| 缩略词表 | 第7-8页 |
| 摘要 | 第8-11页 |
| Abstract | 第11-13页 |
| 第一章 研究背景与立题依据 | 第14-22页 |
| 1.1 研究背景 | 第14-19页 |
| 1.1.1 海洋生态环境 | 第14页 |
| 1.1.2 海洋生态环境中的微生物 | 第14-15页 |
| 1.1.3 细菌细胞壁中的肽聚糖 | 第15-17页 |
| 1.1.4 海洋环境中的D型丙氨酸 | 第17-18页 |
| 1.1.5 海洋环境中的二氨基庚二酸 | 第18-19页 |
| 1.2 立题依据和研究内容 | 第19-22页 |
| 1.2.1 立题依据 | 第19-21页 |
| 1.2.1.1 Pseudoalteromonas sp. CF6-2能降解革兰氏阳性菌肽聚糖释放D-Ala | 第19-20页 |
| 1.2.1.2 海洋中细菌利用二氨基庚二酸的研究进展 | 第20-21页 |
| 1.2.2 研究内容 | 第21-22页 |
| 第二章 深海细菌Pseudoalteromonas sp. CF6-2利用D-Ala代谢通路中关键酶的体外功能验证与表征 | 第22-53页 |
| 2.1 引言 | 第22页 |
| 2.2 材料和方法 | 第22-33页 |
| 2.2.1 菌株与质粒 | 第22-23页 |
| 2.2.2 主要试剂与试剂盒 | 第23-24页 |
| 2.2.3 主要仪器与耗材 | 第24-25页 |
| 2.2.4 培养基的配制 | 第25-26页 |
| 2.2.5 菌株的培养与保藏 | 第26页 |
| 2.2.6 酶的异源表达与纯化 | 第26-28页 |
| 2.2.7 D-Ala连接酶酶活测定及性质分析 | 第28-29页 |
| 2.2.8 脱氢酶法测定Ala消旋酶D-Ala到L-Ala方向酶活 | 第29-30页 |
| 2.2.9 氧化酶法测定Ala消旋酶L-Ala到D-Ala方向酶活 | 第30-31页 |
| 2.2.10 CD法测定Ala消旋酶双方向的酶活 | 第31-33页 |
| 2.2.11 D-Ala氨基转移酶1756的酶活测定 | 第33页 |
| 2.3 结果 | 第33-49页 |
| 2.3.1 CF6-2以D-Ala为唯一氮源的生长情况 | 第33-35页 |
| 2.3.2 D-Ala连接酶0208、Ala消旋酶3059和D-Ala氨基转移酶1756的异源表达与分离纯化 | 第35-37页 |
| 2.3.3 D-Ala连接酶0208的酶活测定和性质分析 | 第37-40页 |
| 2.3.4 Ala消旋酶3059的酶活测定 | 第40-47页 |
| 2.3.4.1 脱氢酶法测定Ala消旋酶3059 D-Ala到L-Ala方向酶活 | 第40-41页 |
| 2.3.4.2 氧化酶法测定Ala消旋酶3059 L-Ala到D-Ala方向酶活 | 第41-43页 |
| 2.3.4.3 圆二色光谱法测定Ala消旋酶3059双方向的酶活 | 第43-47页 |
| 2.3.5 D-Ala氨基转移酶1756的酶活测定 | 第47-49页 |
| 2.4 讨论 | 第49-53页 |
| 第三章 西太平洋水样中利用二氨基庚二酸细菌的多样性分析及菌株筛选 | 第53-70页 |
| 3.1 引言 | 第53页 |
| 3.2 材料和方法 | 第53-55页 |
| 3.2.1 海水样品 | 第53-54页 |
| 3.2.2 培养基 | 第54页 |
| 3.2.3 主要试剂与试剂盒 | 第54页 |
| 3.2.4 主要仪器与耗材 | 第54页 |
| 3.2.5 菌株富集、多样性分析与筛选 | 第54-55页 |
| 3.3 结果 | 第55-68页 |
| 3.3.1 西太平洋水样中利用二氨基庚二酸菌株的富集与多样性分析 | 第55-65页 |
| 3.3.2 西太平洋水样中利用二氨基庚二酸菌株的分离和种属鉴定 | 第65-68页 |
| 3.4 讨论 | 第68-70页 |
| 第四章 西太平洋细菌利用二氨基庚二酸的代谢通路研究 | 第70-78页 |
| 4.1 引言 | 第70页 |
| 4.2 材料和方法 | 第70-71页 |
| 4.2.1 菌株与质粒 | 第70页 |
| 4.2.2 培养基 | 第70-71页 |
| 4.2.3 主要试剂与试剂盒 | 第71页 |
| 4.2.4 主要仪器与耗材 | 第71页 |
| 4.2.5 基因组测序与分析 | 第71页 |
| 4.3 结果 | 第71-76页 |
| 4.3.1 Microbacterium sp. A32-1利用DAP能力验证、基因组测序和代谢通路分析 | 第71-74页 |
| 4.3.2 Thalassospira sp.B30-1利用DAP能力验证、基因组测序和代谢通路分析 | 第74-76页 |
| 4.4 讨论 | 第76-78页 |
| 全文总结与展望 | 第78-80页 |
| 参考文献 | 第80-99页 |
| 致谢 | 第99-100页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第100页 |
