摘要 | 第7-9页 |
ABSTRACT | 第9-11页 |
第一部分 文献综述 | 第12-25页 |
第一章 细菌性软腐病概述 | 第13-21页 |
1 细菌性软腐病菌概述 | 第13页 |
2 病原、病害症状及发病规律 | 第13-14页 |
3 致病因子 | 第14-18页 |
3.1 软腐病菌细胞壁降解酶类 | 第15-16页 |
3.2 生物膜 | 第16-17页 |
3.3 运动性 | 第17页 |
3.4 次级代谢产物 | 第17-18页 |
3.5 碳青霉烯类抗生素 | 第18页 |
3.6 其它致病因子 | 第18页 |
4 致病因子的调控 | 第18-20页 |
5 转录组测序在互作中的应用 | 第20页 |
6 蛋白互作的研究进展 | 第20-21页 |
第二章 细菌的分泌系统 | 第21-25页 |
1 致病因子的分泌 | 第21-25页 |
1.1 Ⅰ型分泌系统 | 第21页 |
1.2 Ⅱ型分泌系统 | 第21-22页 |
1.3 Ⅲ型分泌系统 | 第22页 |
1.4 Ⅳ型分泌系统 | 第22页 |
1.5 Ⅴ型分泌系统 | 第22页 |
1.6 Ⅵ型分泌系统 | 第22-25页 |
第二部分 研究内容 | 第25-67页 |
第一章 胡萝卜软腐果胶杆菌impG基因互作蛋白的筛选 | 第27-59页 |
1 供试材料 | 第29-37页 |
1.1 本研究所用菌株、质粒和引物 | 第29-35页 |
1.2 主要仪器和试剂 | 第35-36页 |
1.3 抗生素及其使用浓度 | 第36页 |
1.4 培养基 | 第36-37页 |
2 试验方法 | 第37-46页 |
2.1 菌株培养环境和保存 | 第37页 |
2.2 细菌基因组DNA提取 | 第37-38页 |
2.3 质粒的提取 | 第38页 |
2.4 DNA片段和质粒的酶切、回收及连接反应 | 第38-39页 |
2.5 连接产物的转化 | 第39-40页 |
2.6 共转菌株、突变体及过表达菌株的构建 | 第40-42页 |
2.7 生物学表型检测 | 第42-43页 |
2.8 蛋白及细菌双杂实验 | 第43-46页 |
3 结果与分析 | 第46-57页 |
3.1 ΔT6SS突变体构建、验证及致病性验证 | 第46-48页 |
3.2 PccS1(impG-FLAG)菌株构建 | 第48页 |
3.3 PccS1(impG-FLAG)菌株Western blot验证 | 第48-49页 |
3.4 ImpG蛋白Co-IP结果Western blot验证 | 第49页 |
3.5 ImpG蛋白Co-IP测序结果 | 第49页 |
3.6 ImpG蛋白Co-IP测序筛选结果细菌双杂验证及相关基因研究 | 第49-57页 |
4 讨论与结论 | 第57-59页 |
第二章 胡萝卜软腐果胶杆菌经过组织液诱导及impG基因缺失前后转录组测序与分析 | 第59-67页 |
1 实验材料 | 第60页 |
1.1 本研究所用菌株 | 第60页 |
1.2 主要仪器和试剂 | 第60页 |
1.3 抗生素及其使用浓度 | 第60页 |
1.4 培养基 | 第60页 |
2 试验方法 | 第60-62页 |
2.1 细菌RNA的提取 | 第60-61页 |
2.2 RNA质量的检测与样品转录组测序及分析 | 第61-62页 |
3 结果与分析 | 第62-65页 |
3.2 差异基因GO富集柱状图 | 第63页 |
3.3 差异表达基因pathway富集散点图及统计结果 | 第63-65页 |
4 讨论与结论 | 第65-67页 |
全文总结 | 第67-69页 |
附录 | 第69-71页 |
参考文献 | 第71-79页 |
致谢 | 第79-81页 |
攻读学位期间取得的学术成果目录 | 第81页 |