 | 第78-81页 |
第4章 禾本科植物叶绿体ACCase的CT功能域Ile/Leu单点突变对R型haloxyfop产生抗性的机理研究 | 第81-91页 |
·引言 | 第81页 |
·计算方法 | 第81-82页 |
·CT 功能域与R 型haloxyfop 复合物结构的构建 | 第81-82页 |
·分子动力学模拟 | 第82页 |
·结合自由能计算 | 第82页 |
·结果与讨论 | 第82-90页 |
·CT 功能域与R 型haloxyfop 复合物结构的构建 | 第82-85页 |
·分子动力学模拟 | 第85-86页 |
·结合自由能分析判定CT 功能域抗性产生的原因 | 第86-88页 |
·单点突变Ile/Leu 产生影响结构观测 | 第88-90页 |
·小结 | 第90-91页 |
创新点 | 第91-92页 |
展望 | 第92-94页 |
攻读博士期间研究成果 | 第94-95页 |
致谢 | 第95-96页 |
中文摘要 | 第96-99页 |
Abstract | 第99-101页 |