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重组嗜热闪烁杆菌脂肪酶系的性质表征及嗜热磷酸三酯酶晶体结构解析

内容提要第1-10页
第一章 前言第10-48页
   ·嗜热微生物第10页
   ·嗜热酶第10-14页
     ·嗜热酶稳定性第10-13页
     ·嗜热酶的应用第13-14页
   ·细菌脂肪酶/酯酶第14-26页
     ·细菌脂肪酶/酯酶的分类第15-19页
     ·细菌嗜热脂肪酶的研究现状第19-20页
     ·细菌嗜热酯酶的研究现状第20-21页
     ·细菌脂肪酶的结构研究第21-24页
     ·细菌脂肪酶的催化机制研究第24-26页
   ·磷酸三酯酶第26-29页
     ·磷酸三酯酶的结构研究第27页
     ·磷酸三酯酶的催化机制研究第27-29页
     ·嗜热磷酸三酯酶的研究现状第29页
   ·生物信息学在蛋白质结构研究中的应用第29-31页
     ·蛋白质结构预测第29-30页
     ·分子动力学模拟第30-31页
   ·蛋白质晶体学第31-34页
     ·蛋白质的结晶第32-33页
     ·X 射线衍射数据收集与数据处理第33页
     ·相位问题第33-34页
   ·立题依据和实验设计第34-36页
 参考文献第36-48页
第二章 重组嗜热闪烁杆菌脂肪酶的性质研究第48-77页
   ·材料与方法第48-56页
     ·主要仪器和试剂第48页
     ·实验用菌株及质粒第48-49页
     ·使用的数据库及软件第49-50页
     ·实验方法第50-56页
       ·序列比对及系统发育学分析第50页
       ·嗜热菌Fervidobacterium nodosum Rt17-B1 的培养第50页
       ·基因组DNA 的提取第50页
       ·基因的克隆与表达第50-52页
       ·嗜热脂肪酶 FnL 的分离纯化第52-53页
       ·脂肪酶活力测定第53-54页
       ·重组嗜热脂肪酶酶学性质表征第54-55页
       ·嗜热脂肪酶 FnL 的结构研究方法第55-56页
   ·结果与讨论第56-75页
     ·嗜热闪烁杆菌嗜热脂肪酶序列及系统发育学分析第56-61页
     ·嗜热闪烁杆菌脂肪酶基因的克隆,表达及性质表征第61-70页
       ·嗜热菌 Fervidobacterium nodosum 的培养第61页
       ·重组质粒的构建第61-63页
       ·嗜热脂肪酶 FnL 的分离纯化第63-65页
       ·嗜热脂肪酶 FnL 的酶学性质研究第65-70页
     ·嗜热脂肪酶FnL 的结构预测第70-75页
       ·嗜热脂肪酶 FnL 的三维结构模建和结构评估第70-72页
       ·嗜热脂肪酶 FnL 的底物选择性分析第72-75页
 参考文献第75-77页
第三章 重组嗜热闪烁杆菌酯酶的性质表征第77-87页
   ·材料与方法第77页
   ·结果与讨论第77-86页
     ·嗜热闪烁杆菌嗜热酯酶序列分析及同源比较研究第77-78页
     ·嗜热闪烁杆菌酯酶基因的克隆,表达及性质表征第78-83页
       ·重组质粒的构建第78-79页
       ·嗜热酯酶 FNE 的分离纯化第79-80页
       ·嗜热酯酶 FNE 的酶学性质研究第80-83页
     ·嗜热酯酶 FNE 的三维结构模建和结构评估第83-86页
 参考文献第86-87页
第四章 嗜热磷酸三酯酶晶体结构解析第87-108页
   ·材料与方法第87-91页
     ·嗜热磷酸三酯酶 GK1506 的克隆、表达、纯化与晶体制备第87-89页
       ·嗜热磷酸三酯酶突变体的克隆第87页
       ·野生型及突变体的表达及纯化第87-89页
       ·嗜热磷酸三酯酶 GK1506 的晶体生长条件的初筛及优化第89页
     ·数据收集与晶体结构解析第89-90页
       ·GK1506 的X 射线衍射数据收集与处理第89页
       ·分子置换法解析GK1506 的晶体结构第89-90页
       ·结构模型的建立和相位的求解第90页
       ·GK1506 结构模型的精修第90页
     ·晶体结构分析与讨论第90-91页
       ·GK1506 与同源结构间的比较第90-91页
   ·结果与讨论第91-107页
     ·嗜热磷酸三酯酶及突变体的克隆表达,纯化及活力检测第91-92页
     ·嗜热磷酸三酯酶的结晶第92页
     ·结晶条件的优化第92-93页
     ·数据收集与晶体结构解析第93-95页
       ·GK1506 的X 射线衍射数据收集与处理第93-94页
       ·分子置换法解析GK1506 的晶体结构第94页
       ·最终结构模型的质量评估第94-95页
     ·晶体结构分析与讨论第95-107页
       ·嗜热磷酸三酯酶GK1506 的整体结构第95-97页
       ·GK1506 与同源结构间的比较第97-100页
       ·GK1506 的双金属催化中心第100-103页
       ·GK1506 的底物选择性机制第103-105页
       ·GK1506 的催化机理第105-107页
 参考文献第107-108页
创新点第108-109页
攻读博士期间研究成果第109-110页
致谢第110-111页
中文摘要第111-113页
Abstract第113-114页

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